- •5. Шляхи утворення та знешкодж аміаку в орг-змі.
- •Фумарат
- •Сукцинил-КоА
- •8. Обмін сірковмісних ам-кислот; реакції метилування. Біосинтез та біолог. Роль креатину і креатинфосфату.
- •Спадкові ензимопатії обміну циклічних ам-кислот - фенілаланіну та тирозину.
- •Обмін циклічної ам-кислоти Трп та його спадкові ензимопатії.
- •Метаболізм порфіринів: будова гему, схема реакцій біосинтезу протофірину іх та гему. Спадкові порушення біосинтезу порфіринів, типи порфірій.
- •21.Транскрипція рнк: рнк-полімерази прокаріотів та еукаріотів,сигнали транскрипції (промоторні,ініціаторні та термінаторні ділянки геному).
- •22.Процесинг-посттранскрипційна модифікація новосинтезованих мРнк.
- •19.Реплікація днк:біологічне значення; напівконсервативний механізм реплікації.
- •20.Послідовність етапів та ферменти реплікації днк у прокаріотів та еукаріотів.
- •23.Генетичний код
- •24. Основнi компоненти синтезу бiлка
- •27.Інгібітори транскрипції та трансляції у прокаріотів та еукаріотів: антибіотики та інтерферони - їх застосування у медицині;дифтерійний токсин.
- •28.Регуляція експресії генів прокаріотів: регуляторні та структурні ділянки лактозного (Lac-) оперону (регуляторний ген,промотор,оператор).
- •29.Мутації: геномні,хромосомні,генні; механізми дії мутагенів; роль індукованих мутацій у виникненні ензимопатій та спадкових хвороб людини.
- •30.Біологічне значення та механізми репарації днк. Репарація уф-індукованих генних мутацій:пігментна ксеродерма..
- •34,Синтез,секреція і транспорт гормонів.Механізм регуляції секреції гормонів за принципом позитивного та негативного зворотного зв’язку. Приклади.
- •35. Мішені гормональної дії
- •80. Небілкові органічні сполуки плазми крові. Неорганічні компоненти плазми.
Метаболізм порфіринів: будова гему, схема реакцій біосинтезу протофірину іх та гему. Спадкові порушення біосинтезу порфіринів, типи порфірій.
Гемоглобін -хромопротеїн, містить хімічний елемент залізо, — гем. Гемоглобін є тетрамером, тобто складається з чотирьох субодиниць. У дорослої людини вони представлені поліпептидними ланцюгами α1, α2, β1 і β2.
Гем є комплексом протопорфірину IX, що відноситься до класу порфіринових сполук, з атомом заліза(II). Ця простетична група нековал зв'язується з гідрофобною западиною молекул гемоглобіну і міоглобіну. Залізо(II) зв'язується з шістьма лігандамі. Чотири з них представлені атомами азоту порфіринового кільця, що лежать в одній площині. Дві інших координаційних позиції лежать на осі, перпендикулярній площині порфіринуВсього в гемоглобіні чотири ділянки зв'язування кисню (один гем на кожну субодиницю), тобто одночасно може бути зв'язано чотири молекули кисню на комплекс гемоглобіну.Синтез гему - багатостадійний лінійний процес, котрий має різні відгалуження. Порушення окремої ланки в цьому процесі може призвести до накопичення в організмі проміжних продуктів синтезу гему - порфіринів та їх похідних. Джерелом порфіринів може бути порушення синтезу інших гемпротеїнів - цитохромів, пероксидаз та інших продуктів розпаду гемоглобіну в кишковому тракті, які всмоктуються і потрапляють до кровообігу.
Порфірії - дефекти метаболізму порфіринів, які супроводжуються накопиченням і виведенням із сечею або фекаліями порфіринів та їх похідних. Деякі форми порфірій є успадкованими, інші - набутими. Успадковані форми поділ на три великі групи - еритропоетичні, печінкові й форми, за яких порушення метаболізму спостерігаються одночасно в еритропоетичній і печінковій тканинах.Первинне порушення може виникати у печінці (печінкова порфирія) або у кістковому мозку (еритропоетична порфирія); іноді воно може розвиватись в обох цих органах.
Біосинтез пуринових нуклеотидів: схема реакцій синтезу ІМФ; утворення АМФ та ГМФ; механізми регуляції. Синтез пуриновых нуклеотидов происходит путем сборки пуринового кольца на рибозо-5-фосфате. Пуриновое кольцо собирается из мелких фрагментов, которые поставляются различными соединениями: Глн, Гли, Асп, СО2, N5, N10-метенилтетрагидрофолат, N10-формилтетрафол.
