Fuseloviridae
Globuloviridae
Rudiviridae Bicaudoviridae
Ampullaviridae
Caudovirales
phiX174 gpF
Microviridae
Picornaviridae Polyomaviridae Parvoviridae Caliciviridae Luteoviridae
& else
Tectiviridae
Corticoviridae
Sphaerolipoviridae
Adenoviridae
Iridoviridae
Phycodnaviridae
Poxviridae
Caudovirales
Herpesviridae
phi6 P1
Cystoviridae
Reoviridae
Totiviridae
Сходство фолдов белков, выполняющих сходную функцию у различных фагов позволяет считать происхождение хвостатых фагов – Caudovirales - монофилитическим.
Более того, детектируемое сходство белков хвоста (Dit, TTP, коннектора) позволяет предположить, что
они появились в MMBR, 2011 результате
дупликаций и дивергенции общего гена-
Durand et al. Nature 2015
T6SS |
|
T4 |
TssE |
≈ |
gp25 |
TssF ≈ |
gp6 |
|
TssG ≈ |
|
|
gp7/gp53 |
||
Nazarov et al. EMBO J 2018 TssK |
≈ |
gp10 |
Модели коэволюции системы фаг-бактерия по типу арм-реслинга (а) или флуктуирующей динамики (b). Buckling & Brokhurst 2012
Scanlan et al
элементов), либо части генов (обычно кодирующие белковые домены), которые могут быть переданы в иное генетическое окружение с сохранением их функции.
Очевидно, что признаком недавнего переноса модуля служит резкое рассогласование степени сходства модулей и окружающих последовательностей в родственных геномах