
- •БиоОрганичесКая химИя
- •Часть I
- •060101 – «Лечебное дело»
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Классификация и номенклатура биологически важных органических соединений
- •Вопрос 1. Как классифицируются органические соединения?
- •Вопрос 2. Какие виды номенклатуры органических соединений используются в настоящее время?
- •Вопрос 3. Как правильно назвать органическое соединение по систематической номенклатуре?
- •Вопрос 4. Какие признаки положены в основу классификации органических соединений?
- •Вопрос 5. Как правильно отнести данный углеводород
- •Вопрос 7. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 8. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 9. Как определить класс и дать название по систематической (международной) и рациональной номенклатурам следующим соединениям:
- •Вопрос 10. Как правильно написать формулу и дать название вторичного спирта, содержащего 4 атома углерода?
- •Вопрос 11. Как написать формулу и название (по международной номенклатуре) тиола, содержащего 3 атома углерода и отметить в этом соединении вторичный атом углерода?
- •Вопрос 12. Как написать формулу и название амида кислоты, содержащей 4 атома углерода?
- •Вопрос 13. Как из представленных формул выбрать те, которые изображены неправильно?
- •Вопрос 14. Как из предложенных названий:
- •Вопрос 15. Соответствует ли правилам Международной номенклатуры название 2-метил-4-бутанол?
- •2. Строение органических соединений
- •Вопрос 16. Как можно охарактеризовать понятие: строение органических соединений?
- •Вопрос 22. Что такое конфигурация молекулы?
- •Вопрос 23. Что такое конформация молекулы?
- •Вопрос 24. Что такое гомологический ряд?
- •Вопрос 25. Как написать формулу гомолога бутановой кислоты, имеющего на два атома углерода больше?
- •Вопрос 26. Как написать формулу гомолога бутаналя, имеющего на четыре атома водорода меньше?
- •Вопрос 27. Как написать формулу изомера пентановой кислоты по строению углеродной цепи?
- •Вопрос 28. Как написать формулу изомера 1-пентена по положению кратной связи?
- •Вопрос 29. Как написать формулу изомера бутаналя по функциональной группе?
- •Вопрос 31. Как определить, к какому типу изомеров относятся олеиновая и элаидиновая кислоты?
- •Вопрос 32. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: бутановая кислота и метиловый эфир пропановой кислоты?
- •Вопрос 33. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: 1-бутанол и 2-бутанол?
- •Вопрос 34. Как определить, являются ли изомерами лейцин и изолейцин?
- •3. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •Вопрос 35. Как определить, какой тип реакций наиболее характерен для соединений, относящихся к тому или иному классу органических соединений?
- •Вопрос 36. Как по уравнению реакции определить, к какому типу химических реакций она относится?
- •Вопрос 37. Как правильно написать уравнение реакции и определить её механизм?
- •Вопрос 38. Какой продукт преимущественно образуется в результате реакции бромирования 3-метилпентана?
- •Вопрос 39. Назовите продукт взаимодействия 2-бутеновой кислоты с бромоводородом в присутствии перекиси и без неё.
- •Вопрос 40. В процессе метаболизма в живых организмах фумаровая кислота превращается в яблочную. Каким путем можно получить яблочную кислоту из фумаровой in vitro?
- •Вопрос 41. R-2-бромбутан может реагировать с водным раствором гидроксида натрия по механизмам sn1 и sn2. Опишите стереохимический результат реакции в каждом случае.
- •Вопрос 44. Каков внешний эффект взаимодействия олеата натрия с бромной водой?
- •4. Аминокислоты, пептиды, белки
- •Вопрос 45. Какие соединения относятся к - аминокислотам? Какова роль -аминокислот в функционировании живых организмов?
- •Вопрос 46. Как построить формулы стереоизомеров (энантиомеров) -аминокислот? Все ли природные -аминокислоты оптически активны?
- •Вопрос 47. Как проявляются кислотно-основные свойства и амфотерность -аминокислот? Какие свойства -аминокислот обуславливает их ионное строение?
- •Вопрос 48. Как определить, какую реакцию среды имеют растворы -аминокислот в дистиллированной воде?
