- •1. Строение молекулы днк: химический состав мономерных звеньев
- •7. Механизм реакции полимеризации днк и его катализ. Экзонуклеазные
- •8. Характеристика днк-полимерз e.Coli: размеры, субъединичный состав,
- •9. Структура днк-полимеразы III e.Coli, функции ее отдельных
- •10. Характеристика днк-полимераз эукариот: размеры, субъединичный
- •11. Структура вилки репликации: события на ведущей и отстающей нитях.
- •12. Регуляция инициации репликации у e.Coli: структура участка старта
- •13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с
- •14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и
- •15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса
- •16. Эксцизионная репарация оснований.
- •17. Эксцизионная репарация нуклеотидов с помощью белков uvrAbc.
- •19. Рекомбинационная репарация.
- •20. Механизм общей (гомологичной) рекомбинации: образование
- •21. Сайт-специфическая рекомбинация (механизм интеграция фага λ в
- •22. Характеристика is-элементов и транспозонов бактерий: структура и
- •23. Характеристика днк-транспозонов эукариот: структура, механизм
- •24,25(И на 24, и на 25 вопрос один ответ) Ретротранспозоны с длинными концевыми повторами: структура,
- •26. Понятие о кодирующей и некодирующей (матричной) цепях днк.
- •У прокариот имеется 2 типа рнк-полимеразы: одна из них синтезирует рнк-затравки для фрагментов Оказаки, а другая – все остальные типы рнк.
- •27. Особенности структуры рнк-полимеразы e.Coli: кор-фермент и
- •28. Альтернативные σ-факторы и их роль в инициации транскрипции.
- •29. Характеристика рнк-полимераз I, II и III эукариот: структура и синтезируемые ими молекулы.
- •30. Структура бактериального промотора и механизм его распознавания
- •31. Завершение транскрипции у прокариот: Rho-зависимые и независимые
- •36. Энхансеры, сайленсеры и изоляторы транскрипции.
- •37. Характеристика днк-связывающих доменов факторов транскрипции
- •38. Модификация 5' и 3'-концов молекул мРнк эукариот. Ферменты и
- •39. Процессинг пре-тРнк: формирование 5'- и 3'-концов тРнк, сплайсинг
- •40. Механизм сплайсинга пре-мРнк в ядре: определение границ интронов,
- •41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм
- •42. Аутосплайсинг на примере рРнк тетрахимены: инициация процесса,
- •43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (l-19 рнк,
- •44. Процессинг рРнк у прокариот и эукариот (участвующие в процессе
- •45. Матричная (информационная) рнк, ее структура и функциональные
- •46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового
- •47. Кодон и антикодон, принципы их взаимодействия. Принцип нестрогого
- •48. Аминоацилирование тРнк как необходимый этап трансляции:
- •49. ТРнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль
- •50. Структура рибосом про- и эукариот, входящие в их состав рибосомные
- •51. Механизм инициации трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны
- •52. Механизм инициации трансляции у эукариот. Белковые факторы,
- •53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (еf-Тu или еf-1
- •54. Механизм терминации трансляции у про- и эукриот. Терминирующие
- •Собственно терминация – снятие полипептидной цепочки с последней тРнк.
- •55. Энергетика синтеза белка: количество макроэргических связей,
- •56. Особенности синтеза белка, имеющего n-сигнальную
- •57. Фолдинг белков: молекулярные шапероны семейств Hsp60 и Hsp70 у
- •58. Рабочий цикл шаперонных комплексов GroEls и DnaKj-GrpE.
- •59. Деградация белков: 26s-протеасома эукариот.
- •60. Система убиквитинилирования белков эукариот.
- •61. Сенсорные механизмы эукариот с помощью рецепторов, сопряженных
- •62. Способы передачи сигнала в ядро в сигнальных путях tgFβ-Smad,
- •68. Семейства гомологичных генов. Ортологи и паралоги.
- •69. Псевдогены.
- •70. Типы повторяющихся последовательностей.
41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм
функционирования. мяРНК и мяРНП-частицы. Роль комплементарных
взаимодействий в протекании процесса сплайсинга.
Найти в интернете.
42. Аутосплайсинг на примере рРнк тетрахимены: инициация процесса,
последовательные стадии процесса, рибозим L-19РНК.
Сплайсинг – механизм, который распознает интроны в предшественниках РНК и с высокой точностью удаляляет их.
Удаление последовательностей интронов происходит в ядрах эукариот сразу после завершения синтеза пре-РНК. В сплайсинге участвуют особые рибонуклеопротеиновые (РНП)-частицы – малые ядерные РНП (мяРНП), в состав которых входят мяРНК U1–U6 и многочисленные белки. Эти РНП-частицы на стыках интронов и экзонов образуют функциональный комплекс – сплайсому.
Не все интроны для своего удаления требуют функционирования сплайсосамы. Интроны предшественников тРНК у эукариот удаляются более простыми ферментами, Некоторые интроны вырезаютсяне предшественниками РНК – аутосплайсинг.
Сплайсинг происходит по одному из четырех механизмо в зависимости от типа интронов:
Аутосплайсинг происходит путем 3 последовательных реакций.
|
Первая реакция 3’-ОН группа гуанозина атакует 5’-конец интрона (присоединение Г к специфическому сайту, вслед.этого Г активирует и 3 он-группа расщепляет фосфодиэфирные связи в 3штр.сайте) |
Вторая реакция 3’-ОН группа экзона А атакует 5’-конец экзона В. (ОН-гр атакует 5-конец второго экзона и отщепляет 3-конец интрона) |
|
Третья реакция 3’-ОН группа интрона атакует Связи 15 оснований от 5’-конца. Вырезание интрона. Соединяет экзоны |
43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (l-19 рнк,
РНКаза P, "головка молотка").
рибозим – интрон впервые обнаружен в органеллах высших организмов, позже широко распространены в природе.
Рибозим — это молекула РНК, обладающая каталитическим действием. Образуют 3-хмерную структуру.
Многие рибозимы естественного происхождения катализируют расщепление самих себя или других молекул РНК, кроме того образование пептидной связи в белках происходит при помощи рРНК рибосомы
Рибозимы, образующие пространственную структуру типа "головки молотка". Были найдены у сателлитных РНК вирусов растений, вироидов, среди транскриптов сателлитных ДНК тритонов.
У РНК подобного типа была определена минимальная последовательность, необходимая для появления ферментативной активности, длиной в 27 нуклеотидов, из которых:
- высококонсервативны 13 нуклеотидов,
- последовательность из трех нуклеотидов, в пределах которой происходит расщепление фосфодиэфирной связи.
примерами рибозимов являются РНК, образующие структуры типа шпилек.
Были обнаружены у вироидов и вирусоидов растений.
44. Процессинг рРнк у прокариот и эукариот (участвующие в процессе
ферменты). Метилирование и другие модификации рРНК в ядрышке; роль
малых РНК в этих процессах.
Трансляция; преобразование белковых молекул
Найти в интернете
