Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Нелинейная физика ДНК..pdf
Скачиваний:
9
Добавлен:
15.11.2022
Размер:
16.39 Mб
Скачать

5.3.3.3. Линейное приближение

Решение уравнений (5.41) может быть легко получено в линейном приближении. В этом случае сами уравнения принимают вид

1 т

= К\Ра2<р1яя - КН2 (*>! -

рз) = 0;

(5.55)

1 т

= К ^ а 2¥з„ - к ь12 (<р2 -

щ ) = 0,

 

а их решения имеют вид плоских волн

 

 

 

 

Ч>\ - ¥oi exp [г (qz -

го*)];

(5.56)

 

¥2 = ¥02 exp [г (qz -

utf)]

 

 

 

 

Подставляя (5.56) в (5.55), найдем закон дисперсии

 

(Qi - h w 2) (Q2 - I2w2) -

K b*l4 = 0,

(5.57)

где Qi = K b2a2l2q2 + К Ь12 (г = 1,2); q — волновой вектор; w — частота, ¥oi и ¥02 амплитуды. Из формулы (5.57) найдем значения квадрата частот w2

wl 2 ( q ) = \ll Q 2 + h Q l+ [ ( h Q 2 - h Q l) 2 ± U l I 2K b\ 2l4^ /2} / 2 h I 2.

 

 

 

(5.58)

В «симметричном» случае, когда I\ = I2 = /, К[ =

= К г>

квадраты частот равны

 

 

w\ =

K ba2l2q2/1\ w\ =

{Кьа212Ч2 + 2K bl2) /I.

(5.59)

Этот результат

хорошо коррелирует

с формулой (4.48),

полученной

в предыдущей главе. И мы также можем сделать вывод, что кру­

тильные колебания с частотой w\

являются акустическими

(т. е.

limt£;i=0), а колебания с

частотами

являются оптическими

(т. е.

я - * о

 

 

 

lim w2 — (2Kbl2/ I ) 1/2 ^ 0 )

(рис. 5.5).

 

 

q—+О

 

 

 

Такая же картина обнаруживается и в общем («несимметричном») случае. Действительно, если подставить q = 0 в уравнение (5.58), полу­ чим

w2 (q = 0) = 0; w\ (q = 0) = K bl2(Д + Д) /Д Д .

(5.60)

Рис. 5.5. Две ветви крутильных колебаний ДНК, вычисленные в рамках линей­ ного приближения У-модели

Этот результат говорит о том, что и в общем случае колебательный спектр модели двойного упругого стержня состоит из двух ветвей: аку­ стической и оптической. Давайте теперь сравним этот результат с ре­ зультатами расчетов частот крутильных колебаний, полученными в рам­ ках модели одинарного упругого стержня (см. раздел 4.2). В том слу­ чае была получена только акустическая ветвь. Таким образом, можно заключить, что появление второй (оптической) ветви в спектре ДНК объясняется двухцепочечным характером У-модели.

5.3.3.4. Первый интеграл

Общее решение модельных уравнений (5.41) пока не найдено. Одна­ ко, первый интеграл может быть легко получен при помощи следующего алгоритма.

(I)Предположим, что решение уравнений (5.41) имеет вид бегущих волн

Ч>\ = Ч>\ (z - vt) ; ^2 = ¥>2 (z - vt) ,

(5.61)

где v — скорость этих волн. (II) Подставим (5.61) в (5.41)

Wyip" - К Ь12 [2siny>i - sin (cpi + if2)] = 0;

(5.62)

W 2tp'{ —K bl2 [2siny>2 —sin (tpi + ip2)] = 0.

Здесь

W f = h v 2 - K |a 2/2; <p" = d2ipi/d42-, £ = z - v t \ * = 1,2.

(III) Умножим первое из уравнений (5.62) на у?!, а второе уравнение — на 2.

(IV) Сложим полученные результаты.

(V)Проинтегрируем полученное уравнение.

Врезультате мы получим первый интеграл в виде

W 2<p'2/ 2 + W 2( p —K bl2 [2cos(/?i + 2 COS<£>2 —cos(tpi + (P2)] = const. (5.63)

Выражение (5.63) можно интерпретировать как закон сохранения энергии.

5.3.3.5. Решения в виде кинков, полученные методом Ньютона

Чтобы решить уравнения (5.41) при помощи метода Ньютона, пред­ положим, что их решения имеют вид (5.61), и перепишем соответству­ ющие уравнения (5.62) следующим образом

d2<fii/dt;2 +

<*i {2sin<y?i - s in

(у?, + у?2)} =

0;

<12< 2/(Ц? + OL2 {2sinч>2 - sin (<pi + ^ 2)} =

(К КД)

0,

где а\ = K bl2/W 2\ с*2 =

K bl2/W$. Для

простоты будем предполагать

далее, что ац = а.ч = а.

 

 

 

Уравнения (5.64) можно легко интерпретировать как уравнения, описывающие крутильные колебания двух связанных нелинейных ма­ ятников. В рамках такой «механической» модели переменная £ играет роль «времени», а переменные и ^ - роль угловых смещений маят­ ников из положений равновесия.

