6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Лабораторная_диагностика_туберкулеза_Ерохин_В_В_ред_

РАБОЧАЯ ТЕТРАДЬ СЛУШАТЕЛЯ

12. Лекция: «Изучение лекарственной чувствительности на автоматизированных и полуавтоматизированных системах» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• Изучение протокола постановки тестов лекарственной чувствительности

13. Лекция: «Структура и функции микробиологических лабораторий противотуберкулезных учреждений» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Определение задач и функций бактериологических лабораторий I–IV уровня

•Взаимодействие бактериологических лабораторий разных уровней.

14.Лекция: «Особенности инфекционного контроля в лабораториях противотуберкулезных учреждений и КДЛ учреждений ПМСП»

– 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Административные меры инфекционного контроля (ИК)

•Инженерно-технические меры ИК

•Средства индивидуальной защиты

15.Лекция: «Комплексные технические меры обеспечения биологической безопасности воздушной среды в лабораториях»

– 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Определение возможных технических мер контроля воздушной среды, выбор приоритетов

•Приточно-вытяжная вентиляция, специальное оборудование фильтрации и инактивации микроорганизмов, бактерицидное оборудование и пр.

•Контроль эффективности работы специального оборудования;

•Правила лабораторной гигиены.

16.Лекция: «Введение. Актуальность использования молекулярногенетических методов исследования во фтизиатрии» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Особенности эпидемиологических показателей по туберкулезу в РФ на современном этапе, проблема повышения выявления ЛУ МБТ

•Сокращение сроков микробиологической диагностики туберкулеза

•Совершенствование идентификации микобактерий до вида и штамма.

17. Лекция: «Геномная организация микобактерий туберкулезного комплекса» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Структура генома микобактерий туберкулеза

•Классификация генов

•Основные пути метаболизма

18.Лекция: «Особенности генетики НТМБ» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Общие сведения о геноме НТМБ

•Вставочные последовательности

•Плазмиды НТМБ

•Видоспецифические различия в геноме НТМБ

19. Лекция: «Мишени в геноме микобактерий, применяемые для кластерного анализа» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Вставочные последовательности

•Повторяющиеся последовательности

•Спейсорные последовательности в DR-локусе

•Однонуклеотидные мутации

20. Лекция: «Глобальные филогенетические группы микобактерий туберкулезного комплекса» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• Представление о филогении микобактерий туберкулезного комплекса

• Три принципиальные генетические группы МБТ

• Основные линии МБТ

21. Лекция: «Молекулярная эпидемиология туберкулеза в России»

– 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Кластерный анализ популяции МБТ, циркулирующей в регионах РФ с использованием сполиготипирования

•Кластерный анализ по ПДРФ IS6110

•Генотипирование МБТ, выделенных на территории РФ, методом VNTR и MIRU-VNTR

22.Лекция: «Основные мишени в геноме микобактерий, лежащие в основе молекулярной диагностики» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Критерии выбора мишени для ПЦР-диагностики

•Основные гены – мишени для ПЦР-диагностики МБТ

Раздел 2. ЛЕКЦИОННЫЕ МАТЕРИАЛЫ

РАБОЧАЯ ТЕТРАДЬ СЛУШАТЕЛЯ

•Гены-мишени для ПЦР-диагностики основных клинически значимых видов НТМБ.

23. Лекция: «Эффективность использования ПЦР для диагностики туберкулеза в клинике» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• Сравнение результатов ПЦР-диагностики с традиционными методами выявления микобактерий.

• Место ПЦР-анализа в лабораторной диагностике туберкулеза

24. Лекция: «Основные мишени и методы, позволяющие дифференцировать МБТК от НТМБ» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• Основные методы идентификации НТМБ.

• Мишени в геноме микобактерий туберкулезного комплекса и НТМБ, использующиеся для дифференциации НТМБ от микобактерий туберкулезного комплекса.

25. Лекция: «Значение молекулярно-генетической идентификации микобактерий для фтизиатрической клиники» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• НТМБ как «маска» ШЛУ ТБ

• Частота выявления НТМБ в клинике с использованием моле- кулярно-генетических методов

26. Лекция: «Гены микобактерий, ответственные за устойчивость к ПТП» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

• Гены, ответственные за устойчивость к ПТП первого ряда

• Гены, ответственные за устойчивость к некоторым ПТП второго ряда

• Механизмы возникновения лекарственной устойчивости к основным препаратам

27. Лекция: «Молекулярно-генетические методы определения ЛУ МБТ» – 1 час

Основные вопросы, освещаемые в лекции:

•Секвенирование генов МБТ, ответственных за устойчивость к ПТП

•Биочиповая технология

•ДНК-стриповая технология

•Аллель-специфическая ПЦР

ций. Книга II. Под ред. Лабинской А.С., Костюковой Н.Н., Ивановой С.М. – М.: Издательство БИНОМ, 2010. – 1152 с.

