- •1. Строение молекулы днк: химический состав мономерных звеньев
- •7. Механизм реакции полимеризации днк и его катализ. Экзонуклеазные
- •8. Характеристика днк-полимерз e.Coli: размеры, субъединичный состав,
- •9. Структура днк-полимеразы III e.Coli, функции ее отдельных
- •10. Характеристика днк-полимераз эукариот: размеры, субъединичный
- •11. Структура вилки репликации: события на ведущей и отстающей нитях.
- •12. Регуляция инициации репликации у e.Coli: структура участка старта
- •13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с
- •14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и
- •15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса
- •16. Эксцизионная репарация оснований.
- •17. Эксцизионная репарация нуклеотидов с помощью белков uvrAbc.
- •19. Рекомбинационная репарация.
- •20. Механизм общей (гомологичной) рекомбинации: образование
- •21. Сайт-специфическая рекомбинация (механизм интеграция фага λ в
- •22. Характеристика is-элементов и транспозонов бактерий: структура и
- •23. Характеристика днк-транспозонов эукариот: структура, механизм
- •24,25(И на 24, и на 25 вопрос один ответ) Ретротранспозоны с длинными концевыми повторами: структура,
- •26. Понятие о кодирующей и некодирующей (матричной) цепях днк.
- •У прокариот имеется 2 типа рнк-полимеразы: одна из них синтезирует рнк-затравки для фрагментов Оказаки, а другая – все остальные типы рнк.
- •27. Особенности структуры рнк-полимеразы e.Coli: кор-фермент и
- •28. Альтернативные σ-факторы и их роль в инициации транскрипции.
- •29. Характеристика рнк-полимераз I, II и III эукариот: структура и синтезируемые ими молекулы.
- •30. Структура бактериального промотора и механизм его распознавания
- •31. Завершение транскрипции у прокариот: Rho-зависимые и независимые
- •36. Энхансеры, сайленсеры и изоляторы транскрипции.
- •37. Характеристика днк-связывающих доменов факторов транскрипции
- •38. Модификация 5' и 3'-концов молекул мРнк эукариот. Ферменты и
- •39. Процессинг пре-тРнк: формирование 5'- и 3'-концов тРнк, сплайсинг
- •40. Механизм сплайсинга пре-мРнк в ядре: определение границ интронов,
- •41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм
- •42. Аутосплайсинг на примере рРнк тетрахимены: инициация процесса,
- •43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (l-19 рнк,
- •44. Процессинг рРнк у прокариот и эукариот (участвующие в процессе
- •45. Матричная (информационная) рнк, ее структура и функциональные
- •46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового
- •47. Кодон и антикодон, принципы их взаимодействия. Принцип нестрогого
- •48. Аминоацилирование тРнк как необходимый этап трансляции:
- •49. ТРнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль
- •50. Структура рибосом про- и эукариот, входящие в их состав рибосомные
- •51. Механизм инициации трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны
- •52. Механизм инициации трансляции у эукариот. Белковые факторы,
- •53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (еf-Тu или еf-1
- •54. Механизм терминации трансляции у про- и эукриот. Терминирующие
- •Собственно терминация – снятие полипептидной цепочки с последней тРнк.
- •55. Энергетика синтеза белка: количество макроэргических связей,
- •56. Особенности синтеза белка, имеющего n-сигнальную
- •57. Фолдинг белков: молекулярные шапероны семейств Hsp60 и Hsp70 у
- •58. Рабочий цикл шаперонных комплексов GroEls и DnaKj-GrpE.
- •59. Деградация белков: 26s-протеасома эукариот.
- •60. Система убиквитинилирования белков эукариот.
- •61. Сенсорные механизмы эукариот с помощью рецепторов, сопряженных
- •62. Способы передачи сигнала в ядро в сигнальных путях tgFβ-Smad,
- •68. Семейства гомологичных генов. Ортологи и паралоги.
- •69. Псевдогены.
- •70. Типы повторяющихся последовательностей.
45. Матричная (информационная) рнк, ее структура и функциональные
участки у прокариот и эукариот.
Найти в интернете
46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового
словаря.
Генетический код – единая система записи информации о первичной структуре белка. Генетический код читается в виде неперекрывающихся триплетов с фиксированной стартовой точкой. 61 триплет из 64 возможных кодирует 20 АК, 3 кодона не кодируют АК и являются терминирующими. Кодоны АК, имеющих сходные свойства (полярные незаряженные, гидрофобные, заряженные положительно или отрицательно) близки по своему строению, что минимизирует эффект мутаций.
1. Триплетность (ген. код тройной). Одну АК кодирует группа из трех нуклеотидов.
2. Непрерывность. В коде нет сигналов, которые показывали бы конец одного кодона и начало следующего. Поэтому рамка считывания д. б. правильно установлена в начале трансляции и затем двигаться последовательно от одного триплета к следующему
3. Неперекрываемость. Генетический код не перекрывается. Последовательность белка закодирована в виде серии триплетных кодонов.
4. Вырожденность. Одной АК может соответствовать больше одного кодона. Исключение - метионин (AUG) и триптофан (UGG) – кодируются одним кодоном.
5. Универсальность. Ген код одинаков для организмов и вирусов.
Исключения из универсального генетического кода наблюдаются в случае кодонов, используемых для инициации или терминации, и связаны с наличием (отсутствием) тРНК, которая должна взаимодействовать с данными кодонами. Такие исключения обнаружены у про- и эукариот. Почти все исключения касаются терминирующих кодонов:
- У прокариот Mycoplasma capricolum. UGA не используется для терминации и является кодоном, который соответствует триптофану. Фактически этот кодон является предпочтительным и кодон UGG (соответствует в универсальном ген. коде триптофану) используется очень редко. Существует два вида Trp-тРНК, которые содержат антикодоны UСА (читается как UGA и UGG) и ССА (читается только как UGG).
- У дрожжей (Candida) одно исключение из универ. Ген. кода, у них СUG означает серин вместо лейцина и UАG используется как смысловой кодон.
Кодон – это последовательность иРНК, которая состоит из 3-х нуклеотилов и соответствует определенной АК.
Антикодон – это последовательность из 3 нуклеотидлов аминоацил-тРНК, комплементарная кодону иРНК. Антикодон позволяет тРНК поместить (добавить) нужную АК в синтезируемый пептид в соответствии с кодоном. Взаимодействие между кодоном и антикодоном основано на комплементарности и происходит на рибосоме.Гипотеза нестрогого соответствия (wobble-гипотеза).Функция тРНК осуществляется после того, как тРНК распознает кодон, находящийся в А сайте рибосомы. Эта гипотеза подразумевает, что тРНК способна распознавать более чем один кодон путем необычного (non-G-C, non-A-T) спаривания с третьим основанием кодона. Только в трех случаях в третьей позиции кодона находится уникальное основание: AUG (для метионина), UGG (для триптофана) и UGA (терминирующий кодон). С и U никогда не имеют уникального значения в третьей позиции и А никогда не выражает уникальной АК. Так как антикодон комплиментарен кодону, то первое основание в последовательности антикодона традиционно записывается в направлении 5'-3'. Первое основание в антикодоне взаимодействует с третьим основанием в последовательности кодона. Кодон ACG/антикодон CGU можно записать как
Кодон: 5' ACG 3'
Антикодон: 3' UGC 5'.
Последовательность антикодона должна читаться в обратном порядке, чтобы быть комплементарной последовательности кодона. Но так как принято записывать последовательность нуклеотидов в направлении 5' - 3', то эту пару кодон/антикодон можно записать и так – ACG и CGU соответственно.