- •Векторные системы теория
- •1. Принципы и понятия технологии рекомбинантных молекул. Основные открытия молекулярной биологии, обосновавшие возможность конструирования рекомбинантных молекул.
- •2. Матричные процессы. Репликон и типы репликации днк. Стабильность наследования генетических структур.
- •3. Механизмы реализации генетической информации.
- •4. Молекулярное клонирование как способ исследования структурной организации генетических элементов и систем экспрессии чужеродной генетической информации.
- •5. Понятие вектора. Характеристика основных генетических элементов про- и эукариотических клеток, претендующих на роль векторов.
- •6. Общие свойства клонирующих векторов. Принципы клонирования днк in vivo и in vitro.
- •7. Рестрикционные нуклеазы и их характеристика.
- •8. Способы объединения фрагментов днк. Днк-лигазы. Днк-полимераза
- •12. Концевая трансфераза и ее применение при создании рекомбинантных молекул.
- •13. Векторные молекулы днк. Развитие представлений о векторных молекулах.
- •14. Введение молекул днк в клетки.
- •15. Требования к клеткам-хозяевам рекомбинантных молекул.
- •16. Структурно-генетическая организация полового фактора.
- •17. Плазмиды бактерий и их общие свойства.
- •18. Сегрегационная и структурная нестабильность плазмид.
- •19. Классификация плазмид.
- •20. Плазмиды бактериоциногенности и векторы на их основе.
- •21. Плазмиды лекарственной устойчивости бактерий.
- •22. Конструирование и структура «искусственных» векторов (плазмиды pRsf2124 и рМв9).
- •23. Принцип модульной организации плазмид.
- •24. Мигрирующие элементы и конструирование векторов для клонирования хромосомных генов бактерий in vivo.
- •25. Трансдуцирующие бактериофаги.
- •26. Организация генома бактериофага лямбда.
- •27. Общая и генерализованная трансдукция.
- •28. Характеристики pBr322, ее преимущества и недостатки.
- •29. Векторы на основе репликонов бактериальной плазмиды puc18, puc19.
- •30. Свойства бактериофага лямбда как универсальной системы для клонирования in vivo и in vitro.
- •31. Молекулярные векторы на основе генома бактериофага лямбда.
- •32. Космиды.
- •33. Фазмиды.
- •34. Искусственные хромосомы (рас, вас, yac)
- •35. Конструирование библиотек и клонотек.
- •36. Нитевидные фаги в качестве клонирующих векторов.
- •37. Конструкция и использование векторов на основе нитевидных фагов.
- •38. Векторы, предназначенные для изучения регуляции экспрессии генов.
- •39. Векторы для Bacillus.
- •40. Проблемы плазмидных векторов.
- •41. Челночные векторы.
- •42. Генетическая организация дрожжей.
- •43. Внехромосомные элементы сахаромицетов.
- •44. Введение днк в дрожжевые клетки.
- •45. Векторы для дрожжевых клеток. Требования к вектору.
- •46. Селективные маркеры дрожжей. Принципы клонирования.
- •47. Введение молекул днк в клетки млекопитающих.
- •48. Организация генома вируса sv40. Векторы на основе вируса sv40.
- •49. Основные проблемы при конструировании векторов млекопитающих.
- •50. Векторы для клонирования в растениях.
- •51. Молекулярная биология Ti-плазмиды Agrobacterium tumefaciens.
- •52. Структура т-днк. Использование Ti-плазмиды в качестве векторов для создания трансгенных растений.
- •53. Бинарные системы.
- •54. Вирусы как векторы для растений.
20. Плазмиды бактериоциногенности и векторы на их основе.
Ответ. Бактериоциногенные плазмиды (например, Col-плазмида у E. Coli содержат гены, ответственные за синтез бактериоцинов). Бактериоцины – антибиотические вещества белковой природы, синтезируемые бактериями и подавляющие рост и размножение близкородственных микроорганизмов, не лизирую последних. Синтез бактерицинов является для клетки-продуцента летальным, но потенциальные бактерии-продуценты, не продуцирующие их в данный момент, устойчивы к воздействию бактериоцинов. В отличии от других плазмид, факторы бактериоциногенности реже интегрируются в хромосому, редко элиминируются, многие не обладают конъюгативностью. Многие плазмиды, кодирующие образование бактериоцинов, также содержат набор генов, ответственных за конъюгацию и перенос плазмид. Подобные плазмиды относительно крупные (молекулярная масса 25–150*106D), их довольно часто выявляют у грамотрицательных палочек. ColE1 – вектор молекулярного клонирования размером 6.6 Кб. Плазмида имеет ослабленный контроль репликации: при обычных условиях роста в клетке имеется 20–30 копий. После обработки хлорамфениколом количество копий увеличивается до 1–3 тыс. При этом плазмидная ДНК составляет более половины всей ДНК клетки, что упрощает процедуру выделения и очистки плазмиды. В плазмиде имеется 1 сайт узнавания рестриктазой EcoRI. Плазмида обуславливает одновременно синтез в клетке колицина (содержит структурный ген колицина E1 cea) и иммунность к летальным дозам колицина. Колицин – это тип бактериоцина, который вырабатывается некоторыми штаммами Escherichia coli и токсичен для них. Колицины выбрасываются в окружающую среду, чтобы снизить конкуренцию со стороны других штаммов бактерий. Колицины связываются с рецепторами внешней мембраны, используя их для перемещения в цитоплазму или цитоплазматическую мембрану, где они проявляют свой цитотоксический эффект, включая деполяризацию цитоплазматической мембраны, активность ДНКазы, активность РНКазы или ингибирование синтеза муреина. Кроме этих трех генов, имеется еще ген, кодирующий белок Kil. Гены cea и kil образуют единый оперон. Белок Kil обуславливает высвобождение колицина E1 из бактерий в окружающую среду. При встройке экзогенных фрагментов ДНК по EcoRI-месту нарушается ген продукции колицина, но сохраняется ген иммунности к нему – это является основой для отбора трансформантов, содержащих гибридные плазмиды. Способ отбора таков: трансформантов высевают на среду, содержащую колицин E1; клетки, выросшие на такой среде, содержат либо исходную плазмиду ColE1, либо ее гибридные производные; в другой ЧП равномерно засевают E. coli, чувствительную к колицину E1 (Cols) – получают газон; колонии, устойчивые к колицину, перепечатывают единообразно на засеянную и незасеянную чашки; на чашках с газоном E. coli Cols вокруг напечатанных сверху колоний, продуцирующих колицин, наблюдается кольцевая прозрачная зона, где рост газона отсутствует – такие клоны содержат нативную плазмиду ColE1. Другие клоны (выросшие на незасеянной чашке) содержат гибридные варианты ColE1, у которых в результате встройки чужДНК ген продукции колицина поврежден. Недостаток такой фенотипической селекции в том, что бактериальные клетки могут приобретать устойчивость к колицину путем спонтанных мутаций.