6.Туберкулез. Патогенез, защита, контроль: пер. с англ./под ред. Барри Р. Блума.– М.: Медицина, 2002.– 696 с.

7.Emerging Infections 5. Ed. by W.M. Scheld, W.A. Craig, J.M. Hughes/ ASM Press, Washington, 2001. – chp9. – P. 137–152.

8.Laboratory services in tuberculosis control. Part I: Organization and management. – 1998. – 64 pp.

9.Laboratory services in tuberculosis control. Part II: Microscopy. – 1998. – 62 pp.

10.Laboratory services in tuberculosis control. Part III: Culture. – 1998.

– 96 pp.

11.Lung biology in Health and Disease. v.219. Reichman ahd Hershfield’ Tuberculosis. A comprehensive, International Approach. Third Edition. Informa Healthcare USA.– 2006.– P. 715.

Модуль 2. Микроскопические методы диагностики кислотоустойчивых микобактерий

Тема 2.2. «Обеспечение качества микроскопических исследований»

Количество аудиторных часов – 1 Вопросы, прорабатываемые на семинаре:

•понятие о внутреннем контроле качества микроскопических исследований;

•механизм реализации внутреннего контроля качества;

•внешний региональный контроль и федеральная оценка качества;

•механизмы реализации внешнего регионального контроля и

федеральной оценки качества Цель семинара – формирование у слушателей представлений о

требованиях к качеству микроскопических исследований и способов достижения достоверных результатов исследований.

На семинаре преподавателем будут разобраны ключевые понятия и дефиниции по теме семинара.

Рекомендуемая литература

1.Малахов В.Н., Голышевская В.И., Заикин В.В., Попов С.А., Дорожкова И.Р., Евгущенко Г.В., Пузанов В.А., Шульгина М.В. Проект нормативного документа "Внешний и внутрилабораторный контроль качества микроскопического выявления кислотоустойчивых микобактерий в мокроте" // Пульмонология,

Раздел 3. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ

РАБОЧАЯ ТЕТРАДЬ СЛУШАТЕЛЯ

2004. Supplement, Abstract book, 3-rd Congress of European region IUATLD, 1531, p.405.

2.Малахов В.Н., Заикин В.В., Евгущенко Г.В., Пузанов В.А., Хайдукова И.Л. Оценка качества микроскопии с окраской по Цилю-Нельсену в 283 лабораториях России (по данным первого цикла ФСВОК). // Материалы VIII Всероссийского съезда эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. – М., 2002. – Том 3. – С. 195.

3.Попов С.А., Пузанов В.А., Сабгайда Т.П. Пути оптимизации лабораторной диагностики туберкулеза. // Справочник заведующего КДЛ. – 2008. – №12. – С. 17–28.

4.Laboratory services in tuberculosis control. Part I: Organization and management. – 1998. – 64 pp.

5.Laboratory services in tuberculosis control. Part II: Microscopy. – 1998. – 62 pp.

6.Puzanov V., Golyshevskaya V., Popov S., Danilova I., Kluge H., Jakubowiak W. External quality assessment programs of bacteriological diagnosis of TB in Russia: challenges and adjustments, introduction and development// Пульмонология, 2004. Supplement, Abstract book, 3-rd Congress of European region IUATLD. – Vol. 267.

– P. 73.

7.Puzanov V.A., Punga V.V., Katulina N.I., Danilova I.D., Kluge H. Detection of pulmonary TB patients by Ziehl-Neelsen microscopy at clinical diagnostic laboratories in the pilot regions of Russia // Pneumologia. – 2002 – Vol. 11. – № 2. – P. 126–127.

Тема 2.4. «Учет и отчетность при проведении микроскопических исследований»

Количество аудиторных часов – 1 Вопросы, прорабатываемые на семинаре:

•Учет и отчетность для КДЛ ПМСП

•Учет и отчетность для лабораторий ПТУ.

Цель семинара – дать представление об официальных формах учета и отчетности лабораторий для микроскопических исследований при диагностике туберкулеза.

При планировании семинара необходимо учесть целевую аудиторию (сотрудники КДЛ ПМСП или лабораторий ПТУ). Конкретные вопросы, прорабатываемые на семинаре в деталях зависят от уровня подготовки слушателей.

