- •Спецкурс «биохимия растений». Зачет.
- •1.Особенности азотного обмена у высших растений.
- •2. Нитратредукция. Характеристика нитратредуктазы и нитритредуктазы.
- •3. Ассимиляция аммонийного азота. Характеристика глутаматдегидрогеназы, глутаминсинтетазы и глутамин-оксоглутаратаминотрансферазы.
- •4. Процессы переаминирования, их роль в превращении азота у растений и значение при прорастании и формировании семян.
- •5. Взаимосвязь процессов усвоения азота с дыханием и фотосинтезом.
- •6. Ферментативный гидролиз белков. Протеолитические ферменты растений, их специфичность и активация.
- •7. Белки цитоскелета и клеточной стенки растений.
- •8. Протеиногенные аминокислоты, их синтез в растениях.
- •9. Структура, свойства и распространение в растениях основных представителей моносахаридов и полисахаридов.
- •10. Реакции взаимопревращения моносахаридов: реакции изомеризации, транс-кетолазные, трансальдолазные реакции, альдольная конденсация.
- •2)Стереоизомерия или d и l изоформы:
- •1. Транскетолазные реакции:
- •2. Трансальдолазная реакция:
- •11. Резервные полисахариды растений. Крахмал и инулин. Строение и синтез
- •12. Структурные полисахариды. Полисахариды клеточной стенки. Строение и свойства целлюлозы, маннанов, ксиланов, хитина.
- •13. Гемицеллюлоза и пектиновые вещества (полиуроновые кислоты, альгиновые кислоты, арабинаны, галактаны).
- •14. Аэробный распад углеводов. Гликолиз. Особенности гликолиза у растений.
- •15. Молочнокислое и спиртовое брожение у растений. Их значение.
- •16. Пентозофосфатный окислительный путь (пфоп)(апотомический распад глюкозы). Основные этапы и значение в жизнедеятельности растений.
- •17. Аэробный этап углеводного обмена. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты. Пируватдегидрогеназный комплекс.
- •18. Цикл трикарбоновых кислот. Окислительное фосфорилирование.
- •3 Этапа в синтезе атф:
- •19. Биосинтез моно- и полисахаридов. Цикл Кальвина. Глюконеогенез. Глткозилтрансферазные реакции.
- •20. Липиды и их биологическая роль. Классификация и номенклатура липидов. Структура, свойства и распространение в природе. Глиоксилатный шунт.
- •21. Жирные кислоты, их классификация и номенклатура. Окисление жирных кислот, биосинтез жирных кислот. Мультиферментные комплексы синтеза жирных кислот.
- •22. Изопреноиды. Характеристика, распространение и применение. Эфирные масла и смолы. Характеристика и функции в растении.
- •23. Гемитерпены, монотерпены, сесквитерпены, дитерпены, сестертерпены, тритерпены, тетратерпены, политерпены: основные представители и их функции.
- •24. Биосинтеза изопреноидов: мевалонатный и немевалонатный.
- •25. Классификация растительных фенолов: общая характеристика, представители, распространение, функции в растениях и применение.
- •26. Полимерные фенольные соединения: общая характеристика и применение. Пути биосинтеза растительных фенолов и связь с основным метаболизмом клеток.
- •27. Пути биосинтеза фенольных соединений: шикиматный и ацетатно-малонатный.
- •28. Общая характеристика, применение, классификация и функции алкалоидов.
- •29. Особенности биосинтеза алкалоидов. Исходные метаболиты.
- •30. Характеристика минорных классов веществ вторичного метаболизма растений. Распространение и основные представители.
- •31. Непротеиногенные аминокислоты. Пути их образования и функции.
- •32. Витамины, необходимые для жизнедеятельности растительных организмов.
- •33. Органические кислоты растений алифатического ряда: их распространение у растений и значение для жизнедеятельности.
- •34. Фитогормоны, их химическая структура и функции.
17. Аэробный этап углеводного обмена. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты. Пируватдегидрогеназный комплекс.
