
- •БиоОрганичесКая химИя
- •Часть I
- •060101 – «Лечебное дело»
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Классификация и номенклатура биологически важных органических соединений
- •Вопрос 1. Как классифицируются органические соединения?
- •Вопрос 2. Какие виды номенклатуры органических соединений используются в настоящее время?
- •Вопрос 3. Как правильно назвать органическое соединение по систематической номенклатуре?
- •Вопрос 4. Какие признаки положены в основу классификации органических соединений?
- •Вопрос 5. Как правильно отнести данный углеводород
- •Вопрос 7. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 8. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 9. Как определить класс и дать название по систематической (международной) и рациональной номенклатурам следующим соединениям:
- •Вопрос 10. Как правильно написать формулу и дать название вторичного спирта, содержащего 4 атома углерода?
- •Вопрос 11. Как написать формулу и название (по международной номенклатуре) тиола, содержащего 3 атома углерода и отметить в этом соединении вторичный атом углерода?
- •Вопрос 12. Как написать формулу и название амида кислоты, содержащей 4 атома углерода?
- •Вопрос 13. Как из представленных формул выбрать те, которые изображены неправильно?
- •Вопрос 14. Как из предложенных названий:
- •Вопрос 15. Соответствует ли правилам Международной номенклатуры название 2-метил-4-бутанол?
- •2. Строение органических соединений
- •Вопрос 16. Как можно охарактеризовать понятие: строение органических соединений?
- •Вопрос 22. Что такое конфигурация молекулы?
- •Вопрос 23. Что такое конформация молекулы?
- •Вопрос 24. Что такое гомологический ряд?
- •Вопрос 25. Как написать формулу гомолога бутановой кислоты, имеющего на два атома углерода больше?
- •Вопрос 26. Как написать формулу гомолога бутаналя, имеющего на четыре атома водорода меньше?
- •Вопрос 27. Как написать формулу изомера пентановой кислоты по строению углеродной цепи?
- •Вопрос 28. Как написать формулу изомера 1-пентена по положению кратной связи?
- •Вопрос 29. Как написать формулу изомера бутаналя по функциональной группе?
- •Вопрос 31. Как определить, к какому типу изомеров относятся олеиновая и элаидиновая кислоты?
- •Вопрос 32. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: бутановая кислота и метиловый эфир пропановой кислоты?
- •Вопрос 33. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: 1-бутанол и 2-бутанол?
- •Вопрос 34. Как определить, являются ли изомерами лейцин и изолейцин?
- •3. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •Вопрос 35. Как определить, какой тип реакций наиболее характерен для соединений, относящихся к тому или иному классу органических соединений?
- •Вопрос 36. Как по уравнению реакции определить, к какому типу химических реакций она относится?
- •Вопрос 37. Как правильно написать уравнение реакции и определить её механизм?
- •Вопрос 38. Какой продукт преимущественно образуется в результате реакции бромирования 3-метилпентана?
- •Вопрос 39. Назовите продукт взаимодействия 2-бутеновой кислоты с бромоводородом в присутствии перекиси и без неё.
- •Вопрос 40. В процессе метаболизма в живых организмах фумаровая кислота превращается в яблочную. Каким путем можно получить яблочную кислоту из фумаровой in vitro?
- •Вопрос 41. R-2-бромбутан может реагировать с водным раствором гидроксида натрия по механизмам sn1 и sn2. Опишите стереохимический результат реакции в каждом случае.
- •Вопрос 44. Каков внешний эффект взаимодействия олеата натрия с бромной водой?
- •4. Аминокислоты, пептиды, белки
- •Вопрос 45. Какие соединения относятся к - аминокислотам? Какова роль -аминокислот в функционировании живых организмов?
- •Вопрос 46. Как построить формулы стереоизомеров (энантиомеров) -аминокислот? Все ли природные -аминокислоты оптически активны?
- •Вопрос 47. Как проявляются кислотно-основные свойства и амфотерность -аминокислот? Какие свойства -аминокислот обуславливает их ионное строение?
- •Вопрос 48. Как определить, какую реакцию среды имеют растворы -аминокислот в дистиллированной воде?
- •Вопрос 49. Что такое «изоэлектрическая точка - аминокислоты»? Каким образом - аминокислоты перемещаются в электрическом поле?
- •Вопрос 51. С помощью какой реакции можно превратить изолейцин в 3-метил-2-пентеновую кислоту? а серин в 2- аминоэтанол?
- •Вопрос 53. Какие соединения образуются при взаимодействии в организме валина и пировиноградной кислоты?
- •Вопрос 54. Что представляют собой пептиды? в чём состоит их отличие от белков? в результате каких реакций образуются пептиды в организме?
- •Вопрос 56. Охарактеризуйте первичную, вторичную, третичную и четвертичную структуры белков.
- •Вопрос 57. Как классифицируются белки?
- •Вопрос 58. Какие качественные реакции используют для определения аминокислот и белков?
- •Вопрос 59. Можно ли с помощью ксантопротеиновой реакции (с азотной кислотой) отличить фенилаланин от тирозина? Если да, то в чем будет состоять различие? Если нет, объясните, почему.
- •Литература
Вопрос 57. Как классифицируются белки?
