Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Скачиваний:
8
Добавлен:
03.02.2024
Размер:
24.15 Mб
Скачать

Т И М И Н О Л Е Г А Л Е К С Е Е В И Ч

Лекции по общей биохимии

ДЛЯ СТУДЕНТОВ МЕДИЦИ НСКИХ ВУЗОВ

2 0 2 0

О Г Л А В Л Е Н И Е

 

АМИНОКИСЛОТЫ И БЕЛКИ ...........................................................................................................

4

Классификация аминокислот...................................................................................................

4

Аминокислоты как лекарственные препараты........................................................................

8

Физико-химические свойства аминокислот ............................................................................

9

Строение и свойства пептидной связи ..................................................................................

10

Функции белков......................................................................................................................

11

Уровни организации белковой структуры ............................................................................

12

Физико-химические свойства белков ....................................................................................

17

Классификация белков ...........................................................................................................

19

ВИТАМИНЫ..................................................................................................................................

31

Жирорастворимые витамины.................................................................................................

33

Водорастворимые витамины..................................................................................................

41

ФЕРМЕНТЫ ..................................................................................................................................

55

Строение ферментов...............................................................................................................

57

Принципы количественного определения активности ферментов ......................................

60

Свойства ферментов...............................................................................................................

60

Регуляция активности ферментов in vivo ..............................................................................

64

Ингибирование ферментов ....................................................................................................

67

Энзимопатологии ...................................................................................................................

70

Использование ферментов и их ингибиторов в медицине....................................................

70

Классификация ферментов ....................................................................................................

72

Номенклатура ферментов.......................................................................................................

73

ОБЩИЕ ПУТИ БИОЛОГИЧЕСКОГО ОКИСЛЕНИЯ ..........................................................................

81

Основные источники энергии в клетке .................................................................................

83

Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты ......................................

84

Цикл трикарбоновых кислот..................................................................................................

86

Окислительное фосфорилирование .......................................................................................

89

Разобщители ...........................................................................................................................

93

Ингибиторы ферментов дыхательной цепи ..........................................................................

94

Коэффициент Р/О ...................................................................................................................

95

Гипоэнергетические состояния..............................................................................................

95

Использование АТФ и его предшественников в медицине..................................................

96

ОБМЕН АМИНОКИСЛОТ И БЕЛКОВ ..............................................................................................

97

Азотистый баланс...................................................................................................................

97

Внешний обмен аминокислот и белков.................................................................................

98

Транспорт аминокислот через мембраны............................................................................

103

Нарушение процессов переваривания белков .....................................................................

105

Детоксикационные системы печени ....................................................................................

107

Внутриклеточный обмен аминокислот................................................................................

108

ОБРАЗОВАНИЕ И УБОРКА АММИАКА .........................................................................................

123

Основные источники аммиака в организме ........................................................................

123

Связывание аммиака ............................................................................................................

123

Транспорт аммиака...............................................................................................................

124

Удаление аммиака из организма..........................................................................................

125

Гипераммониемии ................................................................................................................

127

Гипотезы токсичности аммиака...........................................................................................

128

ОБМЕН ОТДЕЛЬНЫХ АМИНОКИСЛОТ........................................................................................

129

Пути использования глутаминовой и аспарагиновой кислот.............................................

129

Пути использования цистеина .............................................................................................

129

Пути использования глицина и серина................................................................................

131

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

2

Взаимосвязь обмена глицина, серина, цистеина и метионина ...........................................

132

Обмен фенилаланина и тирозина.........................................................................................

133

Катаболизм аминокислот с разветвленной цепью ..............................................................

141

Обмен триптофана................................................................................................................

 

142

Обмен аргинина....................................................................................................................

 

143

СТРОЕНИЕ И ОБМЕН НУКЛЕОТИДОВ.........................................................................................

146

Внешний обмен нуклеопротеинов.......................................................................................

146

Пуриновые нуклеотиды .......................................................................................................

 

147

Нарушение обмена пуриновых оснований..........................................................................

153

Пиримидиновые нуклеотиды...............................................................................................

155

Синтез дезоксирибонуклеотидов.........................................................................................

157

Нарушение обмена пиримидиновых оснований .................................................................

161

Нуклеозиды и нуклеотиды как лекарственные препараты .................................................

161

МАТРИЧНЫЕ БИОСИНТЕЗЫ.......................................................................................................

 

162

Строение нуклеиновых кислот ............................................................................................

162

Синтез нуклеиновых кислот ................................................................................................

166

Синтез белка – трансляция...................................................................................................

176

Генотипическая гетерогенность ..........................................................................................

