
- •БиоОрганичесКая химИя
- •Часть I
- •060101 – «Лечебное дело»
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Классификация и номенклатура биологически важных органических соединений
- •Вопрос 1. Как классифицируются органические соединения?
- •Вопрос 2. Какие виды номенклатуры органических соединений используются в настоящее время?
- •Вопрос 3. Как правильно назвать органическое соединение по систематической номенклатуре?
- •Вопрос 4. Какие признаки положены в основу классификации органических соединений?
- •Вопрос 5. Как правильно отнести данный углеводород
- •Вопрос 7. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 8. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 9. Как определить класс и дать название по систематической (международной) и рациональной номенклатурам следующим соединениям:
- •Вопрос 10. Как правильно написать формулу и дать название вторичного спирта, содержащего 4 атома углерода?
- •Вопрос 11. Как написать формулу и название (по международной номенклатуре) тиола, содержащего 3 атома углерода и отметить в этом соединении вторичный атом углерода?
- •Вопрос 12. Как написать формулу и название амида кислоты, содержащей 4 атома углерода?
- •Вопрос 13. Как из представленных формул выбрать те, которые изображены неправильно?
- •Вопрос 14. Как из предложенных названий:
- •Вопрос 15. Соответствует ли правилам Международной номенклатуры название 2-метил-4-бутанол?
- •2. Строение органических соединений
- •Вопрос 16. Как можно охарактеризовать понятие: строение органических соединений?
- •Вопрос 22. Что такое конфигурация молекулы?
- •Вопрос 23. Что такое конформация молекулы?
- •Вопрос 24. Что такое гомологический ряд?
- •Вопрос 25. Как написать формулу гомолога бутановой кислоты, имеющего на два атома углерода больше?
- •Вопрос 26. Как написать формулу гомолога бутаналя, имеющего на четыре атома водорода меньше?
- •Вопрос 27. Как написать формулу изомера пентановой кислоты по строению углеродной цепи?
- •Вопрос 28. Как написать формулу изомера 1-пентена по положению кратной связи?
- •Вопрос 29. Как написать формулу изомера бутаналя по функциональной группе?
- •Вопрос 31. Как определить, к какому типу изомеров относятся олеиновая и элаидиновая кислоты?
- •Вопрос 32. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: бутановая кислота и метиловый эфир пропановой кислоты?
- •Вопрос 33. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: 1-бутанол и 2-бутанол?
- •Вопрос 34. Как определить, являются ли изомерами лейцин и изолейцин?
- •3. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •Вопрос 35. Как определить, какой тип реакций наиболее характерен для соединений, относящихся к тому или иному классу органических соединений?
- •Вопрос 36. Как по уравнению реакции определить, к какому типу химических реакций она относится?
- •Вопрос 37. Как правильно написать уравнение реакции и определить её механизм?
- •Вопрос 38. Какой продукт преимущественно образуется в результате реакции бромирования 3-метилпентана?
- •Вопрос 39. Назовите продукт взаимодействия 2-бутеновой кислоты с бромоводородом в присутствии перекиси и без неё.
- •Вопрос 40. В процессе метаболизма в живых организмах фумаровая кислота превращается в яблочную. Каким путем можно получить яблочную кислоту из фумаровой in vitro?
- •Вопрос 41. R-2-бромбутан может реагировать с водным раствором гидроксида натрия по механизмам sn1 и sn2. Опишите стереохимический результат реакции в каждом случае.
- •Вопрос 44. Каков внешний эффект взаимодействия олеата натрия с бромной водой?
- •4. Аминокислоты, пептиды, белки
- •Вопрос 45. Какие соединения относятся к - аминокислотам? Какова роль -аминокислот в функционировании живых организмов?
- •Вопрос 46. Как построить формулы стереоизомеров (энантиомеров) -аминокислот? Все ли природные -аминокислоты оптически активны?
- •Вопрос 47. Как проявляются кислотно-основные свойства и амфотерность -аминокислот? Какие свойства -аминокислот обуславливает их ионное строение?
- •Вопрос 48. Как определить, какую реакцию среды имеют растворы -аминокислот в дистиллированной воде?