Окислительное декарбоксилирование пирувата происходит в матриксе митохондрий. Транспорт пирувата в митохондриальный матрикс через внутреннюю мембрану митохондрий осуществляется при участии специального белка-переносчика по механизму симпорта с Н+. Превращение пирувата в ацетил-КоА описывают следующим суммарным уравнением:
СН3-СО-СООН + NAD+ + HSKoA → CH3-CO ∼SKoA + NADH + H+ + CO2
В ходе этой реакции происходит окислительное декарбоксилирование пирувата, в результате которого карбоксильная группа удаляется в виде СО2, а ацетильная группа включается в состав ацетил- КоА. Один атом водорода оказывается в составе NADH, а другой в виде Н+поступает в среду. Процесс окислительного декарбоксилирования пирувата катализирует сложноорганизованный пируватдегидрогеназный комплекс. В пируватдегидрогеназный комплекс (ПДК) входят 3 фермента: пируватдекарбоксилаза (Е1), дигидролипоилтрансацетилаза (Е2) и дигидролипоилдегидрогеназа (Е3), а также 5 коферментов: тиаминдифосфат (ТДФ), липоевая кислота,. FAD, NAD+ и КоА.
Кроме того, в состав комплекса входят регуляторные субъединицы: протеинкиназа и фосфопротеинфосфатаза.
Окислительное декарбоксилирование пирувата Превращение пирувата в ацетил-КоА включает 5 стадий:
Стадия I. На этой стадии пируват соединяется с ТДФ в составе Е1и подвергается декарбоксилированию.
Пируват + Е1-ТДФ → Гидроксиэтил-ТДФ + CO2.
Стадия П. Дигидролипоилтрансацетилаза (Е2) катализирует перенос атома водорода и ацетильной группы от ТДФ на окисленную форму липоиллизиновых групп с образованием ацетилтиоэфира липоевой кислоты.
Стадия III. На стадии III КоА взаимодействует с ацетильным производным Е2, в результате чего образуются ацетил-КоА и полностью восстановленный липоильный остаток, простетическая группа Е2.
Стадия IV. На стадии IV дигидролипоилде-гидрогеназа (Е3) катализирует перенос атомов водорода от восстановленных липоильных групп на FAD - простетическую группу фермента Е3.
Стадия V . На стадии V восстановленный FADH2передаёт водород на NAD+с образованием NADH.
Пируватдегидрогеназный комплекс характеризуется большим отрицательным окислительно-восстановительным потенциалом, который обеспечивает наряду с восстановлением кофермента (NADH) образование высокоэнергетической тиоэфирной связи в ацетил-КоА
18. Цикл трикарбоновых кислот. Окислительное фосфорилирование.
Ему предшествует окислительное декарбоксилирование ПВК с образованием ацетилСоА. (Или его образование в результате распада ВЖК и аминокислот) – это 1 ый этап аэробного дыхания. Цикл является вторым этапом аэробного дыхания, а после него происходит 3 этап аэробного дыхания – окислительное фосфорилирование АДР с образованием АТР за счет ТЭП (трансмембранного электрохимического потенциала), кот.формируется в ЭТЦ (электроннотранспортной цепи – дыхательной цепи).
Реакции происходят в митохондриях, все реакции цикла (кроме 7-ой) протекают в матриксе митохондрий, а 6-ая в митохондриальной мембране, поскольку фермент сукцинтат-деридрогеназа локализован там.
№ |
Исходные в-ва |
Продукты |
Фермент |
1 |
Щук, ацетилСоА, Н2О |
Цитрат, НS-CoA |
Цитратсинтза, 4 кл |
2 |
Цитрат |
Цис-аконитат, Н2О |
Цисаконитатгидратаза, 4 кл |
Цис-аконитат, Н2О |
Изоцитрат |
||
3 |
Изоцитрат, НАД+ |
2-оксоглутарат, НАДН+Н+, СО2 |
Изоцитратдегидрогеназа, 1 кл |
4 |
2-оксоглутарат, НАД+, НS-CoA |
Сукцинил-СоА, НАДН+Н+,СО2 |
2-оксоглутаратный комплекс |
5 |
Сукцинил-СоА, ГДФ+Фн, Н2О |
Сукцинат, ГТФ, НS-CoA |
Сукцинил-СоА-синтетаза, 6 кл |
6 |
Сукцинат, ФАД |
Фумарат, ФАДН+Н+ |
Сукцинатдегидрогеназа, 1 кл |
7 |
Фумарат, Н2О |
Малат |
Фумаратгидротаза, 4 кл |
8 |
Малат, НАД+ |
Щук, НАДН+Н+ |
Малатдегидрогеназа, 1 кл |
Функции и энергетический выход Цикла Кребса:
Катаболическая (энергетическая). – вместе с ЭТЦ является основным поставщиком химической энергии в виде АТР. Энергетический баланс:
Анаболическая (метаболическая или пластическая) – субстраты цикла используются для синтеза других веществ.
