- •Проанализируйте на конкретных примерах преимущества биотехнологического производства витаминов?
- •Известно, что многие ценные лекарственные растения нельзя культивировать в России из-за климатических условий. Предложите возможности решения этой проблемы с помощью биотехнологии?
- •Суперпродуцент – это биообъект промышленного использования. Основные подходы к получению суперпродуцентов. Какими свойствами он должен обладать в отличие от природного штамма культуры?
- •При получении антибиотиков в процессе ферментации в питательной среде возможно избыточное или недостаточное содержание глюкозы.
- •Как можно оптимизировать условия ферментации для получения максимального количества целевого продукта - антибиотика?
- •10. Проведите сравнительную характеристику каллусных и суспензионных культур при использовании их в качестве субстрата для получения бав биотехнологическими методами?
- •Известно, что растения Digitalis lanata можно синтезировать как токсичный дигитоксин, так и менее токсичный дигоксин. Возможно ли преобразование дигитоксина в дигоксин с помощью биотехнологии
- •Проанализируйте возможность успешного сочетания процессов биосинтеза, оргсинтеза и биотрансформации на примере получения беталактамных антибиотиков?
- •17. В биотехнологии существует метод создания новых антибиотических препаратов с использованием мутасинтеза. В чем состоит суть метода и его основные возможности?
- •Что представляет собой биоизостерическая замена? Как этот прием используется при создании новых лекарственных препаратов.
- •2 Стадия. Получение l-сорбозы из d-сорбитола путем его глубинного аэробного окисления уксуснокислыми бактериями.
- •Существует понятие классического скрининга антимикробных средств и таргетного скрининга. Укажите в чём их отличия?
- •23. Что называют пептидомиметиком?
- •25. Бактериофаги. Как бактериофаги используют в генной инженерии и медицине?
- •26. Что такое гены вирулентности? Как гены вирулентности патогенных микроорганизмов используются в диагностике и разработке лекарственных препаратов?
- •27. Что представляет собой гибридомная технология в получении моноклональных антител?
- •Вакцины? Основные типы вакцин? в чем заключаются достоинства и недостатки различных видов вакцин?
- •Имунные сыворотки. Сыворотки на основе поликлональных и моноклональных антител?
- •Что такое гумманизированные моноклональные антитела? Как гумманизированные моноклональные антитела используются в терапии онкозаболеваний?
- •31. Что такое фармакогеномика? Как достижения фармакогеномики используются в разработке новых лекарственных препаратов?
- •32. Биополимеры. Основные требования к биополимерам. Что такое “умные биополимеры”?
- •33. Расскажите об основных методах концентрирования, выделения и сушки лекарственных препаратов белковой природы?
- •34. Что такое метаболитическая перегрузка? Использование регулируемых промоторов для предотвращения метаболитической перегрузки?
- •Что такое химерные белки? Почему процессы получения рекомбинантных белков человека включают стадию получения химерного белка?
- •36. Что такое направленный мутагенез и в чем заключается его принципиальное отличие от индуцированного мутагенеза?
- •Расскажите об основных методах мутагенеза и селекции в получении сверхпродуцентов?
- •В чем заключается метод иммуноферментной диагностики на основе моноклональных антител? Основные достоинства и недостатки метода.
- •Как методы генной инженерии используются в создании новых видов вакцин?
- •Что представляют собой лекарственные препараты на основе олигонуклеотидов (“антисмысловые” рнк, рибозимы, малые интерферирующие рнк)?
- •Расскажите об основных способах стерилизации питательных сред и оборудования в биотехнологических производствах?
- •Расскажите об основных способах промышленного культивирования микроорганизмов – продуцентов лекарственных веществ.
- •Расскажите, как ферменты могут быть использованы для разделения изомеров в рацемических смесях лекарственных веществ?
- •44. Для чего необходима операция наработки продуцента в промышленных биотехнологических процессах?
- •46. Что такое хемостатический и турбидостатическийц режим работы ферментера? Сопоставьте преимущества и недостатки обоих режимов?
- •Почему получение вторичных метаболитов невозможно в ферментерах идеального смешения, работающих в непрерывном режиме?
- •Что такое - вторичные метаболиты? в чем заключается особенность биосинтеза вторичных метаболитов по сравнению с первичными?
- •Расскажите об основных критериях выбора биомишеней при разработке новых антибактериальных препаратов?
- •Расскажите об основных методах валидации и установления структуры биомишеней белковой природы?
- •1.Экспериментальные методы валидации потенциальных мишеней.
- •1.1. Протеомные методы валидации потенциальных мишеней.
- •1.2. Геномные методы валидации потенциальных мишеней.
- •2. Установление пространственной структуры мишеней.
- •3. Конечная селекция и приоритезация потенциальных мишеней
- •Как строение хирального центра молекулы влияет на ее биологическую активность? Что такое – хиральный переход?
- •Протопласты. Особенности получения и культивирования протопластов. Чем обусловлено использование протопластов в клеточной инженерии?
- •Получение протопластов
2 Стадия. Получение l-сорбозы из d-сорбитола путем его глубинного аэробного окисления уксуснокислыми бактериями.
3 стадия. Получение диацетон-L-сорбозы из L-сорбозы путем ее ацетонирования.
4 стадия. Получение гидрата диацетон-2-кето-L-гулоновой кислоты путем окисления диацетон-L-сорбозы.
5 стадия. Получение L-аскорбиновой кислоты из гидрата диацетон-2-кето-L-гулоновой кислоты (деацетонирование --> этерификация --> «енолизация» --> «лактонизация»).
