- •Проанализируйте на конкретных примерах преимущества биотехнологического производства витаминов?
- •Известно, что многие ценные лекарственные растения нельзя культивировать в России из-за климатических условий. Предложите возможности решения этой проблемы с помощью биотехнологии?
- •Суперпродуцент – это биообъект промышленного использования. Основные подходы к получению суперпродуцентов. Какими свойствами он должен обладать в отличие от природного штамма культуры?
- •При получении антибиотиков в процессе ферментации в питательной среде возможно избыточное или недостаточное содержание глюкозы.
- •Как можно оптимизировать условия ферментации для получения максимального количества целевого продукта - антибиотика?
- •10. Проведите сравнительную характеристику каллусных и суспензионных культур при использовании их в качестве субстрата для получения бав биотехнологическими методами?
- •Известно, что растения Digitalis lanata можно синтезировать как токсичный дигитоксин, так и менее токсичный дигоксин. Возможно ли преобразование дигитоксина в дигоксин с помощью биотехнологии
- •Проанализируйте возможность успешного сочетания процессов биосинтеза, оргсинтеза и биотрансформации на примере получения беталактамных антибиотиков?
- •17. В биотехнологии существует метод создания новых антибиотических препаратов с использованием мутасинтеза. В чем состоит суть метода и его основные возможности?
- •Что представляет собой биоизостерическая замена? Как этот прием используется при создании новых лекарственных препаратов.
- •2 Стадия. Получение l-сорбозы из d-сорбитола путем его глубинного аэробного окисления уксуснокислыми бактериями.
- •Существует понятие классического скрининга антимикробных средств и таргетного скрининга. Укажите в чём их отличия?
- •23. Что называют пептидомиметиком?
- •25. Бактериофаги. Как бактериофаги используют в генной инженерии и медицине?
- •26. Что такое гены вирулентности? Как гены вирулентности патогенных микроорганизмов используются в диагностике и разработке лекарственных препаратов?
- •27. Что представляет собой гибридомная технология в получении моноклональных антител?
- •Вакцины? Основные типы вакцин? в чем заключаются достоинства и недостатки различных видов вакцин?
- •Имунные сыворотки. Сыворотки на основе поликлональных и моноклональных антител?
- •Что такое гумманизированные моноклональные антитела? Как гумманизированные моноклональные антитела используются в терапии онкозаболеваний?
- •31. Что такое фармакогеномика? Как достижения фармакогеномики используются в разработке новых лекарственных препаратов?
- •32. Биополимеры. Основные требования к биополимерам. Что такое “умные биополимеры”?
- •33. Расскажите об основных методах концентрирования, выделения и сушки лекарственных препаратов белковой природы?
- •34. Что такое метаболитическая перегрузка? Использование регулируемых промоторов для предотвращения метаболитической перегрузки?
- •Что такое химерные белки? Почему процессы получения рекомбинантных белков человека включают стадию получения химерного белка?
- •36. Что такое направленный мутагенез и в чем заключается его принципиальное отличие от индуцированного мутагенеза?
- •Расскажите об основных методах мутагенеза и селекции в получении сверхпродуцентов?
- •В чем заключается метод иммуноферментной диагностики на основе моноклональных антител? Основные достоинства и недостатки метода.
- •Как методы генной инженерии используются в создании новых видов вакцин?
- •Что представляют собой лекарственные препараты на основе олигонуклеотидов (“антисмысловые” рнк, рибозимы, малые интерферирующие рнк)?
- •Расскажите об основных способах стерилизации питательных сред и оборудования в биотехнологических производствах?
- •Расскажите об основных способах промышленного культивирования микроорганизмов – продуцентов лекарственных веществ.
- •Расскажите, как ферменты могут быть использованы для разделения изомеров в рацемических смесях лекарственных веществ?
- •44. Для чего необходима операция наработки продуцента в промышленных биотехнологических процессах?
- •46. Что такое хемостатический и турбидостатическийц режим работы ферментера? Сопоставьте преимущества и недостатки обоих режимов?
- •Почему получение вторичных метаболитов невозможно в ферментерах идеального смешения, работающих в непрерывном режиме?
- •Что такое - вторичные метаболиты? в чем заключается особенность биосинтеза вторичных метаболитов по сравнению с первичными?
- •Расскажите об основных критериях выбора биомишеней при разработке новых антибактериальных препаратов?
- •Расскажите об основных методах валидации и установления структуры биомишеней белковой природы?
- •1.Экспериментальные методы валидации потенциальных мишеней.
- •1.1. Протеомные методы валидации потенциальных мишеней.
- •1.2. Геномные методы валидации потенциальных мишеней.
- •2. Установление пространственной структуры мишеней.
- •3. Конечная селекция и приоритезация потенциальных мишеней
- •Как строение хирального центра молекулы влияет на ее биологическую активность? Что такое – хиральный переход?
- •Протопласты. Особенности получения и культивирования протопластов. Чем обусловлено использование протопластов в клеточной инженерии?
- •Получение протопластов
44. Для чего необходима операция наработки продуцента в промышленных биотехнологических процессах?
