
- •БиоОрганичесКая химИя
- •Часть I
- •060101 – «Лечебное дело»
- •Оглавление
- •Введение
- •1. Классификация и номенклатура биологически важных органических соединений
- •Вопрос 1. Как классифицируются органические соединения?
- •Вопрос 2. Какие виды номенклатуры органических соединений используются в настоящее время?
- •Вопрос 3. Как правильно назвать органическое соединение по систематической номенклатуре?
- •Вопрос 4. Какие признаки положены в основу классификации органических соединений?
- •Вопрос 5. Как правильно отнести данный углеводород
- •Вопрос 7. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 8. Как определить класс и дать название по систематической номенклатуре следующему соединению:
- •Вопрос 9. Как определить класс и дать название по систематической (международной) и рациональной номенклатурам следующим соединениям:
- •Вопрос 10. Как правильно написать формулу и дать название вторичного спирта, содержащего 4 атома углерода?
- •Вопрос 11. Как написать формулу и название (по международной номенклатуре) тиола, содержащего 3 атома углерода и отметить в этом соединении вторичный атом углерода?
- •Вопрос 12. Как написать формулу и название амида кислоты, содержащей 4 атома углерода?
- •Вопрос 13. Как из представленных формул выбрать те, которые изображены неправильно?
- •Вопрос 14. Как из предложенных названий:
- •Вопрос 15. Соответствует ли правилам Международной номенклатуры название 2-метил-4-бутанол?
- •2. Строение органических соединений
- •Вопрос 16. Как можно охарактеризовать понятие: строение органических соединений?
- •Вопрос 22. Что такое конфигурация молекулы?
- •Вопрос 23. Что такое конформация молекулы?
- •Вопрос 24. Что такое гомологический ряд?
- •Вопрос 25. Как написать формулу гомолога бутановой кислоты, имеющего на два атома углерода больше?
- •Вопрос 26. Как написать формулу гомолога бутаналя, имеющего на четыре атома водорода меньше?
- •Вопрос 27. Как написать формулу изомера пентановой кислоты по строению углеродной цепи?
- •Вопрос 28. Как написать формулу изомера 1-пентена по положению кратной связи?
- •Вопрос 29. Как написать формулу изомера бутаналя по функциональной группе?
- •Вопрос 31. Как определить, к какому типу изомеров относятся олеиновая и элаидиновая кислоты?
- •Вопрос 32. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: бутановая кислота и метиловый эфир пропановой кислоты?
- •Вопрос 33. Как определить, к какому типу изомеров относятся соединения: 1-бутанол и 2-бутанол?
- •Вопрос 34. Как определить, являются ли изомерами лейцин и изолейцин?
- •3. Общие закономерности реакционной способности органических соединений
- •Вопрос 35. Как определить, какой тип реакций наиболее характерен для соединений, относящихся к тому или иному классу органических соединений?
- •Вопрос 36. Как по уравнению реакции определить, к какому типу химических реакций она относится?
- •Вопрос 37. Как правильно написать уравнение реакции и определить её механизм?
- •Вопрос 38. Какой продукт преимущественно образуется в результате реакции бромирования 3-метилпентана?
- •Вопрос 39. Назовите продукт взаимодействия 2-бутеновой кислоты с бромоводородом в присутствии перекиси и без неё.
- •Вопрос 40. В процессе метаболизма в живых организмах фумаровая кислота превращается в яблочную. Каким путем можно получить яблочную кислоту из фумаровой in vitro?
- •Вопрос 41. R-2-бромбутан может реагировать с водным раствором гидроксида натрия по механизмам sn1 и sn2. Опишите стереохимический результат реакции в каждом случае.
- •Вопрос 44. Каков внешний эффект взаимодействия олеата натрия с бромной водой?
- •4. Аминокислоты, пептиды, белки
- •Вопрос 45. Какие соединения относятся к - аминокислотам? Какова роль -аминокислот в функционировании живых организмов?
- •Вопрос 46. Как построить формулы стереоизомеров (энантиомеров) -аминокислот? Все ли природные -аминокислоты оптически активны?
- •Вопрос 47. Как проявляются кислотно-основные свойства и амфотерность -аминокислот? Какие свойства -аминокислот обуславливает их ионное строение?
- •Вопрос 48. Как определить, какую реакцию среды имеют растворы -аминокислот в дистиллированной воде?
- •Вопрос 49. Что такое «изоэлектрическая точка - аминокислоты»? Каким образом - аминокислоты перемещаются в электрическом поле?
- •Вопрос 51. С помощью какой реакции можно превратить изолейцин в 3-метил-2-пентеновую кислоту? а серин в 2- аминоэтанол?
- •Вопрос 53. Какие соединения образуются при взаимодействии в организме валина и пировиноградной кислоты?
- •Вопрос 54. Что представляют собой пептиды? в чём состоит их отличие от белков? в результате каких реакций образуются пептиды в организме?
- •Вопрос 56. Охарактеризуйте первичную, вторичную, третичную и четвертичную структуры белков.
- •Вопрос 57. Как классифицируются белки?
- •Вопрос 58. Какие качественные реакции используют для определения аминокислот и белков?
- •Вопрос 59. Можно ли с помощью ксантопротеиновой реакции (с азотной кислотой) отличить фенилаланин от тирозина? Если да, то в чем будет состоять различие? Если нет, объясните, почему.
