Добавил:
Nemo_Nemorino
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Генная инженерия / Лекция 2 Белковая инженерия.pptx
X
- •Основы биотехнологии и бимедицины
- •Задачи белковой инженерии
- •Свойства ферментов, важные для биотехнологии
- •Две стратегии современной белковой инженерии
- •При рациональном редизайне необходимо изменять конкретные аминокислотные остатки в белке:
- •Направленный мутагенез с использованием ПЦР и перекрывающих ся праймеров (Overlap extension PCR)
- •Направленный мутагенез с использованием ПЦР и перекрывающихся праймеров
- •Направленный мутагенез по методу Кункеля
- •Мегапраймер
- •Кассетный
- •Введение неприродных аналогов аминокислот в белки in vitro
- •Стратегия проведения направленной эволюции макромолекул
- •Способы введения случайных мутаций
- •Два способа случайного объединения гомологичных мутантных фрагментов ДНК (DNA shuffling)
- •Удлинение ДНК с переменой матриц (Staggered Extension Process - StET)
- •Объединение фрагментов генов, независимое от гомологии
- •Ландшафт функциональности среди пространства последовательностей белковых молекул.
- •Ландшафт функциональности среди пространства последовательностей белковых молекул.
- •Ландшафт функциональности среди пространства последовательностей белковых молекул.
- •Ландшафт функциональности среди пространства последовательностей белковых молекул.
- •Эволюционные способы достижения
- •Последствия мутагенеза
- •Перемещение по пространству
- •Локализация мутаций в полипептидных цепях ферментов при разной направленности отбора
- •Методы отбора белков при их направленной эволюции:
- •цикл
- •Сборка капсида нитевидного бактериофага
- •Заражен
- •Отбор пептидов из библиотеки методом фагового дисплея
- •Бактериальный дисплей (E. coli)
- •Получение T7-РНК-
- •Система непрерывной
- •мРНК-дисплей
- •Соединение строящегося полипептида с мРНК
- •Получение экстремозима (субтилизин S41) методом направленной эволюции
- •Разработаны индустриальные ферменты, стабильные при 60 С в присутствии органических растворителей с измененной
- •Распознавание ДНК TAL-эффекторами
- •Рекомбинантный химерный белок TALEN для адресной доставки нуклеазы к ДНК дрожжей
- •Биоинформатика становится интегральной частью белковой инженерии
- •В направленной эволюции должно быть
Биоинформатика становится интегральной частью белковой инженерии
Анализ больших массивов данных о последовательностях белков, полученных новыми методами секвенирования ДНК. Метагеномика.
Выравнивание множественных последовательностей позволяет выявлять ключевые аминокислотные остатки у белков одного класса
Использование баз данных о пространственной структуре известных белков (RCSB Protein Data Bank, http://www.pdb.org – 77 000 структур)
В направленной эволюции должно быть
и зерно рационального дизайна
Интеллект исследователя незаменим
Соседние файлы в папке Генная инженерия