6 стадия. Получение медицинской аскорбиновой кислоты. Перекристаллизация технической аскорбиновой кислоты.
Выход продукта в пересчете па глюкозу составляет в целом до 54%.
20. При производстве пенициллина в начале ферментации было добавлено в питательную среду определённое количество фенилуксусной кислоты, что привело к снижению выхода целевого продукта. Какова роль фенилуксусной кислоты? Какая ошибка была допущена в этом процессе?
Биосинтез антибиотиков может стимулироваться за счет различных стрессовых воздействий (изменение температуры, рН и др.), а так же добавлением в культуральную среду некоторых веществ, которые называют предшественниками. Молекула вещества – предшественника (обычно достаточно простая по строению) может является структурным фрагментом молекулы антибиотика или быть промежуточным метаболитом в его синтезе. Установлено, что синтез этой молекулы является обычно самой медленной, лимитирующей стадией всего многостадийного синтеза молекулы антибиотика.
Например, производство бензилпенициллина в значительной степени стимулируется добавками фенилуксусной кислоты, которая является структурным фрагментом молекулы бензилпенициллина; пропионовая кислота и пропиловый спирт инициируют биосинтез макролидов через метил-малонил-КоА; L-фенилаланин - ускоряет образование грамицидина S.
Молекулы предшественника (например, фенилуксусной кислоты) необходимо добавлять в среду культивирования в период завершения фазы роста культуры микроорганизма – продуцента бензилпенициллина (на 2-3 сутки для 5-суточного процесса). Добавление фенилуксусной кислоты в первые 2-3 суток после начала ферментации бессмысленно, так как на этом этапе биосинтез антибиотика не происходит.
Существует понятие классического скрининга антимикробных средств и таргетного скрининга. Укажите в чём их отличия?
Традиционно первичный отбор антимикробных веществ (классический скрининг) проводится путем испытания их действия на рост тест-культуры микроорганизма. Высокоактивные, подавляющие рост вещества, отобранные на этом этапе, проходят дальнейшие испытания, в частности определяется антимикробный спектр их действия и активность в опытах in vivo на лабораторных животных, а также токсичность как для макроорганизма в целом, так и для отдельных его органов и тканей. По завершении доклинических испытаний в случае получения положительных результатов препарат передается в клинику. Затем начинается углубленное изучения механизма действия антимикробного агента на субклеточном молекулярном уровнях, то есть ведется поиск его внутриклеточной мишени – макромолекулы или макромолекулярного комплекса – таргета (англ. Target – мишень) по недавно принятой терминологии. Далее выявляется ген, который кодирует образование этой макромолекулы, или гены, кодирующие образование макромолекул, входящих в макромолекулярный комплекс.
По новой технологии скрининга (таргетный скрининг) используют информацию о полностью секвенированном геноме патогена и наличии в нем «существенных» генов и генов вирулентности. В лабораториях, в которых ведется создание новых лекарств, из нескольких сотен или даже тысяч генов предварительно выбирается ген, кодирующий белок который далее будет использован, как таргет. Затем проводятся процедуры валидации мишени, установления их пространственной структуры, далее на основе полученной информации о строении активного центра мишени проводится виртуальный скрининг потенциальных антимикробных веществ (молекулярный докинг). Отобранные методом докинга соединения затем проверяют на модельных микроорганизмах.
22. Генная инженерия позволила решить проблему получения инсулина человека. Какие микроорганизмы используются в качестве продуцентов? Почему невозможно прямое получение инсулина? Почему ферментационные среды должны содержать лактозу и галактозу? Какой критерий является определяющим при оценке качества генноинженерного инсулина?
Инсулин - гормон поджелудочной железы, регулирующий углеводный обмен и поддерживающий нормальный уровень сахара в крови. Недостаток этого гормона в организме приводит к одному из тяжелейших заболеваний - сахарному диабету, который как причина смерти стоит на третьем месте после сердечно-сосудистых заболеваний и рака. Инсулин - небольшой глобулярный белок, содержащий 51 аминокислотный остаток и состоящий из двух полипептидных цепей (А и В), связанных между собой двумя дисульфидными мостиками. Синтезируется он в виде одноцепочечного предшественника проинсулина состоящего из 86 аминокислотных остатков, в котором А и В-цепи инсулина соединены С-пептидом, обеспечивающим им необходимую пространственную ориентацию при замыкании дисульфидных связей. После протеолитического отщепления С-пептида образуется инсулин. Инсулин человека невозможно получать от доноров. Не удалось, и осуществить его получение путем культивирования клеток поджелудочной железы человека. Первоначально больным вводили инсулин, полученный от домашних животных (корова, свинья). Такой инсулин обладал сильной аллергенностью из-за различия в аминокислотном составе. Затем были разработаны методы химической и биохимической трансформации свинного инсулина в человеческий. Для получения генно-инженерного инсулина используют культуру генетически модифицированных бактерий E. Coli. Поскольку бактерии не могут осуществлять посттрансляционные изменения белков человека (соединение А и ВВ цепей), то в клетках происходит биосинтез проинсулина, который далее после выделения превращают в инсулин с помощью химических или ферментативных методов. Поскольку проинсулин синтезируется в бактериальных клетках в виде химерного белка, то важнейшей задачей является тщательная очистка готового препарата инсулина от остатков бактериальных белков. Поэтому важнейшим критерием качества генно-инженерного инсулина является его пирогенность (аллергенность). Ген кодирущий синтез проинсулина ставится под контроль регулируемого лактозного промотора, поэтому добавление лактозы в среду, или переход бактерий на ее утилизацию после использования легкоусваиваемых углеводов, является сигналом к началу синтеза проинсулина.