- •Вопрос 49. Что такое «изоэлектрическая точка - аминокислоты»? Каким образом - аминокислоты перемещаются в электрическом поле?
- •Вопрос 51. С помощью какой реакции можно превратить изолейцин в 3-метил-2-пентеновую кислоту? а серин в 2- аминоэтанол?
- •Вопрос 53. Какие соединения образуются при взаимодействии в организме валина и пировиноградной кислоты?
- •Вопрос 54. Что представляют собой пептиды? в чём состоит их отличие от белков? в результате каких реакций образуются пептиды в организме?
- •Вопрос 56. Охарактеризуйте первичную, вторичную, третичную и четвертичную структуры белков.
- •Вопрос 57. Как классифицируются белки?
- •Вопрос 58. Какие качественные реакции используют для определения аминокислот и белков?
- •Вопрос 59. Можно ли с помощью ксантопротеиновой реакции (с азотной кислотой) отличить фенилаланин от тирозина? Если да, то в чем будет состоять различие? Если нет, объясните, почему.
- •Литература
Вопрос 46. Как построить формулы стереоизомеров (энантиомеров) -аминокислот? Все ли природные -аминокислоты оптически активны?
Ответ. В молекулах всех природных -аминокислот, за исключением глицина, один и тот же атом углерода (второй) связан с четырьмя различными заместителями: карбоксильной группой (–СООН), аминогруппой (–NH2), углеводородным радикалом R и атомом водорода, т.е. по крайней мере один из атомов углерода в этих аминокислотах является асимметрическим. В молекулах всех этих -аминокислот отсутствуют элементы симметрии, следовательно, все - аминокислоты (кроме глицина) являются оптически активными соединениями и могут существовать в виде двух энантиомеров. Для того, чтобы правильно изобразить энантиомеры, следует углеродную цепь кислоты расположить вертикально. Вверху изображается старшая группа (карбоксильная). Два оставшихся заместителя (аминогруппа и атом водорода) у второго (асимметрического) атома углерода изображаются слева и справа от углеродной цепи. В стандартной проекционной формуле Фишера L- конфигурации соответствует расположение аминогруппы слева от углеродной цепи, а D-конфигурации – справа:
Аминокислоты изолейцин и треонин содержат в молекулах по два асимметрических атома углерода (второй и третий). Следовательно, они могут существовать в виде двух пар энантиомеров:
Из каждой четвёрки изомеров в человеческом организме для построения белков используют только один: L-треонин и L-изолейцин.
Другие -аминокислоты в составе белка присутствуют так же в L-форме. -Аминокислоты D-ряда встречаются в составе пептидов ряда микроорганизмов и бактерий.
Вопрос 47. Как проявляются кислотно-основные свойства и амфотерность -аминокислот? Какие свойства -аминокислот обуславливает их ионное строение?
Ответ. -Аминокислоты образуют соли как со щелочами, так и с кислотами, т.е. являются амфотерными соединениями, т.к. в их молекулах содержатся функциональные группы кислотного (–СООН) и основного (–NH2) характера:
С
катионами тяжёлых металлов -аминокислоты
образуют внутрикомплексные соли
хелатного (клешнеобразного) типа:
Стрелкой, направленной от атома азота к атому меди, в формуле хелата показана химическая связь, образованная по донорно-акцепторному механизму. Атом азота, предоставляя свою электронную пару для образования связи, выступает в роли донора, а атом меди, предоставляя вакантную (свободную) орбиталь – акцептором электронной пары.
В
водных растворах амфотерные -аминокислоты
существуют в виде равновесной смеси
диполярного иона, катионной и анионной
форм:
В сильнокислых растворах (рН = 1-2) преобладает катионная форма, в сильнощелочных (рН = 13-14) – анионная форма. В твёрдом состоянии -аминокислоты существуют в виде диполярных ионов. В уравнениях реакций с участием -аминокислот для удобства обычно записывают аминокислоты в виде неионизированной формы.
Ионное строение молекул -аминокислот обусловливает их высокие температуры плавления (свыше 200 С), нелетучесть растворимость в воде, нерастворимость в неполярных органических растворителях. Растворимость в воде обеспечивает биологическое функционирование - аминокислот: всасываемость, перемещение в организме и т.д.