Презентации 2020 / 07-20-FunctionGenomApplic-Metagenom

Геномика и протеомика

Модуль II. Геномика

Тема 6. Функциональная и прикладная геномика

Лекция 7. Реализация информации генома. Метагеномика.

•2.6.1. Реализация информации генома.

•2.6.2. Уровни регуляции экспрессии генов в клетке

•2.6.3. Координация экспрессии различных групп генов

•2.6.4. Оценки уровня транскрипции генов в клетке

•2.6.5. Транскриптом и виды РНК в клетке

•2.6.6. Достижения геномики для практики

•2.6.7. Метагеномика: метагеном и методы его анализа.

•2.6.8. Практическое значение анализа метагеномов

Функциональная геномика

-область молекулярной биологии, которая использует огромное количество данных от геномных проектов для описания функционирования генов и белков, и их взаимодействий. Стартуя с аннотации генов, ФГ занимается исследованием и интеграцией генетической информации, активности генов и функции белков.

Задачи:

1.Анализ генной активности в здоровых и измененных клетках и тканях

2.Получение общей картины функционированияй генома, включая профили экспрессии на уровне мРНК (транскрипционные) и на уровне белка (функция генов, экспрессионные паттерны, контроль генной

экспрессии)

Геномика и протеомика

Реализация информации генома

Геном

1 белковый ген может дать до 100 различающихся вариантов белка,

AS ~40% описанных вариаций, SAP ~60%, PTM ~37%

Геномика и протеомика

Регуляция лактозного оперона E. coli

Гены, кодирующие функционально родственные фер-менты, у прокариот объединены в кластеры под контролем единых регуляторных элементов – опероны.

Упрощенная схема Л.О. – модель Жакоба и Моно (60-е г.) В присутствии лак-

тозы (индуктор) утилизирующие ее гены начинают синтезироваться в виде одной полицистронной мРНК. Структурные гены – β-галактозидаза расщепляет лактозу на галактозу и глюкозу, пермеаза – обеспечивает транспорт лактозы в клетку, трансацетилаза – участвует в удалении продуктов распада лактозы.