Уравнения (5.64) допускают еще одну интерпретацию. Если пере­ менная £ является «временем», а поля и ^ являются «координатами», то уравнения (5.64) могут рассматриваться как обычный закон Ньюто­ на, который описывает двумерное движение механической частицы под действием некоторого потенциала V (^ 1,^ 2)-

Действительно, легко переписать уравнения (5.64) в виде уравнения

Ньютона

 

d2ipi/d£2 = - d V (<pi, (pi) /d(fi\ i = 1,2,

(5.65)

с потенциальной функцией V (у?1,у>г). определяемой формулой

 

V (<pi, ч?2) = 2a(cosy>i +cosy>2) - acos(y?i + <£>2) + С.

(5.66)

Здесь С является произвольной константой. Удобно выбрать эту кон­ станту таким образом, чтобы функция V являлась неположительной и равнялась нулю в точках абсолютного максимума. Тогда потенциал V примет вид

V , р>2) = ^ [1 —cos (ср1± <Р2)] —2а (1 —cos срi ) —2а (1 —cos )

Для корректной постановки «механической» задачи уравнения^ьютона (5.65) должны быть дополнены граничными условиями. Эти усло­ вия легко найти из требования локализации в пространстве плотности энергии солитонной волны e(z, t). Поскольку мы используем перемен­ ную £ вместо переменных z и t, это требование можно сформулировать следующим образом: е(£) должно быть ограниченной функцией в неко­ тором интервале на оси и стремиться к нулю при £ —►±оо. Отсюда следует, что

dcpi/d£-+Q] dpijd^ —» 0;

(5.68)

V (<Pl,<p2) О

(5.69)

при £ —►±оо.

Обозначая положения максимумов потенциальной функции V((pi,cp2) при помощи пар «координат» {gitn]92,m} и используя условие (5.69), мы

находим, что

9l,n\ <?2 -> 92,тп

/с 7Лч

Ч>1

(5.70)

при £ —►± 00.

 

 

Формулы (5.68) и (5.70) полностью определяют граничные условия для «механической» задачи.

Интегрирование уравнений Ньютона (5.65) с потенциалом (5.67) и граничными условиями (5.68), (5.70) является довольно сложной зада­ чей. Пока никому не удалось преуспеть в нахождении общих решений. Однако некоторые частные решения вполне можно найти при помощи метода траекторий [268]. Давайте проиллюстрируем этот метод.

Для этого, прежде всего, необходимо смоделировать функцию которая определяет так называемое уравнение траекторий,

<?(<£>!, (р2) = 0.

(5.71)

Принимая во внимание вид потенциала (5.67), естественно предпо­ ложить, что функция G является линейной комбинацией из функций cos</?i и cos 2. Тогда уравнение (5.71) можно представить в виде

G (<£>i, ) = Acosipi ± В cos 2 = 0,

(5.72)

где A and В — произвольные константы.

Давайте рассмотрим более простой вариант формулы (5.71). А имен­ но предположим, что А + В 0. Тогда вместо (5.72) получим уравнение

 

cos<pi = cos <£>2,

(5.73)

откуда найдем два семейства траекторий:

 

= <р2 ±2п;

п = 0, 1, 2,

 

(2}

=Ь 2 т;

т = 0,1, 2,.

(5-74)

(^>2 =

 

Полученные механические траектории показаны на рис. 5.6. Черньн ми кружочками обозначены «координаты» максимумов потенциальной функции V

Предположим теперь, что при £ = —оо аналог механической части­ цы находится в точке А. Он может продолжить затем движение вдоль одной из четырех траекторий (АВ\, А В 2, АВ% или АВ4), чтобы достичь одну из ближайших соседних точек максимумов при £ = +оо. В то же самое время функции <pi и <£>2будут изменяться от нуля (когда £ = —оо) до 27г и л и —27г (когда £ = +оо). Таким образом, мы можем сделать вывод о том, что уравнения (5.65) имеют по крайней мере четыре пары кинк-

а•Pi

27Г /

/

/

0 е

<Р1

2тг /------

/

0 е

СЧ>1

\0

\

—27Г \____

<Р2

А 0 £

\

2тг \____

Рис. 5.7 Солитоноподобные решения, соответствующие траекториям (a) ABi,

( b ) А-В2, ( с ) АВз и ( d ) АВа

(антикинк-) подобных решений. Они показаны на рис. 5.7 Сплошные линии показывают ассимптотическое поведение решений при £ —>±оо. Поведение этих решений в окрестности точки £ = 0 показано достаточно условно пунктирными линиями. Точное решение в окрестности нулевой точки может быть найдено из уравнений (5.64), дополненными одним из двух условий: — ф2 или <pi = —ip2. В первом случае уравнения (5.64) преобразуются в двойное синус-уравнение Гордона

d/?(p/d£2 + 2а sin ip —a sin 2 = 0; (f\ = cp2 = ip.

(5.75)

Во втором случае уравнения (5.64) преобразуются в обычное синус­