Интегративная – объединяет пути катаболизма углеводов, жиров и белков, во всех аЭробных организмов он выступает в качестве центрального метаболического пути углерода.
Окислительное фосфорилирование.
Цикл Кребса и ПФОП глюкозы функционируют только в условиях остаточного кол-ва О2, хотя непосредственно в этих процессах он не участвует. О2 необходим для окисления в ЭТЦ митохондрий восстановительных коферментов – НАДН и ФАДН2, при этом синтезируется АТФ. ЭТЦ локализована на внутренней мембране митохондрий и служит для переноса электронов от восстановленных субстратов к О2. Процесс переноса электронов (т.е. окисление субстратов) сопровождается созданием на внутренней мембране митохондрий электрохимического градиента протонов, энергия которого трансформируется в энергию макроэргической связи АТФ.
Строение ЭТЦ. Комплекс I, или НАДН-дегидрогеназа (НАДН: убихинон оксидоредуктаза). Состоит из гидрофобного компонента, встроенного в мембрану и гидрофильной части. В качестве редокс-центра функционирует ФМН (флавинмононуклеотид) и несколько белков, содержащих железосерные кластеры. В гидрофобной части имеется сайт для связывания убихинона.
Комплекс II, или сукцинат-дегидрогеназа (сукцинат-коэнзим Q редуктаза). Редокс-центры: ФАД и 3 железосерных кластера. Имеется цитохром b560.
Комплекс III, или убихинол-цитохром с оксидоредуктаза – состоит из цитохрома b, цитохрома c1, железосерного белка Риске (Fe2S2). В структуре комплекса имеются 2 участка для связывания восстановленной и окисленной форм убихинона. Функционирует как димер.
Комплекс IV, или цитохром с оксидаза. Содержит 4 редокс-центра: 2 гема a и 2 Cu-центра. Функционирует как димер.
4 комплекса НЕ связаны между собой в некий суперкомплекс, а активно диффундируют в липидном слое внутренней мембраны митохондрий. Единственный белок – цитохром с – не интегрирован в мембрану, переносит электроны в межмембранном пространстве от комплекса 3 к 4.
ЭТЦ митохондрий растений, в отличие от животных, включает альтернативную цианид-устойчивую терминальную оксидазу (во внутр мембране), альтернативные ротенон-устойчивые НАДН- и НАДФН-дегидрогеназы ( во внутр мембр со стороны матрикса митохондрий), НАДН- и НАДФН-дегидрогеназы на стороне внутренней мембраны, обращенной в межмембранное пространство, которые способны принимать электроны от НАД(Ф)Н, образующихся в цитозоле.
Синтез АТФ катализируется АТФ-синтазой (во внутр мембр митох). Она состоит из интегрального мембранного домена F0 и каталитического домена – F1, находящегося в матриксе. Обменно-связывающий механизм синтеза АТФ:
Основной этап, требующий энергии, - это процесс отделения АТФ от фермента.
В АТФ-синтазном комплексе связывание субстратов и высвобождение продуктов реакции происходит в 3х отдельных каталитических участках фермента.
Поток протонов водородов через протонный канал F0 по градиенту электрохимического потенциала вызывает вращение гамма-субъединицы комплекса, что приводит к конформационным изменениям в каталитических участках, которые позволяют АТФ высвобождаться от фермента.