CО2
N
Глицин
А
спартат
N N5,
N10-метенилтетра- гидрофолат
N
10-формил-
тетрафолат
N NH
глутамин
Синтез пуриновой циклической структуры – это сложный процесс. По сложности и числу промежуточных продуктов он сопоставим с важнейшими метаболическими процессами, н.р., гликолизом. Исходными соединениями при синтезе пуринов служит активированная форма рибозы – фосфорибозил–пирофосфат (ФРПФ). Далее происходят синтез и замыкание гетероцикла с участием вышеперечисленных соединений и образуется пуриновый нуклеотид инозиновой кислоты (ИМФ). Из ИМФ синтезируются адениловые и гуаниловые пуриновые нуклеотиды:
А
МФ
(аденилат) – при присоединении NН2–группы
аспартат в 6–м положении
И
МФ
ГМФ (гуанилат) – при окислении с после–дующим присоединением NН2–группы глутамина во 2-м положении
Схема синтеза пуриновых нуклеотидов из ИМФ представлена ниже.
Рибозо-5-ф
АТФ,
ГТФ
ФРПФ
И МФ,АМФ,
ГМФ
ИМФ
Аспартат
Н2О
ГТФ
НАД
Г
ДФ+Фн
НАДН2
-
- -
Аденилосукцинат Ксантинмонофосфат
АТФ
глутамин -
АМФ+Фн глутамат
Фумарат
АМФ
ГМФ
АТФ
АТФ
АДФ
2
АДФ
ГДФ
АТФ
АДФ
АТФ ГТФ
Синтез пуриновых нуклеотидов регулируется ключевыми ферментами, активность которых зависит от концентрации конечных и некоторых промежуточных продуктов, т.е. при контроле синтеза реализуется один из механизмов - регуляция по принципу отрицательной обратной связи: 1)АТФ, ГМФ ингибируют образование ФРПФ (угнетают активность 5–фосфорибозил–1–пирофосфатсинтазы);2)ИМФ, АМФ, ГМФ – ингибируют образование фосфорибозиламина - это наиболее важный пункт контроля (угнетают активность глутамин–ФРПФ–амидотрансферазы);3) АМФ ингибирует образование аденилосукцината, который является промежуточным продуктом его синтеза, а ГМФ-ксантинмонофосфата;4)АМФ ингибирует образование ксантинмонофосфата при синтезе ГМФ, а ГМФ, в свою очередь, угнетает образование аденилосукцината, который является промежуточным продуктом синтеза АМФ. Т.о. изменения концентрации АМФ влияют на синтез ГМФ и наоборот;5)АТФ может активировать процессы синтеза ГМФ также на этапе образования ксантинмонофосфата, а ГТФ - активировать образование аденилосукцината.
Біосинтез піримідинових нуклеотидів: схема реакцій; регуляція синтезу.Синтез пиримидиновых нуклеотидов начинается со сборки кольца азотистого основания, которое затем присоединяется к рибозо-5-фосфату. Донором является ФРПФ. Предшественниками пиримидинового кольца служат карбамоилфосфат и аспартат. Синтез начинается с образования карбамоилфосфата, который синтезируется в цитозоле. Донором азота при синтезе карбомаилфосфата является глутамин.. Реакцию катализирует карбомаилфосфатсинтаза ІІ:Глутамин + 2 АТФ + СО2 карбамоилфосфат + 2 АДФ + Фн+ глутамат.
Следующий этап – образование N–карбамоиласпартата .(фермент – аспартат–карбамоилтрансфераза – АТКаза)
H 2N-CО-O-PO3H2 + H2N-CH-COOH H2N-CО-NH-CH- СООН
к арбамоилфосфат - Фн
CH2 CH2
COOH COOH
аспартат N–карбамоиласпартата
В следующей последовательности реакций образуется предшественник всех пиримидиновых нуклеотидов - УМФ:
Н2О
N
–карбамоиласпартат
Дигидрооротат
дигидрооротаза
дигидро–
НАД оротат–
НАДН++ Н дегидроге–
наза
Оротат
ФРПФ
оротат–
фосфо–
ФФ н рибозил–
транс–
фераза
ОМФ
оротидилат–
Н+ декарбокси–
СО2 лаза
УМФ
С участием молекул АТФ под действием специфических киназ (УМФ–киназа, нуклеозид–фосфаткиназа) УМФ превращается в УТФ. УТФ служит предшественником ЦТФ:
глутамин + глутамат +
АТФ + Н2О АДФ + Фн+ 2Н+
У
ТФ
ЦТФ
Регуляция синтеза пуриновых нуклеотидов.Ключевыми ферментами процесса являются карбамоилфосфатсинтаза II (1) и АТКаза (2), схема регуляции которых изображена ниже:
(1)
С
О2
+ глутамин + 2АТФ
карбамоилфосфат
аспартат
УМФ, УТФ (2) ЦТФ
карбамоиласпартат
УМФ
У ТФ
ЦТФ
В регуляции 2 реакция – решающий этап. ЦТФ значительно снижает сродство фермента АТКазы к субстрату (степень ингибирования до 90%). Активация этого фермента происходит под действием АТФ, что позволяет координировать скорости образования пуринов и пиримидинов.
