Индивидуальные геномы человека различаются

Геном человека содержит 3 млрд пар

оснований (п.о.) …G G T A A C T G…

полиморфизм

…G G C A A C T G...

В определенном положении генома у людей могут присутствовать альтернативные основания: это явление получило название однонуклеотидного полиморфизма

(Single Nucleotide Polymorphism, SNP). В таком случае,

говорят о существовании двух вариантов ДНК (аллелей): T и С.

Геном человека содержит ≈ 1 SNP на 1000 п.о.

Сосуществование в пределах популяции двух (содержащих SNP) или нескольких различных наследственных форм того или иного гена называется генетическим полиморфизмом.

Вариабельность генома человека

•Около 99,9% последовательностей ДНК генома человека одинаковы у всех людей.

•Отличия в 0.1% геномов объясняют индивидуальную восприимчивость человека к болезням, разную реакцию на лекарства или на факторы окружающей среды и др. фенотипы. Они включают:

-SNPs – в каждом геноме обнаруживается порядка 2.5 – 4 млн. Исследуют полногеномные наборы SNP.

-Повторы - вариабельность по числу копий (CNV), несколько сотен или тысяч

-Инсерции/делеции, несколько сотен тысяч.

•Геномы двух разных индивидов пересекаются примерно по половине SNP.

•Human Genome Variation Project. Вариабельность генома создает основу генетики популяций.

•HapMap Project (1, 2 и 3) – поиск вариаций в генах, связанных с заболеваниями и эффективностью лечения. Популяционная вариабельность генома.

Древо геномов индивидов из популяций проекта HapMap

CEU – популяция центральноевропейского происхождения; YRI – популяция йоруба (Нигерия);

CHB – популяция китайцев (Пекин);

JPT – популяция японцев (Токио)

Обозначены геномы Дж. Уотсона (Watson), К. Вентера (Venter)

и китайца (YH)

На долю межпопуляционных различий в глобальном масштабе (если сравнивать популяции разных континентов) приходится 10-15% генетического разнообразия человека

Другие проекты по вариабельности генома человека

•Проект «1000 геномов человека»

•Проект «Население Британских островов»

•Проект «Геном 1000 китайцев»

•Проект «Вариом человека»: совместить геномные технологии с медицинской генетикой, эстетической генетикой (гены красоты), генетикой социального поведения (гены агрессивности, политических пристрастий).

•70 SNPs долголетия. Геном 1 055 человек возраста >95 лет сравнивали с 1 267 человек контрольной группы (Science 2010).

•Проект «ДНК-метилом» - полный анализ статуса метилирования ДНК по каждому динуклеотиду CG (эпигенетика).

•Проект «Генография» - анализ особенностей разных этносов и попытка восстанавливать историю на этой основе (при участии РФ).