конформация корового участка N- цепей
рецепторные олигосахариды, как
правило:
... 2) имеют гидрофобное “ядро” ...
-CH2OH
-NHCOCH3
-CCH3
правило:
... 3) содержат внутренние водородные связи
Данные РСА (комплексы с беклками), конформация siaLeX
GlcNAcβ
|
E-Selectin |
|
P-Selectin |
Neu5Acα |
Staphylococcal superantigen-like protein 11 |
|
Fucα |
Norovirus VA207 |
|
Galβ |
Conf. A: Calculated (Imberty & Perez) |
|
Neu5Acα2-3Galβ1-4(Fucα1-3)GlcNAcβ (siaLeX)
Вычисленная конформация siaLeX
Conf. A: 68% |
Conf. B: 12% |
Conf. C: 15% |
“bioactive conformation” |
Но! вирус гриппа |
On a basic of data from :
Imberty & Perez. In Carbohydrate mimics. Concepts and Methods; Y., C., Ed.; Wiley VCH: Weinheim, 1998; pp 349-364.