Добавил:
Freesia
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:10-evolution_and_ecology.pptx
X
- •Эволюция и экология бактериофагов.
- •Бактериофаги – это один из наиболее распространённых типов биологических объектов на Земле;
- •Бактериофаги в сконцентрированной морской воде. Эпифлюоресцентная микроскопия.
- •OMV на клетках Seratia marcescens
- •Оценка продукции вирусных частиц
- •Wiggins & Alexander 1985
- •Адсорбция фагов имеет кинетику второго порядка:
- •Похожие на рост бляшек процессы на разрастании цианобактерий в колонке Виноградского в течение
- •Waller et al. 2014. ISME J
- •Manrique et al, PNAS 2016
- •Yutin et al., Nat. Microbiol. 2017
- •Minot et al. 2012, PNA
- •Barr et al. PNAS, 2013
- •Nguyen et al. 201
- •Целлюлолитическое микробное сообщество кишечника лошади
- •IS1 – профили аутоштаммов колиформных бактерий, полученных из 2 образцов фекалий лошадей
- •Fuseloviridae
- •phiX174 gpF
- •Сходство фолдов белков, выполняющих сходную функцию у различных фагов позволяет считать происхождение хвостатых
- •Durand et al. Nature 2015
- •Модели коэволюции системы фаг-бактерия по типу арм-реслинга (а) или флуктуирующей динамики (b). Buckling
- •Scanlan et al
- •элементов), либо части генов (обычно кодирующие белковые домены), которые могут быть переданы в
- •Морон?
- •Механизм хоминга на основе мегануклеаз
- •Сравнение генетических карт фагов G7C и N4
- •Организация генов адгезинов у бактериофагов G7C и ALT.
- •“All world’s phage”
- •Fuck trees!!!!
- •Marvich and Hatfull,
- •Кор – области генома у Т4- подобных фагов включают гены морфогенеза (кроме фибрилл
- •Гены фибриллярных белков адсорбционного аппарата, а также некоторые иные занимают промежуточное положение. У
- •Фибритин фага Т4
- •Группа Т4-подобных
- •В группе бактериофагов, родственных Т-чётным, происходят сравнительно частые модульные замены С-концевой области фибритина
- •Типы С-концевых доменов фибритинов, известные на 2012 г
Гены фибриллярных белков адсорбционного аппарата, а также некоторые иные занимают промежуточное положение. У них имеются консервативные домены, участвующие в белок-белковых взаимодействиях в вирионе и вариабельные, подверженные частым модульным перестановкам функциональные домены
Фаг CBA 120 Kutter et al. 2011
|
|
t |
|
h |
|
g |
|
|
i |
|
|
R |
|
|
|
|
|
g |
|
|
n |
|
|
o |
|
|
r |
|
|
|
W |
|
|
|
Компоромиссный взгляд на филогению Caudovirales
Фибритин фага Т4
Группа Т4-подобных
бактериофагов
spm2
kvp40
В группе бактериофагов, родственных Т-чётным, происходят сравнительно частые модульные замены С-концевой области фибритина белковыми последовательностями неизвестного происхождения; при этом генетически неродственные фолдону фага Т4 белковые домены выполняют сходную функцию в инициации фолдинга молекулы, что приводит к сохранению общего пути
Типы С-концевых доменов фибритинов, известные на 2012 г |
|||
50 |
406 |
30 |
T4 |
50 |
417 |
|
JS-98 |
|
|
||
50 |
375 |
180 |
AcJ9 |
|
|
|
320 |
50 |
399 |
|
RB43 |
|
|
|
50 |
|
375 |
|
||
|
|
|
|
|
|
50 |
|
370 |
|
||
|
|
|
|
|
|
50 |
|
373 |
|
||
|
|
|
|
|
|
50 |
|
|
|
341 |
|
|
|
|
|
|
|
20 |
143 |
RB49 |
|
143 |
|
|
189 |
KVP40 |
612 |
514 |
Aeh I |
|
|
(Ac42)
T4
JS98
T4
Acj9
RB49
RB43
RB49 AehI
KVP40
No Wac
Соседние файлы в предмете Вирусология