Рекомендуемая литература

1.Попов С.А., Пузанов В.А., Сабгайда Т.П. и соавт. Основные проблемы региональных бактериологических лабораторий противотуберкулезных учреждений // Проблемы туберкулеза и болезней легких. – 2008. – №5. – С. 29–35.

2.Приказ МЗ РФ от 21.03.2003г. №109 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации», Приложение 11.

3.Приказ МЗСР РФ от 29.12.2010 г. №1224н «Об утверждении Порядка оказания медицинской помощи больным туберкулезом в Российской Федерации».

4.Пузанов В., Катулина Н., Гуськов П. и соавт. Факторы, определяющие эффективность верификации туберкулеза лабораторными методами в учреждениях общей лечебной сети // Материалы научной сессии, посвященной 85-летию ЦНИИТ РАМН «Актуальные проблемы туберкулеза и болезней легких». – 2006.

– С. 63–64.

5.Пузанов В., Полоцкий В., Кульпина Т. и соавт. Качество диагностического материала как маркер адекватности преаналитического этапа // Пульмонология. Сб.тезисов, 15й нац. конгресс по болезням органов дыхания. – 2005. – т. 689. – С. 189.

6.Санитарно-эпидемиологические правила «Безопасность работы с микроорганизмами III–IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней» (СП1.3.2322-08).

7.Федеральные санитарные правила, нормы и гигиенические нормативы «Порядок учета, хранения, передачи и транспортирования микроорганизмов I–IV групп патогенности» (СП 1.2.036–1995).

8.Фтизиатрия. Национальное руководство. Под ред. М.И. Перельмана. – М., 2007.

9.Kantor I.N., Kim S.J., Frieden T. et al. Laboratory Services in Tuberculosis Control. Parts I–II. – 1998. – Switzerland, Geneva,

WHO.

10.Kent P.T., Kubica G.P. Public Health Mycobacteriology. A Guide for the Level III Laboratory. Centers for Disease Control,1985. – 207 pp.

11.Laboratory services in tuberculosis control. Part I: Organization and management. – 1998. – 64 pp.

12.Laboratory services in tuberculosis control. Part III: Culture. – 1998.

– 96 pp.

13.The Public Health Service National Tuberculosis Reference Laboratory and the National Laboratory Network. IUATLD,1998,110 pp.

Раздел 3. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ

7.Petersen K.F. Methods for internal quality control in the mycobacteriology laboratory // Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg. – 1983. – Vol. 255. – P. 503–510.

8.Puzanov V., Golyshevskaya V., Popov S., Danilova I., Kluge H., Jakubowiak W. External quality assessment programs of bacteriological diagnosis of TB in Russia: challenges and adjustments, introduction and development// Пульмонология, 2004. Supplement, Abstract book, 3-rd Congress of European region IUATLD. – Vol. 267.

– P. 73.

9.Rieder H L, Van Deun A, Kam K M, et al. Priorities for tuberculosis bacteriology services in low income countries. 2nd ed. Paris, France: International Union Against Tuberculosis and Lung Disease, 2007.

10.Shinnick T M, Iademarco M F, Ridderhof J C. National plan for reliable tuberculosis laboratory services using a systems approach. Recommendations from CDC and the Association of Public Health Laboratories Task Force on Tuberculosis Laboratory Services // MMWR Recomm Rep. – 2005. – Vol. 54. – P. 1–12.

11.Tenover F.C., Crawford J.T., Huebner R.E., Geiter L.J., Horsburgh C.R. Jr, Good R.C. The resurgence of tuberculosis: is your laboratory ready? // J Clin Microbiol. – 1993. – Vol. 31. – P. 767–770.

12.The Public Health Service National Tuberculosis Reference Laboratory and the National Laboratory Network. IUATLD. – 1998. – 110 pp.

13.World Health Organization Stop TB Department. Seventh meeting. Strategic and Technical Advisory Group for Tuberculosis (STAG-TB) report on conclusions and recommendations 2007. Geneva, Switzerland: WHO, 2007.

14.World Health Organization. Laboratory services in tuberculosis control. Culture. Part III. Geneva, Switzerland: WHO, 1998: 85 pp.

15.Попов С.А., Пузанов В.А., Сабгайда Т.П. Пути оптимизации лабораторной диагностики туберкулеза. // Справочник заведующего КДЛ. – 2008. – №12. – С. 17–28.

Тема 3.5. «Учет и отчетность при проведении культуральных исследований»

Количество аудиторных часов – 1 Вопросы, прорабатываемые на семинаре:

• Учет и отчетность для лабораторий ПТУ.

Цель семинара – дать представление об официальных формах учета и отчетности лабораторий для культуральных исследований при диагностике туберкулеза.

Раздел 3. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