Путинцева / Теор_вопросы_мат_методы
.docВопросы для подготовки к экзамену по дисциплине
«Математические методы и компьютерные технологии в биологии»
Раздел «Математические методы»
Регрессионный анализ. На какие вопросы позволяет ответить регрессионный анализ? Условия применимости регрессионного анализа. Приведите пример из области биологии.
Множественная регрессия. Условия применимости. Мультиколлинеарность. Выбор модели. Приведите пример из области биологии.
Логистическая регрессия. Для чего применяется логистическая регрессия? Особенности логит регресии. Приведите пример из области биологии.
Множественный дисперсионный анализ. На какие вопросы позволяет ответить множественный дисперсионный анализ? Множественные сравнения. Поправка Бонферрони. Взаимодействие факторов. Приведите пример из области биологии.
Методы иерархической кластеризации. Метод средней связи. Метод одиночной связи. Метод Уорда (Ward’s method). Приведите пример из области биологии.
Метод кластеризации k-means (k-средних). Метод k-медиан. Приведите пример из области биологии.
Факторный анализ. Анализ главных компонент. Интерпретация. Приведите пример из области биологии.
Дискриминантный анализ. Пошаговый дискриминантный анализ с включением и с исключением. Условия применения. Приведите пример из области биологии.
Раздел «Компьютерные технологии»
Предмет и задачи молекулярной филогенетики.
Алгоритмы попарного и множественного выравнивания.
Сформулируйте концепцию «молекулярных часов».
Чем определяется скорость молекулярной эволюции?
Модели нуклеотидных замен.
Методы построения филогенетических деревьев.