181

СТРОЕНИЕ И ОБМЕН УГЛЕВОДОВ ..............................................................................................

182

Функции углеводов ..............................................................................................................

 

182

Классификация .....................................................................................................................

 

182

Использование углеводов в биологии и медицине .............................................................

187

Внешний обмен углеводов...................................................................................................

187

Переваривание углеводов у детей .......................................................................................

188

Перенос глюкозы через мембраны ......................................................................................

189

Реакции взаимопревращения сахаров .................................................................................

190

Судьба и источники глюкозы в клетке ................................................................................

193

Метаболизм гликогена .........................................................................................................

 

195

Гликогеновые болезни .........................................................................................................

 

200

Окисление глюкозы..............................................................................................................

 

202

Глюконеогенез......................................................................................................................

 

209

Метаболизм этанола.............................................................................................................

 

215

Пентозофосфатный путь окисления глюкозы .....................................................................

217

Регуляция концентрации глюкозы в крови .........................................................................

221

СТРОЕНИЕ И ОБМЕН ЛИПИДОВ .................................................................................................

223

Классификация липидов

......................................................................................................

223

Функции липидов .................................................................................................................

 

223

Строение липидов ................................................................................................................

 

225

Внешний обмен липидов......................................................................................................

232

Свойства, состав и функции желчи .....................................................................................

234

Переваривание липидов у детей ..........................................................................................

237

Нарушение переваривания липидов ....................................................................................

237

Всасывание липидов ............................................................................................................

 

238

Формы транспорта липидов в крови....................................................................................

240

Транспорт триацилглицеролов ............................................................................................

240

Промежуточный обмен липидов .........................................................................................

243

Кетоновые тела.....................................................................................................................

 

250

Запасание жиров...................................................................................................................

 

252

Синтез триацилглицеролов и фосфолипидов......................................................................

256

Нарушения обмена триацилглицеролов ..............................................................................

261

Обмен холестерола...............................................................................................................

 

262

Транспорт холестерола и его эфиров...................................................................................

264

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2018г)

3

Нарушения обмена холестерола ..........................................................................................

267

Нарушения транспорта липидов ..........................................................................................

269

Липидозы ..............................................................................................................................

 

271

ГОРМОНЫ ..................................................................................................................................

 

272

Классификация гормонов.....................................................................................................

272

Механизмы действия гормонов ...........................................................................................

273

Иерархия и принципы регуляции гормональных систем ...................................................

277

Гормоны гипоталамуса ........................................................................................................

 

278

Гормоны гипофиза ...............................................................................................................

 

278

Гормоны, регулирующие обмен кальция и фосфора ..........................................................

282

Гормоны тиреоидной функции ............................................................................................

284

Гормоны периферических желез .........................................................................................

288

Группа гормонов репродуктивной системы........................................................................

297

Гормоны гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы ........................................

304

АЗОТСОДЕРЖАЩИЕ ВЕЩЕСТВА КРОВИ.....................................................................................

308

Белки крови...........................................................................................................................

 

308

Индивидуальные белки плазмы крови ................................................................................

311

Ферменты крови ...................................................................................................................

 

314

Остаточный азот крови ........................................................................................................

 

315

ОБМЕН ЖЕЛЕЗА .........................................................................................................................

 

317

Метаболизм железа ..............................................................................................................

 

317

Регуляция обмена железа .....................................................................................................

319

Нарушение обмена железа ...................................................................................................

321

ГЕМОПРОТЕИНЫ. ОБМЕН ГЕМА ...............................................................................................

323

Строение и синтез гема ........................................................................................................

 

323

Миоглобин ............................................................................................................................

 

325

Гемоглобин ...........................................................................................................................

 

326

Дыхательная функция крови................................................................................................

330

Катаболизм гема ...................................................................................................................

 

331

Нарушения обмена билирубина...........................................................................................

333

КИСЛОТНО-ОСНОВНОЕ СОСТОЯНИЕ ........................................................................................

338

Роль ионов водорода ............................................................................................................

 

338

Основные показатели КОС ..................................................................................................

338

Компенсация изменений концентрации ионов водорода в плазме крови..........................

342

Виды нарушений кислотно-основного состояния и их компенсация ................................

347

ВОДНЫЙ БАЛАНС.......................................................................................................................

 

351

БИОХИМИЯ ПЕЧЕНИ ..................................................................................................................

 

353

Функции печени ...................................................................................................................

 

354

АМ И НОК ИС ЛОТЫ И БЕЛКИ

Аминокислоты по строению они являются органическими карбоновыми кислотами, у которых, как минимум, один атом водорода замещен на аминогруппу. Таким образом, в аминокислотах обязательно присутствует карбоксильная группа (СООН), аминогруппа (NH2), асимметричный атом углерода и боковая цепь (радикал R). Строением боковой цепи аминокислоты и отличаются друг от друга. Именно радикал придает аминокислотам большое разнообразие строения и свойств.

Аминокислоты являются строительными блоками белковых молекул, но необходимость их изучения кроется не только в данной функции. Несколько аминокислот являются источником для образования нейромедиаторов в ЦНС (гистамин, серотонин, гамма-аминомасляная кислота, дофамин, норадреналин), другие сами являются нейромедиаторами (глицин, глутаминовая кислота).

Те или иные аминокислоты необходимы для синтеза пуриновых и пиримидиновых оснований без которых нет нуклеиновых кислот, используются для синтеза низкомолекулярных биологически важных соединений (креатин, карнитин, карнозин, ансерин и др.).

Аминокислота тирозин целиком входит в состав гормонов щитовидной железы (тироксин, трийодтиронин) и мозгового вещества надпочечников (адреналин, норадреналин).

С нарушением обмена аминокислот связан ряд наследственных и приобретенных заболеваний, сопровождающихся серьезными проблемами в развитии организма (цистиноз, гомоцистеинемия, лейциноз, тирозинемии и др). Самым известным примером является фенилкетонурия.

К Л АС С И Ф И К АЦ И Я АМ ИН ОК ИСЛО Т

Из-за разнообразного строения и свойств классификация аминокислот может быть различной, в зависимости от выбранного качества аминокислот. Аминокислоты делятся:

1.В зависимости от положения аминогруппы.

2.По абсолютной конфигурации молекулы.

3.По оптической активности.

4.По участию аминокислот в синтезе белков.

5.По строению бокового радикала.

6.По кислотно-основным свойствам.

7.По необходимости для организма.

Взависимости от положения аминогруппы

Выделяют и другие аминокислоты. Для организма млекопитающих наиболее характерны -аминокислоты.

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)

5

По абсолютной конфигурации молекулы

По абсолютной конфигурации молекулы выделяют D- и L-формы. Различия между изомерами связаны с взаимным расположением четырех замещающих групп, находящихся в вершинах воображаемого тетраэдра, центром которого является атом углерода в -положе- нии.

В белке любого организма содержится только один изомер, для млекопитающих это L-аминокислоты. Однако оптические изомеры претерпевают самопроизвольную неферментативную рацемизацию, т.е. L-форма переходит в D-форму.

По оптической активности

По оптической активности аминокислоты де-

лятся на право- и левовращающие.

Наличие ассиметричного атома углерода (хирального центра) делает возможным только два расположения химических групп вокруг него. Это приводит к особому отличию веществ друг от друга, а именно – изменению направления вращения плоскости поляризованного света, проходящего через раствор. В соответствии с углом пово-

рота выделяют правовращающие (+) и левовращающие (–) изомеры.

Деление на L- и D-формы не соответствует делению на право- и левовращающие. Для одних аминокислот L-формы (или D-формы) являются правовращающими, для других – левовращающими. Например, L-аланин – правовращающий, а L-фенилаланин – левовращающий. При смешивании L- и D-форм одной аминокислоты образуется рацемическая смесь, не обладающая оптической активностью.

По участию аминокислот в синтезе белков

Выделяют протеиногенные (20 АК) и непротеиногенные (около 40 АК). Все протеиногенные аминокислоты являются -аминокислотами.

На примере протеиногенных аминокислот можно показать дополнительные способы классификации:

oпо строению бокового радикала – неполярные (алифатические, ароматические) и полярные (незаряженные, отрицательно и положительно заряженные),

Аминокислоты и белки

6

 

 

oэлектрохимическая – по кислотно-основным свойствам подразделяют нейтральные (большинство), кислые (Асп, Глу) и основные (Лиз, Арг, Гис) аминокислоты,

oфизиологическая классификация – по необходимости для организма выделяют незаменимые (Лей, Иле, Вал, Фен, Три, Тре, Лиз, Мет) и заменимые. Две аминокислоты являются условно незаменимыми (Арг, Гис), т.е. их синтез происходит в недостаточном количестве.

По полярности молекулы

Кнеполярным относят аминокислоты, имеющие алифатические углеводородные цепи (аланин, валин, лейцин, изолейцин, метионин, пролин) и ароматические кольца (фенилаланин, триптофан, тирозин).

Кполярным незаряженным относятся аминокислоты, имеющие гидроксильные группы (серин, треонин, тирозин), амидные группы (аспарагин, глутамин), тиольную группу (цистеин) и глицин.

Аспарагиновая и глутаминовая аминокислоты имеют в радикале дополнительную карбоксильную группу, отрицательно заряжены и, соответственно, полярны. К аминокислотам с полярными положительно заряженными радикалами относятся лизин, аргинин, гистидин.

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)

7

 

 

 

 

Аминокислоты и белки

8

 

 

 

 

АМ ИНОК И СЛО ТЫ К АК ЛЕ К АР С ТВЕ ННЫ Е ПР Е П АР АТЫ

Метионин, незаменимая кислота, содержит мобильную метильную группу, которая может передаваться на другие соединения. Благодаря этому она участвует в синтезе холина, фосфолипидов, обмене витаминов В12 и фолиевой кислоты. В реакциях биосинтеза белка метионин является инициирующей аминокислотой. Он участвует в процессах обезвреживания токсинов в печени.

Метионин ("ациметион") и его активные производные (как вещество "адеметионин" в составе препарата "Гептрал") используют для профилактики и лечения различных заболеваний печени как липотропный фактор, препятствующий накоплению жира, при токсических поражениях печени, при атеросклерозе и в качестве антидепрессанта для улучшения синтеза нейромедиаторов.

Глутаминовая кислота – является предшественником -аминомасляной кислоты (ГАМК), являющейся тормозным медиатором нервной системы (препараты "Аминалон", "Пикамилон"). ГАМК также играет значительную роль в регуляции тонуса мозговых сосудов кровообращении головного мозга. Сам по себе глутамат является нейромедиаторной аминокислотой, стимулирующей передачу возбуждения в синапсах ЦНС. Кроме этого, глутамат участвует в обезвреживании аммиака, синтезе пуриновых и пиримидиновых оснований, играет ведущую роль в обмене других аминокислот. Потребность организма в глутаминовой кислоте выше всех остальных аминокислот.

Глицин является медиатором ЦНС тормозного действия. Улучшает метаболизм в тканях мозга. Оказывает успокаивающее действие. Нормализует сон, уменьшает повышенную раздражительность, депрессивные состояния.

Цистеин участвует в метаболизме хрусталика глаза. Зачастую нарушения хрусталика связаны с недостатком цистеина, поэтому цистеин применяют на начальных стадиях катаракты.

Комплексный препарат глутаминовой кислоты, цистеина и глицина "Вицеин" используют в виде глазных капель.

Гистидин – условно незаменимая аминокислота. Используется при лечении гепатитов, язв желудка и двенадцатиперстной кишки.

Церебролизин – гидролизат вещества мозга свиньи, содержащий низкомолекулярные пептиды (15%) и аминокислоты (85%). Используется при нарушениях функций ЦНС, мозговых травмах, кровоизлияниях, вегетативных дистониях и т.п.

Препараты для парентерального питания: полиамин (набор 13 аминокислот), вамин (набор 18 аминокислот), ваминолакт (набор 18 аминокислот, соответствующих составу грудного молока), гидролизин (гидролизат белков крови крупного рогатого скота), аминотроф (гидролизат казеина), аминосол (смесь 15 аминокислот), фибриносол (гидролизат фибрина крови).

biokhimija.ru

Тимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)

9

 

 

 

 

 

 

 

 

Ф И З И К О - Х И М И Ч Е С К И Е СВОЙС ТВ А АМ ИНОК И СЛО Т

1. Являются амфотерными электролитами. Аминокислоты сочетают в себе свойства

кислот и оснований. Соответственно, в водном растворе аминокислоты ведут себя как кислоты – доноры протонов и как основания – акцепторы протонов.

Если общий заряд аминокислоты равен 0, то это ее состояние называют изоэлектриче-

ским. Величина рН, при которой заряд аминокислоты равен 0, называется изоэлектрической точкой (ИЭТ, pI). Значение изоэлектрической точки зависит от строения радикала аминокислоты:

opI большинства аминокислот располагается в диапазоне рН от 5,5 (фенилаланин) до 6,3 (пролин),

o pI кислых аминокислот – рI глутамата 3,2, рI аспартата 2,8,

o pI основных аминокислот – pI гистидина 7,6, pI аргинина 10,8, pI лизина 9,7.

pI гистидина позволяет ему использоваться в гемоглобиновой буферной системе и в функции особых веществ миоцитов (карнозина, анзерина) в которых он содержится. Эти соединения легко принимают и легко отдают ионы водорода при малейших сдвигах рН среды (в норме 7,35-7,45).

2. Заряд аминокислот зависит от величины рН среды.

Отправным пунктом для понимания причин появления заряда у аминокислот является величина изоэлектрической точки (pI). Ситуация различается для нейтральных, кислых и основных аминокислот.