Molecular Switches
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Slow binding
+
N |
H
N
Lys
Con. A
O
OH (4b)
O2N |
300 nm < λ < 400 nm |
λ > 475 nm |
|
|
A)
S
S
N N
H H
Fast binding
HO
O |
OH |
OH |
OH |
|
O
H
N
Lys
Con. A
N
O O
(4a)
NO2
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HO |
Con. A |
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S |
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N |
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N |
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Fe(CN)63– |
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H |
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H |
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O2N |
Fe(CN)64–
e–
B)
ipc ( A)
4.2 |
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3.4 |
|
(c) |
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|
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2.6 |
|
(b) |
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1.8 |
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(a) |
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1 |
|
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0 |
70 |
140 |
210 |
280 |
time (s)
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M M |
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0 M
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CO2H |
CO2H |
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H |
O |
H |
O |
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H |
O |
H |
O |
H2N |
N |
N |
N |
OH |
H2N |
N |
N |
N |
OH |
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O |
CH2 H |
O |
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λ = 360 nm |
O |
CH2 H |
O |
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N N |
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λ > 430 nm |
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N N |
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(6a) |
(6b) |
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60 |
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I / 340 nm |
40 |
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20 |
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0 |
V |
U |
V |
U |
V |
U |
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||||
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M
M
M
M
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HO2C |
N |
(7) |
O |
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Lys-NH2 |
N |
Lys-NH-C |
|
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N |
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Papain |
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Papain |
+ |
N |
(8) |
N |
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N |
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HO2C |
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N |
(9) |
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N |
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|
CO2H |
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|
|
O |
|
|
O |
|
|
Lys-NH-C |
N |
λ = 320 nm |
Lys-NH-C |
N |
Papain |
|
N |
Papain |
N |
|
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λ > 400 nm |
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(10a) |
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(10b) |
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H3N+ |
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H O |
NO2 |
H2O |
H3N+ |
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H |
+ |
H2N |
NO2 |
HN |
N (CH2)3 C C HN |
|
HN |
N (CH2)3 C CO2H |
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H |
NH |
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H |
NH |
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C O |
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|
C O |
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(11)
F V F V
(A)
[para-nitro aniline] x105 (M)
(B)
[para-nitro aniline] x105 (M)
6 |
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5 |
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4 |
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3 |
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>400 nm |
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2 |
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320 nm |
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1 |
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0 |
10 |
20 |
30 |
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time (min) |
|
6 |
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5 |
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320 nm |
|
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4 |
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|
3 |
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2 |
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>400 nm |
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1 |
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0 |
10 |
20 |
30 |
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|
time (min) |
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M
F V
Ala1 |
Leu2 |
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Trp3 |
Gln4 |
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121 bases |
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Cys124 |
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H |
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OH |
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HN |
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MeAcm HCl NH2 |
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NH2 |
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H |
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OH |
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Edman |
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Amd |
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Amd |
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H |
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OH |
||
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Edman |
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Amd |
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|
Amd |
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H |
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OH |
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Edman |
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Amd |
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|
Amd |
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|
Leu |
Xaa |
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Boc |
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OSu |
H |
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OH |
H |
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OH |
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R |
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Amd |
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|
Amd |
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Boc |
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OH |
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R |
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Ala |
TFA |
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Boc |
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OSu |
H |
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OH |
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Boc |
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R |
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R = |
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N N |
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OH |
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DCC |
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R |
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Boc |
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HOSu |
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OSu |
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Boc |
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OH |
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R |
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Amd |
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Amd |
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TFA |
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H |
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Xaa |
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Amd |
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Amd |
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R |
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|||||||||||||||
M
P M