Ответ. Нет единой классификации, учитывающей различные параметры белков. В основе имеющихся классификаций обычно лежит один признак. Белки можно классифицировать:
– по форме молекул (глобулярные и фибриллярные);
– по молекулярной массе (низко- и высокомолекулярные);
– по составу или химическому строению (наличие или отсутствие небелковой части);
– по выполняемым функциям;
– по локализации в клетке (ядерные, цитоплазматические, лизосомальные и др.);
– по локализации в организме (белки крови, печени и др.);
– по возможности адаптивно регулировать количество данных белков: белки, синтезирующиеся с постоянной скоростью (конститутивные), и белки, синтез которых может усиливаться при воздействии факторов среды (индуцибельные);
– по продолжительности жизни в клетке (от очень быстро обновляющихся белков, с периодом полупревращения менее 1 ч, до очень медленно обновляющихся белков, период полупревращения которых исчисляют неделями и месяцами);
– по схожим участкам первичной структуры и родственным функциям (семейства белков).
К глобулярным относят белки, соотношение продольной и поперечной осей которых не превышает 1:10, а чаще составляет 1:3 или 1:4, т.е. белковая молекула имеет форму эллипса. Большинство индивидуальных белков человека относят к глобулярным белкам. Они имеют компактную структуру, при образовании глобулы гидрофобные радикалы ориентируются внутрь молекулы, а гидрофильные находятся снаружи глобулы, поэтому большинство из них хорошо растворимы в воде. Примеры: яичный альбумин, миоглобин, гемоглобин, многие ферменты.
Фибриллярные белки имеют вытянутую, нитевидную структуру, в которой соотношение продольной и поперечной осей более 1:10. К фибриллярным белкам относят коллагены, эластин, кератин, выполняющие в организме человека структурную функцию, а также миозин, участвующий в мышечном сокращении, и фибрин – белок свёртывающей системы крови.
По составу белки подразделяются на простые и сложные. Простые белки содержат в своём составе только остатки -аминокислот. Сложные белки кроме остатков -аминокислот содержат в составе молекулы дополнительный компонент непептидной природы (простетическую группу). Это может быть органическое вещество, фосфорная кислота, ион металла и т.д.
Белки, содержащие в своём составе остаток фосфорной кислоты (обычно в виде эфира с гидроксильной группой серина) называются фосфопротеинами: это казеиноген молока; вителлин, вителлинин и фосвитин, выделенные из желтка куриного яйца; овальбумин, открытый в белке куриного яйца; ихтулин, содержащийся в икре рыб, и др.
Углеводы являются простетической группой гликопротеинов (это компоненты сыворотки крови (иммуноглобулины, трансферины и др.); групповые в-ва крови; антигены многих вирусов; некоторые гормоны и ферменты).
Липиды входят в состав липопротеинов. Липопротеины подразделяют на свободные, или растворимые в воде (липопротеины плазмы крови, молока, желтка яиц и др.), и нерастворимые или структурные (липопротеины мембран клетки, миелиновой оболочки нервных волокон, хлоропластов растений).
Нуклеопротеины содержат нуклеиновые кислоты: дезоксирибонуклеопротеины (ДНП) и рибонуклеопротеины (РНП).
Белки выполняют в клетках множество биологических функций. Их можно разделить на следующие большие группы.
– ферменты (специализированные белки, ускоряющие течение химических реакций);
– регуляторные белки (белки-гормоны, участвующие в поддержании постоянства внутренней среды организма, воздействующие на специфические клетки-мишени);
– рецепторные белки (служат для передачи гормонального сигнала);
– транспортные белки (участвуют в переносе специфических лигандов из одного органа к другому, часто в комплексе с белками переносятся молекулы, плохо растворимые в воде: так, белок плазмы крови альбумин переносит жирные кислоты и билирубин (продукт распада тема), а гемоглобин эритроцитов участвует в переносе О2 от лёгких к тканям и т.п.).
– структурные белки (придают форму, создают опору, определяют механические свойства данной ткани: например, главным компонентом хрящей и сухожилий является фибриллярный белок коллаген, имеющий высокую прочность, другой структурный белок (эластин) благодаря своему уникальному строению обеспечивает определённым тканям (сосуды, лёгкие) свойство растягиваться во всех направлениях).
– защитные белки (например, иммуноглобулины обладают способностью узнавать и связывать чужеродные молекулы, вирусные частицы и бактерии, в результате чего происходит их нейтрализация; защитными свойствами обладают белки свёртывающей системы крови, например фибриноген, тромбин: они участвуют в формировании тромба, который закупоривает повреждённый сосуд и препятствует потере крови);
– сократительные белки (наделяют клетку способностью либо сокращаться, либо передвигаться: актин и миозин – фибриллярные белки, участвующие в сокращении скелетных мышц; тубулин, из которого построены клеточные органеллы - микротрубочки, важные элементы ресничек и жгутиков, с помощью которых клетки передвигаются).
Однако существует большое количество белков, имеющих уникальные функции, не вошедшие в эту классификацию.
Пример семейства родственных белков – семейство миоглобина, куда включены, кроме самого миоглобина, и все виды гемоглобина.