Современные биотехнологические процессы характеризуются использованием аппаратов – ферментеров большого объема (50-500 м3). Запуск процесса культивирования и выведение его на рабочий режим (достижение оптимальной плотности клеточной культуры) является одной из самых сложных и длительных процедур. Часто процесс приходится останавливать в самый последний момент и начинать все сначала из-за попадания в аппарат посторонней микрофлоры или потери клетками, по разным причинам, частично или полностью своих продуктивных свойств. Поэтому приготовления посевного материала является одним из самых сложных, длительных и ответственных этапов всего процесса.
Для любого микробиологического производства всегда необходима исходная культура продуцента, которая, как правило, не отличается высокой стабильностью при хранении. Поэтому, обычно, предприятие один раз в 2-3 месяца получает чистую культуру в количестве 3 пробирок из специальной лаборатории профильной фирмы или НИИ, либо в условиях собственной заводской лаборатории организует ее хранение и контроль микробиологической чистоты используемого штамма. При этом обычно одну пробирку с исходным продуцентом используют на размножение исходного штамма, вторую используют для организации микробиологического контроля за исходным штаммом-продуцентом, третью оставляют в резерве.
Объем пробирки и количество клеток микроорганизма в ней ничтожно мало по сравнению с объемом ферментера и поэтому прямой пересев культуры потребует очень длительного времени, пока не будет достигнута необходимая плотность культуры во всем аппарате. С целью сокращения времени на запуск процесса в производственных условиях наработку необходимого количества биомассы осуществляют, как правило, в несколько стадий (не более 4-х) в специальных аппаратах.
Подготовку биообъектов проводят согласно прилагаемым к регламентам инструкциям. В этих целях исходный штамм микроорганизма или споровый материал (для грибов или актиномицетов), сохраняемый в условиях, близких к анабиозу или анабиоза (высушенным в стерильной почве, песке, на пшене, путем лиофилизации, или сублимационной сушки), оживляют после добавления стерильной жидкой питательной среды с последующим высевом на уплотненную питательную среду (агар). Убедившись в подлинности и чистоте культуры (культура называется чистой, если родительские и дочерние клетки в ней практически неразличимы и между ними нельзя установить родственные связи), операции по пересеву штамма на богатую питательными веществами среду возрастающих объемов (или площади) повторяют несколько раз в асептических условиях, переходя от пробирок к колбам большего объема, помещаемым на качалочные устройства (шюттель-аппараты).
Окончательную наработку биообъекта осуществляют в цехе, используя небольшие ферментаторы-инокуляторы (1-2 стадии), в которых наращивают посевной материал для промышленных ферментаций в количестве 5-20% от объема питательной среды в основном аппарате. При этом одноклеточные культуры чаще доводят до середины-окончания Log-фазы, что позволяет сильно сократить время адаптации клеток (Lag-фазу) при переносе их на питательную среду в производственный ферментер.
По своей конструкции и технологической оснастке инокулятор для аэробных микроорганизмов аналогичен основному ферментеру и снабжен сходными системами аэрирования, перемешивания, термостатирования.
45. Ретроингибирование и его роль в процессах метаболизма. Отрицательная роль ретроингибирования в промышленном биосинтезе. Расскажите как можно уменьшить эффект ретроингибирования в промышленном биосинтезе?
Регуляция обмена веществ микробной клетки может происходить путем изменения ферментативной активности имеющихся ферментов. Это явление наблюдается преимущественно в анаболитических процессах. Наиболее изученным механизмом является ингибирование активности ферментов конечным продуктом (ретроингибирование), когда активность фермента, стоящего в начале многоступенчатого превращения субстрата тормозится конечным метаболитом.
Благодаря этому явлению у микроорганизмов предотвращается перепроизводство низкомолекулярных промежуточных продуктов обмена, таких, как аминокислоты, пуриновые и пиримидиновые нуклеотиды. Как правило, субстрат ингибируемого фермента резко отличается от конечного продукта - ингибитора и это обстоятельство позволяет считать, что конечный продукт соединяется не с активным центром фермента, а со специальным регуляторным или аллостерическим (от греч. «аллос» – другой, «стерос» – пространственный), центром. Присоединение конечного продукта к аллостерическому центру фермента сопровождается утратой нормальной каталитической активности вследствие конформационных изменений структуры белковой молекулы. По сравнению с индукцией и репрессией ретроингибирование это инструмент быстрого и точного регулирования метаболитических процессов.
Ретроингибирование является крайне нежелательным явлением при промышленном получении тех или иных интересующих человека клеточных метаболитов, т.к. препятствует их накоплению в высоких концентрациях, что требует использования установок большего объема и усложняет процесс их выделения и очистки. А это в свою очередь увеличивает себестоимость продукции. Существует несколько подходов, позволяющих снять или значительно уменьшить эффект ретроингибирования. Один из них состоит в том, что целевой продукт (ингибитор), удаляют. Например, если он является эндометаболитом, то создаются условия для его ухода из клетки в культуральную жидкость, например за счет повышения проницаемости клеточных оболочек. Другой подход состоит в том, что в культуральную среду добавляют метаболитический предшественник целевого продукта, синтез которого блокируется этим продуктом (добавление антраниловой кислоты при биосинтезе триптофана). Мутации фермента, затрагивающие аллостерический центр, так же являются эффективным способом снятия ретроингибирования.