Біосинтез дезоксирибонуклеотидів. Утворення тимідилових нуклеотидів; інгібітори біосинтезу дТМФ як протипухлинні засоби. Дезоксирибонуклеотиды образуются из рибонук–леотиддифосфатов путем их восстановления во 2'–положении. Фермент, который катализирует эту реакцию, – рибонуклеозидредуктаза (рибонуклеотиддифосфатредук–таза).
Общая реакция:Рибонуклеозиддифосфат + НАДФН+Н+ дезоксири–бонуклеозиддифосфат + НАДФ+ + Н2О
Электроны при восстановлении переносятся на субстрат через ряд сульфгидрильных групп, для этого в реакции участвует тиоредоксин (белок с близко расположенными SH-группами). При переносе электронов происходит окисление тиоредоксина. После реакции образования дезоксирибонуклеозиддифосфата он восстанавливается с участием НАДФН под действием тиоредоксинредуктазы
S
SH
Т
иоредоксин
+ НАДФН+Н+
тиоредоксин + НАДФ
S SH
Образование тимидиновых нуклеотидов (ТМФ) происходит из УМФ:
УДФ
Фн ТГФК ДГФК
д
УДФ
дУМФ дТМФ
тимидилатсинтаза
Далее происходит восстановление дигидрофолевой кислоты (ДГФК) до тетрагидрофолевой кислоты (ТГФК ) под действием дигидрофолатредуктазы:
Д
ГФК
ТГФК
НАДФН НАДФ
После образования дТМФ с участием АТФ происходит последующий синтез всех остальных тиминовых нуклеотидов:
дТМФ
дТДФ дТТФ
АТФ АДФ АТФ АДФ
Основной механизм контроля синтеза - аллостерическая регуляция. Ключевой фермент – рибонуклеозидредуктаза.
При синтезе дАТФ ингибитор этого фермента – дАТФ (конечный продукт), активатор – АТФ.Если синтезируется дТТФ, то в регуляции процесса также реализуется принцип отрицательной обратной связи. Т.е. рибонуклеотидредуктаза имеет несколько конформацион–ных состояний, что обеспечивает синтез достаточного количества всех четырех дезоксирибонуклеотидов.
Катаболізм пуринових нуклеотидів; спадкові порушення обміну сечової кислоти. Схема катаболізму піримідинових нуклеотидів.В организме человека нет ферментов, необходимых для разрыва пуринового кольца. Потому избыток пуринов выводится из организма человека неразрушенным, в виде мочевой кислоты. В печени свободные пуриновые основания (экзогенного и эндогенного происхождения) подвергаются дезаминированию с образованием ксантина и гипоксантина.
ГМФ АМФ
рибозо-ф
Г
уанин
ИМФ
рибозо-ф
гипоксантин
ксантин
мочевая кислота
за сутки образуется до 1,5 г мочевой кислоты, которая выводится в основном с мочой. 60% этого количества образуется при катаболизме эндо–генных пуринов, остальная – пуринов пищи. В сыворотке крови концентрация мочевой кислоты, которая находится в виде солей - уратов (на 98% с Na), – 0,18–0,42 ммоль/л. Ураты выводятся на 2/3 почками и на 1/3 через тонкий кишечник. Соли мочевой кислоты в крови не кристаллизуются. В тканях и моче ураты кристаллизуются при меньших концентрациях. Наибольшее сродство к уратам имеют хрящевая ткань и почки.Главный клинический синдром нарушения пуринового обмена – подагра. Для лечения -аллопуринол - структурный аналог гипоксантина, который ингибирует ксантиноксидазу. Для повышения экскреции уратов назначают также пробенецид. синдром Леша–Нихана. наследственное заболевание- дефект одного из ферментов реутилизации пуриновых азотистых оснований - гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансферазы. У больных детей наблюдаются симптомы подагры, церебральные параличи, нарушения интеллекта, попытки наносить себе увечья (укусы губ, пальцев).
Катаболизм пиримидиновых нуклеотидов.. Сначала происходит расщепление нуклеотидов до азотистых оснований с последующей их деградацией до -аланина, -аминоизобутирата, СО2 и NH3:
дТМФ Тимидин Тимин
СО2 , NH3 –аминоизобутират
Цитозин Урацил
метилмалонат
-аланин
метилмалонил-КоА
Ц
ЛК
сукцинил-КоА
Таким образом, конечными продуктами расщепления пиримидиновых нуклеотидов являются: -аланин, -аминоизобутират, СО2 и NH3. СО2 и NH3 идут на синтез мочевины, а -аминоизобутират может метаболизировать аналогично аминокислотам с разветвленной цепью.
