Fish может применяться для различных целей с использованием зондов трех различных типов:

- локус-специфичные зонды, связывающиеся с определенными участками хромосом. Данные зонды используются для идентификации имеющейся короткой последовательности выделенной ДНК, которая используется для приготовления меченого зонда и его последующей гибридизации с набором хромосом

- альфоидные или центромерные зонды-повторы представляют собой повторяющиеся последовательности центромерных областей хромосом. С их помощью каждая хромосома может быть окрашена в различный цвет, что позволяет быстро определить число хромосом и отклонения от нормального их числа

- зонды на всю хромосому являются набором небольших зондов, комплементарных к отдельным участкам хромосомы, но в целом покрывающими всю ее длину. Используя библиотеку таких зондов можно "раскрасить" всю хромосому и получить дифференциальный спектральный кариотип индивида. Данный тип анализа применяется для анализа хромосомных аберраций, например, транслокаций, когда кусочек одной хромосомы переносится на плечо другой

Где используют fish метод?

Метод FISH имеет различные области применения. Так, он активно используется для преимплантационной генетической диагностики, для пренатальной и постнатальной диагностики.

В преимплантационной генетической диагностике он используется для генетического скрининга, или же определения анеуплоидий хромосом 13, 15, 16, 17, 18, 21, 22, Х, У, а также для генетической диагностики - это исследование дериватных хромосом у носителей хромосомных перестроек (хромосом, возникших в результате перестроек, затрагивающих несколько хромосом).

В пренатальной диагностике используется для скрининга основных анеуплоидий некультивированных клеток амниотической жидкости и для уточнения/верификации результатов стандартного цитогенетического исследования.

Гораздо большее распространение метод получил в постнатальной диагностике. Здесь он используется для:

• Уточнения/верификации результатов стандартного цитогенетического исследования

• Исследования сложных перестроек – тройных и более сложных транслокаций, инсерций

• Определения степени мозаицизма

• Исследования природы маркерных хромосом

• Исследования хромосомных перестроек в онкогематологии

• Диагностики солидных опухолей (аномальное тканевое образование, которое обычно не содержит кисты или области с физиологическими жидкостями)

• Скрининга анеуплоидий сперматозоидов

Какие варианты исследований методом fish бывают?

Метафазный метод FISH позволяет идентифицировать крупные хромосомные аномалии, включая делеции, дупликации и транслокации, а также более мелкие хромосомные микроделеции и дупликации. Для метафазной FISH клетки останавливаются в митозе, затем их фиксируют смесью уксусной кислоты и метанола, а затем «капают» на предметное стекло микроскопа, где они прикрепляются.

Интерфазная FISH на препаратах культивированных и некультивированных клеток. Метод помогает идентифицировать хромосомные аномалии при различных заболеваниях.

24-цветная флюоресцентная гибридизация (multiplex-FISH). Позволяет с большей точностью выявить хромосомы, вовлечённые в перестройки, описать случаи со сложными кариотипами (более одной хромосомной аномалии), определить маркерные хромосомы.

FISH с применением пробы многоцветного бэндинга (MCB) для каждой пары хромосом. Метод помогает с высокой точностью определить точки разрыва перестроенных хромосом, внутрихромосомные аномалии (делеции, инверсии, инсерции) и гены-кандидаты, участвующие в аномалии.