- •1. Строение молекулы днк: химический состав мономерных звеньев
- •7. Механизм реакции полимеризации днк и его катализ. Экзонуклеазные
- •8. Характеристика днк-полимерз e.Coli: размеры, субъединичный состав,
- •9. Структура днк-полимеразы III e.Coli, функции ее отдельных
- •10. Характеристика днк-полимераз эукариот: размеры, субъединичный
- •11. Структура вилки репликации: события на ведущей и отстающей нитях.
- •12. Регуляция инициации репликации у e.Coli: структура участка старта
- •13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с
- •14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и
- •15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса
- •16. Эксцизионная репарация оснований.
- •17. Эксцизионная репарация нуклеотидов с помощью белков uvrAbc.
- •19. Рекомбинационная репарация.
- •20. Механизм общей (гомологичной) рекомбинации: образование
- •21. Сайт-специфическая рекомбинация (механизм интеграция фага λ в
- •22. Характеристика is-элементов и транспозонов бактерий: структура и
- •23. Характеристика днк-транспозонов эукариот: структура, механизм
- •24,25(И на 24, и на 25 вопрос один ответ) Ретротранспозоны с длинными концевыми повторами: структура,
- •26. Понятие о кодирующей и некодирующей (матричной) цепях днк.
- •У прокариот имеется 2 типа рнк-полимеразы: одна из них синтезирует рнк-затравки для фрагментов Оказаки, а другая – все остальные типы рнк.
- •27. Особенности структуры рнк-полимеразы e.Coli: кор-фермент и
- •28. Альтернативные σ-факторы и их роль в инициации транскрипции.
- •29. Характеристика рнк-полимераз I, II и III эукариот: структура и синтезируемые ими молекулы.
- •30. Структура бактериального промотора и механизм его распознавания
- •31. Завершение транскрипции у прокариот: Rho-зависимые и независимые
- •36. Энхансеры, сайленсеры и изоляторы транскрипции.
- •37. Характеристика днк-связывающих доменов факторов транскрипции
- •38. Модификация 5' и 3'-концов молекул мРнк эукариот. Ферменты и
- •39. Процессинг пре-тРнк: формирование 5'- и 3'-концов тРнк, сплайсинг
- •40. Механизм сплайсинга пре-мРнк в ядре: определение границ интронов,
- •41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм
- •42. Аутосплайсинг на примере рРнк тетрахимены: инициация процесса,
- •43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (l-19 рнк,
- •44. Процессинг рРнк у прокариот и эукариот (участвующие в процессе
- •45. Матричная (информационная) рнк, ее структура и функциональные
- •46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового
- •47. Кодон и антикодон, принципы их взаимодействия. Принцип нестрогого
- •48. Аминоацилирование тРнк как необходимый этап трансляции:
- •49. ТРнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль
- •50. Структура рибосом про- и эукариот, входящие в их состав рибосомные
- •51. Механизм инициации трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны
- •52. Механизм инициации трансляции у эукариот. Белковые факторы,
- •53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (еf-Тu или еf-1
- •54. Механизм терминации трансляции у про- и эукриот. Терминирующие
- •Собственно терминация – снятие полипептидной цепочки с последней тРнк.
- •55. Энергетика синтеза белка: количество макроэргических связей,
- •56. Особенности синтеза белка, имеющего n-сигнальную
- •57. Фолдинг белков: молекулярные шапероны семейств Hsp60 и Hsp70 у
- •58. Рабочий цикл шаперонных комплексов GroEls и DnaKj-GrpE.
- •59. Деградация белков: 26s-протеасома эукариот.
- •60. Система убиквитинилирования белков эукариот.
- •61. Сенсорные механизмы эукариот с помощью рецепторов, сопряженных
- •62. Способы передачи сигнала в ядро в сигнальных путях tgFβ-Smad,
- •68. Семейства гомологичных генов. Ортологи и паралоги.
- •69. Псевдогены.
- •70. Типы повторяющихся последовательностей.
13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с
помощью теломеразы.
Возникает проблема кольцевой недореплик. 5`конца. Потому что праймеры на 5`конце удалены(с помощью особой РНК-азы).
5`─────3`
3`───5` выступающий конец расщепляется экзонуклеазой. Молекула ДНК расщепляется в каждом цикле репликации. В основе укороч. ДНК - лимит Хейфлика. (сокращение длины ДНК в ходе деления). На конце линейных хромосом им. повторы (теломерные повторы). Размеры повторов могут быть до 20 тыс. повторов. Есть ф. теломераза(эмбрион) удлинен. концы хромосом. Теломераза удлин 3` конец, а затем ф. репликац. Синтезирует 2 цепь и инициирует обрат. Часть.
Теломераза –РНК –белковый комплекс.
Фермент обратная транскриптаза(ревертаза) синтез ДНК на матрице РНК.
Им. Полтора теломерных повтора. Присоед. 0.5 повторами. Затем синтез. ДНК на матрице РНК.
14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и
одноцепочечных разрывов в молекуле ДНК.
15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса
белков MutLSH.
Рекомбинантная (пострепликативная) репарация
В тех случаях, когда по тем или иным причинам системы репарации оказываются нарушенными, в цепях ДНК могут образовываться бреши (недорепарированные участки), имеющие иногда весьма существенные размеры, что чревато нарушением системы репликации и может привести к гибели клеток. В этом случае клетка в состоянии использовать для репарации одной молекулы ДНК другую полученную после репликации молекулу ДНК, т. е. привлечь для этой цели механизм рекомбинации. У бактерий в рекомбинантной репарации принимает участие белок Rec А. Он связывается с одноцепочечным участком ДНК и вовлекает его в рекомбинацию с гомологичными участками неповрежденных цепей другой молекулы ДНК. В результате и разорванная (содержащая бреши), и неповрежденная цепи репарируемой молекулы ДНК оказываются спаренными с неповрежденными комплементарными участками ДНК, что открывает возможность репарации путем вышеохарактеризованных систем. При этом могут происходить вырезание определенного фрагмента и заполнение с его помощью бреши в дефектной цепи. Возникающие при этом пробелы и разрывы в цепях ДНК восполняются с участием ДНК-полимеразы I и ДНК-лигазы.
Метилирование ДНК позволяет различить матричную и вновь синтезированную цепь. МutLSH репарация:на полуметилированной цепи есть неспаренное основание,кот обнаруживает, а затем связывается МutLS. Он протаскивает ДНК через себя до первого метилированного аденозина, а затем MutH разрезает комплементарную цепь,именно ту, где ошибочное основание. Затем мех-зм может пойти по двум направлениям: 1) 5-3 экзонукл разрезает цепь (после разрыва, а ДНК-пол 3 достраивает; 2) 3-5 экзонукл(до разрыва),ДНК-пол.
У эукариот все тоже самое, только нет MutH. Сам комплекс удаляет.
16. Эксцизионная репарация оснований.
Эксцизия Оснований:
1.Есть повреждение ДНК, кот узнает, а затем вырезает ДНК-гликозилаза.
2. ДНК-гликозилаза расщепляет гликозидную связь и соединяет поврежденное основание с сахарофосфатным остатком.
3. После ее действия АП-эндонуклеаза распознает АП-сайт и делает надрез.
4.Экзонуклеаза удалят поврежденный участок, но в некоторых случаях ДНК-пол 1 благодаря своей 3-5-эндонукл активности удаляет это основание, а полимеразная активность заполняет брешь. 5.Разрывы сшивает ДНК-лигаза.