- •Литература
Вопрос 37. Как правильно написать уравнение реакции и определить её механизм?
Ответ. Чтобы выполнить это задание, необходимо во-первых, знать классификацию органических соединений и уметь писать их формулы (см. вопр. 1, 9-11), а во-вторых, выучить отличительные признаки реакций разного типа (см. вопр. 35, 36).
Допустим, нам надо написать реакцию между 2-бутеновой кислотой и водородом. В первую очередь запишем формулы субстрата и реагента: СН3–СН=СН–СООН и Н2
Рассмотрим строение молекулы субстрата. В состав молекулы входит карбоксильная группа (это кислота) и углеводородный радикал, содержащий двойную связь (бутЕновая, а не бутАновая кислота). Для непредельных соединений наиболее характерны реакции присоединения по кратной связи. Следовательно, наиболее вероятно в этом случае протекание реакции присоединения водорода по двойной связи. При этом -связь разрывается, атомы водорода присоединяются к второму и третьему атомам углерода:
СН3–СН=СН–СООН + Н2 СН3–СН2–СН2–СООН
Продукт реакции – бутановая кислота.
Легче всего в таких соединениях атаковать електронную плотность -связи, следовательно, атакующая частица должна быть заряжена положительно. Таким образом, механизм этой реакции – электрофильное присоединение. Эту реакцию можно также отнести к реакциям восстановления, по частным признакам – это гидрирование.
Рассмотрим ещё один пример. Попробуем написать реакцию между бромэтаном и водным раствором гидроксида натрия и определить, по какому механизму она протекает.
Напишем формулы реагирующих веществ: CH3–CH2Br и NaOH
Рассмотрим строение молекулы бромэтана. Атом брома более электроотрицателен, чем атом углерода. Следовательно, связь углерод-бром поляризована, причём на атоме углерода локализуется частичный положительный заряд. Значит, атака должна осуществляться отрицательно заряженным реагентом. И такая отрицательно заряженная частица присутствует в растворе: это гидроксил-анион ОН–, образующийся при диссоциации гидроксида натрия в воде. Этот анион атакует атом углерода, несущий частичный положительный заряд и вылесняет из молекулы бромэтана анион брома. Следовательно, происходит реакция нуклеофильного замещения с образованием этанола:
CH3–CH2Br + NaOH CH3–CH2OH + NaBr
Вопрос 38. Какой продукт преимущественно образуется в результате реакции бромирования 3-метилпентана?
О
твет.
Все атомы углерода в 3-метилпентане
находятся в состоянии sр3-гибридизации.
В молекуле имеются только неполярные
С–С и малополярные С–Н -связи.
Это обусловливает участие их в реакциях
радикального замещения SR,
которые являются региоселективными:
при наличии первичных, вторичных и
третичных атомов углерода бромирование
проходит преимущественно у третичного
атома (наименьшая прочность связи С–Н
и наиболее устойчивое промежуточное
соединение – третичный радикал).
Следовательно, преимущественным
продуктом реакции является
3-бром-3-метилпентан.
Вопрос 39. Назовите продукт взаимодействия 2-бутеновой кислоты с бромоводородом в присутствии перекиси и без неё.
Ответ. Электрофильное присоединение галогеноводородов происходит по правилу Марковникова: атомы водорода присоединяются преимущественно к наиболее гидрогенизированному атому углерода. Так, например, при взаимодействии пропена с хлороводородом образуется преимущественно 2-хлорпропан.
СН3СН=СН2 + НВr СН3СНВr–СН3
пропен 2-бромпропан
Однако в 2-бутеновой кислоте оба атома углерода, связанных двойной связью, имеют равное число атомов водорода. В этом случае применяют правило Марковникова в более общей формулировке: присоединение несимметричного реагента к несимметричному алкену по ионному механизму протекает в направлении образования более устойчивого катиона.
К электронной плотности -связи в первую очередь подходит положительно заряженная частица Н+. В результате присоединения иона водорода к двойной связи кислоты СН3СН=СНСООН могут возникнуть два карбокатиона:
СН3+СН–СН2СООН (I) и СН3СН2+СНСООН (II)
В катионе (I) рядом с положительно заряденным атомом углерода присутствует электронодонорная метильная группа, обладающая положительным индуктивным эффектом, что приводит к делокализации положительного заряда и стабилизации катиона. В катионе (II) метильная группа расположена дальше, её эффект ощущается слабее (индуктивный эффект по цепи затухает). Электронокцепторная карбоксильная группа за счёт своего отрицательного индуктивного эффекта, напротив, дестабилизирует катион; но в катионе (I) она находится дальше и её дестабилизирующее действие ощущается заметно меньше, чем во вторичном катионе (II). В результате распределение заряда в катионе (I) более равномерное; такая частица оказывается более устойчивой, реакция идет по пути, направляемому ее образованием. Присоединение фактически следует правилу Марковникова в его обобщенной форме:
СН3СН=СНСООН + НВr СН3СНВrСН2СООН
2-бутеновая кислота 3-бромбутановая кислота
В присутствии перекиси реакция присоединения идёт по радикальному механизму и не подчиняется правилу Марковникова (идёт против правила Марковникова):
СН3СН=СН2 + НВr(в прис. Н2О2) СН2ВrСН2СН3
пропен 1-бромпропан
СН3СН=СНСООН + НВr(в прис. Н2О2) СН3СН2СНВrСООН
2-бутеновая кислота 2-бромбутановая кислота