- •1. Строение молекулы днк: химический состав мономерных звеньев
- •7. Механизм реакции полимеризации днк и его катализ. Экзонуклеазные
- •8. Характеристика днк-полимерз e.Coli: размеры, субъединичный состав,
- •9. Структура днк-полимеразы III e.Coli, функции ее отдельных
- •10. Характеристика днк-полимераз эукариот: размеры, субъединичный
- •11. Структура вилки репликации: события на ведущей и отстающей нитях.
- •12. Регуляция инициации репликации у e.Coli: структура участка старта
- •13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с
- •14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и
- •15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса
- •16. Эксцизионная репарация оснований.
- •17. Эксцизионная репарация нуклеотидов с помощью белков uvrAbc.
- •19. Рекомбинационная репарация.
- •20. Механизм общей (гомологичной) рекомбинации: образование
- •21. Сайт-специфическая рекомбинация (механизм интеграция фага λ в
- •22. Характеристика is-элементов и транспозонов бактерий: структура и
- •23. Характеристика днк-транспозонов эукариот: структура, механизм
- •24,25(И на 24, и на 25 вопрос один ответ) Ретротранспозоны с длинными концевыми повторами: структура,
- •26. Понятие о кодирующей и некодирующей (матричной) цепях днк.
- •У прокариот имеется 2 типа рнк-полимеразы: одна из них синтезирует рнк-затравки для фрагментов Оказаки, а другая – все остальные типы рнк.
- •27. Особенности структуры рнк-полимеразы e.Coli: кор-фермент и
- •28. Альтернативные σ-факторы и их роль в инициации транскрипции.
- •29. Характеристика рнк-полимераз I, II и III эукариот: структура и синтезируемые ими молекулы.
- •30. Структура бактериального промотора и механизм его распознавания
- •31. Завершение транскрипции у прокариот: Rho-зависимые и независимые
- •36. Энхансеры, сайленсеры и изоляторы транскрипции.
- •37. Характеристика днк-связывающих доменов факторов транскрипции
- •38. Модификация 5' и 3'-концов молекул мРнк эукариот. Ферменты и
- •39. Процессинг пре-тРнк: формирование 5'- и 3'-концов тРнк, сплайсинг
- •40. Механизм сплайсинга пре-мРнк в ядре: определение границ интронов,
- •41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм
- •42. Аутосплайсинг на примере рРнк тетрахимены: инициация процесса,
- •43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (l-19 рнк,
- •44. Процессинг рРнк у прокариот и эукариот (участвующие в процессе
- •45. Матричная (информационная) рнк, ее структура и функциональные
- •46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового
- •47. Кодон и антикодон, принципы их взаимодействия. Принцип нестрогого
- •48. Аминоацилирование тРнк как необходимый этап трансляции:
- •49. ТРнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль
- •50. Структура рибосом про- и эукариот, входящие в их состав рибосомные
- •51. Механизм инициации трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны
- •52. Механизм инициации трансляции у эукариот. Белковые факторы,
- •53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (еf-Тu или еf-1
- •54. Механизм терминации трансляции у про- и эукриот. Терминирующие
- •Собственно терминация – снятие полипептидной цепочки с последней тРнк.
- •55. Энергетика синтеза белка: количество макроэргических связей,
- •56. Особенности синтеза белка, имеющего n-сигнальную
- •57. Фолдинг белков: молекулярные шапероны семейств Hsp60 и Hsp70 у
- •58. Рабочий цикл шаперонных комплексов GroEls и DnaKj-GrpE.
- •59. Деградация белков: 26s-протеасома эукариот.
- •60. Система убиквитинилирования белков эукариот.
- •61. Сенсорные механизмы эукариот с помощью рецепторов, сопряженных
- •62. Способы передачи сигнала в ядро в сигнальных путях tgFβ-Smad,
- •68. Семейства гомологичных генов. Ортологи и паралоги.
- •69. Псевдогены.
- •70. Типы повторяющихся последовательностей.
53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (еf-Тu или еf-1
у про- и эукариот соответственно) и поступление аминоацил-тРНК в
рибосому. Реакция транспептидации: механизм и катализ. Фактор элонгации
2 (ЕF-G или ЕF-2) и транслокация рибосомы.
У эукариот имеется два фактора элонгации - eEF1 и eEF2 . Не исключено, что в митохондриях и хлоропластах существуют независимые факторы элонгации, ответственные за связывание аминоацил-тРНК с рибосомой , но они еще не охарактеризованы
Вместо комплементарного РНК-РНК узнавания, в которое вовлечена прединициирующая последовательность Шайна-Дальгарно прокариотических мРНК, эукариотические мРНК узнаются эукариотическими рибосомами по кэпированному 5'-концу с обязательным участием белка, например, eIF-4F инициаторного фактора ( Rhoads, 1988 ). Предполагается, что этот белок участвует в расплавлении вторичных структур 5'- областей мРНК, облегчая их связывание с малыми субчастицами рибосом. В отличие от прокариот, эукариотическая мРНК образует комплексы с белками ( мРНП , или мессенджер-рибонуклеопротеиды, или информосомы ), что обусловливает ее метаболическую стабильность. Вследствие этого у эукариот отсутствует постоянная интенсивная деградация и интенсивный ресинтез мРНК, которые, как правило, моноцистронны и имеют специфически модифицированный (кэпированный) 5'-конец. Все это обусловливает целый ряд особенностей инициации трансляции и ее регуляции у эукариотических организмов. Естественно, что метаболическая стабильность эукариотической мРНК делает регуляцию на уровне трансляции особенно важной в общей картине регуляции биосинтеза белка
Элонгация. Суть элонгации заключается в возникновении пептидных связей между остатками аминокислот с образованием полипептидной цепи, в которой последовательность аминокислот отвечает последовательности кодонов в мРНК. Элонгации нуждается в энергии ГТФ и факторах элонгации – EF1 и EF2.
Элонгация начинается после того, как мет-тРНКи займет пептидильний центр рибосомы. В свободный аминоацильний сайт рибосомы могут поступать любые аминоацил-тРНК, но остается в нем лишь та, антикодон которой комплементарен кодону на мРНК. В результате метионил-тРНК и вторая аминоацил-тРНК сближаются между собой, а пептидилтрансфераза (точнее пептидилтрансферазный центр), катализирует образование пептидной связи между ними. Заметим, что пептидилтрансферазный центр есть рибозимом и образуется как рибосомальной РНК (28S рРНК), так и белками большой субъединицы рибосом. После образования пептидной связи со второй аминокислотой высвобождается мет тРНКи и происходит транслокация (перемещение) образованного дипептида (дипептидил-тРНК) из аминоацильного сайта в пептидильный. Процессу нужна энергия ГТФ и фактор элонгации ЕF2. В результате транслокации освобождается аминоацильний сайт, в который поступает новая аа-тРНК, антикодон которой комплементарен очередному кодону на мРНК, а пептидилтрансфераза наращивает цепь белка еще на одну аминокислоту по такой схеме:
Пептидил-тРНК(1)+ аминоацил-тРНК(2) >тРНК(1)+ пептидиламиноацил- тРНК(2).
Этот конвеер работает непрерывно до того момента, пока на мРНК не появятся терминирующие кодоны (UAA, UGA, UAG).