- •Вопрос 49. Что такое «изоэлектрическая точка - аминокислоты»? Каким образом - аминокислоты перемещаются в электрическом поле?
- •Вопрос 51. С помощью какой реакции можно превратить изолейцин в 3-метил-2-пентеновую кислоту? а серин в 2- аминоэтанол?
- •Вопрос 53. Какие соединения образуются при взаимодействии в организме валина и пировиноградной кислоты?
- •Вопрос 54. Что представляют собой пептиды? в чём состоит их отличие от белков? в результате каких реакций образуются пептиды в организме?
- •Вопрос 56. Охарактеризуйте первичную, вторичную, третичную и четвертичную структуры белков.
- •Вопрос 57. Как классифицируются белки?
- •Вопрос 58. Какие качественные реакции используют для определения аминокислот и белков?
- •Вопрос 59. Можно ли с помощью ксантопротеиновой реакции (с азотной кислотой) отличить фенилаланин от тирозина? Если да, то в чем будет состоять различие? Если нет, объясните, почему.
- •Литература
Вопрос 51. С помощью какой реакции можно превратить изолейцин в 3-метил-2-пентеновую кислоту? а серин в 2- аминоэтанол?
Ответ. Запишем формулы исходного соединения и продукта в первой реакции.
В
идно,
что для получения 3-метил-2-пентеновой
кислоты из молекулы изолейцина необходимо
удалить аминогруппу. Если это проделать,
то у второго атома углерода освободится
одна связь:
Чтобы между вторым и третьим атомами углерода образовалась двойная связь, необходимо освободить одну связь у третьего атома углерода. При этом метильная группа (–СН3) в молекуле должна сохраниться. Это можно сделать, отщепив от третьего атома углерода атом водорода:
О
О
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
СН3–СН2–СН–СН–С
СН3–СН2–С=СН–С
ОН
–Н
ОН
СН3
СН3
Т
аким
образом, чтобы получить 3-метил-2-пентеновую
кислоту, молекула изолейцина должна
потерять аминогруппу и атом водорода.
В свободном виде эти частицы неустойчивы
и образуют молекулу аммиака NН3.
Отщепление молекулы аммиака от
аминокислоты с образованием непредельной
кислоты являются признаками протекания
реакции внутримолекулярного дезаминирования
(см. вопрос 36). Окончательно уравнение
реакции можно записать следующим
образом:
Т
еперь
запишем формулы серина и 2- аминоэтанола:
Сравнивая эти формулы, приходим к выводу, что для решения поставленной задачи необходимо удалить атом углерода и два атома кислорода карбоксильной группы. Таким образом, в ходе реакции серин теряет эту функциональную группу. Поэтому такая реакция называется реакцией декарбоксилирования, карбоксильная группа отщепляется в виде оксида углерода (IV).
В организме декарбоксилирование - аминокислот протекает в присутствии специальных ферментов – декарбоксилаз. Уравнение реакции можно записать следующим образом:
Вопрос 52. Какое соединение образуется в результате восстановительного дезаминирования серина и окислительного дезаминирования глутаминовой кислоты? Будут ли различаться продукты окислительного дезаминирования in vivo (в организме) и in vitro (в пробирке)?
Ответ. При восстановительном дезаминировании - аминокислот аминогруппа во втором положении замещается на атом водорода. Ещё один атом водорода присоединяется к аминогруппе с образованием молекулы аммиака:
В результате получается 3-гидроксипропановая кислота.
Окислительное дезаминирование - аминокислоты в живом организме происходит в две стадии. На первой стадии под действием ферментов-дегидрогеназ осуществляется дегидрирование (отщепление водорода) исходной - аминокислоты с образованием иминокислоты. На второй стадии в результате гидролиза иминокислоты (взаимодействие с водой) получается - кетокислота и аммиак. Для глутаминовой кислоты эти стадии можно записать следующим образом:
В лабораторных условиях окислительное дезаминирование осуществляют с помощью азотистой кислоты. При этом образуются - гидроксикислоты и выделяется газообразный азот: