Контрольні запитання

1. В яких операціях полягає процесинг мРНК? Де й коли він здійснюється?

2. Опишіть загальну будову еукаріотичної мРНК.

3. Розкажіть про хімічну будову кепу. У чому полягає його функціональне значення?

4. Як і коли відбувається кепування 5′-кінця мРНК?

5. Опишіть послідовність етапів сплайсингу. Що таке точка розгалуження?

6. Дайте визначення сплайсосоми. З яких елементів вона складається, де й коли формується? Опишіть основні етапи її утворення.

7. Як здійснюється каталіз хімічних реакцій сплайсингу? Що таке рибозим?

8. З якою метою при збиранні та роботі сплайсосоми використовується енергія гідролізу АТР?

9. Як відбувається термінація транскрипції РНК-полімеразою ІІ?

10. Охарактеризуйте основні механізми альтернативного сплайсингу.

Рекомендована література

1. Colgan, D.F., Manley, J.L. Mechanism and regulation of mRNApolyadenylation // Genes Dev. – 1997. – Vol. 11. – P. 2755–2766.

2. The ENCODE Project Consortium. Identification and analysis offunctional elements in 1 % of the human genome by the ENCODE pilotproject // Nature. – 2007. – Vol. 447. – P. 799–816.

3. Gerstein, M.B., Bruce, C., Rozowsky, J.S. et al. What is a gene, post ENCODE? History and updated definition // Genome Res. – 2007. – Vol. 17. – P. 669–681.

4. In the RNA world / eds. R.F. Gesteland, J.F. Atkins. – Cold SpringHarbor ; New York : CPHL Press,1993.

5. Jurica, M.S., Moore, M.J. PremRNA splicing: awash in a sea of proteins// Mol. Cell. – 2004. – Vol. 12. – P. 5–14.

6. Matlin, A.J., Clark, F., Smith, C.W.J. Understanding alternative splicing: towards a cellular code // Nature Rev. – 2005. – Vol. 6. – P. 386–398.

7. Palancade, B., Bensaude, O. Investigating RNA polymerase II carboxylterminal domain (CTD) phosphorylation // Eur. J. Biochem. – 2003. – Vol. 270. – P. 3859–3870.

8. Sims, R.J., Belotserkovskaya, R., Reinberg, D. Elongation by RNA-polymerase II: the short and long of it // Genes Dev. – 2004. – Vol. 18. – P. 2437–2468.

9. Staley, J.P., Guthrie, C. Mechanical devices of the spliceosome: motors,clocks, springs, and things // Cell. – 1998. – Vol. 92. – P. 315–326.

10. Stuart, K., Panigrahi, A.K. RNA editing: complexity and complications// Mol. Microbiology. – 2002. – Vol. 45. – P. 591–596.

11. Zorio, D.A.R., Bentley, D.L. The link between mRNA processing andtranscription: communication works both ways // Exp. Cell Res. – 2004. – Vol. 296. – Р. 91–97.