
- •Практикум по микробиологии
- •Часть 2. Микробиоценозы природных экосистем
- •Тема 1 микроорганизмы как часть экосистемы. Методы изучения микроорганизмов, входящих в состав микробиоценозов. Определение омч (кмафанм).
- •Микробиоценозы как часть экосистемы
- •Способы существования микроорганизмов в составе микробиоценоза
- •Методы изучения микроорганизмов, входящих в состав микробиоценозов
- •Идентификация микроорганизмов возможна при использовании системы классификации. Принципы современной систематики и классификации бактерий.
- •Определение общего микробного числа
- •Методика определения общего числа микроорганизмов омч (количества мафАнМ) бактериологическим методом
- •Методика выявления и определения количества термофильных и психрофильных микроорганизмов
- •Нормальная микрофлора кожи
- •Нормальная микрофлора дыхательных путей
- •Микрофлора разных отделов полости рта
- •Нормальная микрофлора пищевода
- •Микрофлора желудка
- •Микрофлора толстого кишечника
- •Микробиоценоз мочеполовой системы
- •Представители микробиоценоза организма человека и животных
- •Грамположительные кокки
- •Тема 3. Энтеробактерии
- •Коринебактерии, бактероиды, микобактерии
- •Модуль 6. Микрофлора пищевых продуктов и кормов.
- •Источники и пути обсеменения пищевых продуктов микроорганизмами
- •Особенности пищевых продуктов как среды обитания микроорганизмов
- •Особенности санитарно-микробиологического исследования пищевых продуктов
- •Тема 6 аэробные микроаэрофильные палочки и кокки семейств псевдомонады и ацетобактерии
- •Тема 7 молочнокислые палочки и кокки. Бифидобактерии.
- •Характеристика молочнокислых бактерий
- •Практическое значение молочнокислого брожения и молочнокислых микроорганизмов
- •Тема 8 Патогенные микроорганизмы в пищевых продуктах и кормах – листерии и иерсинии
- •Выявление и идентификация l. Monocytogenes при санитарно-микробиологических исследованиях
- •Выявление и идентификация Yersinia enterocolitica и Yersinia pseudotuberculosis
- •1 Этап. Предварительное холодовое обогащение в неселективной жидкой среде.
- •3 Этап. Выявление характерных колоний.
- •Санитарно-показательные микроорганизмы
- •Тема 9. Микробиоценозы объектов внешней среды Микрофлора воздуха. Санитарно-микробиологическое исследование воздуха.
- •Микрофлора воздуха
- •Санитарно-микробиологические исследования воздуха
- •Седиментационный метод (метод оседания) по Коху.
- •Аспирационный метод
- •Фильтрационный метод
- •Тема 10. Микроэкологические методы исследования почвы. Свободноживущие и симбиотические микроорганизмы почвы: – обитатели почвы
- •Условия обитания микроорганизмов в почве.
- •Антропогенное воздействие на почву
- •Экологические методы бактериологического исследования почвы.
- •Почвенные микроорганизмы, принимающие участие в круговороте азота
- •Свободноживущие и симбиотические азотфиксаторы семейств
- •Свободноживущие автотофные серо- железо- и марганецокисляющие почвенные бактерии
- •Грамположительные, не образующие спор палочки неправильной формы, род Arthrobacter.
- •Тема 11 санитарно-микробиологические методы бактериологического исследования почвы. Почвенные бациллы
- •Санитарно-микробиологическое исследование почвы
- •Бациллы
- •Сибирская язва
- •Диагностика сибирской язвы.
- •Тема 12 клостридии. Фузобактерии.
- •Ботулизм
- •Профилактика ботулизма
- •Столбняк
- •Газовая гангрена
- •Фузобактерии
- •Тема 13 обитатели почвы - актиномицеты и родственные им микроорганизмы
- •Тема 14 свободноживущие водные микроорганизмы – автотрофы
- •Тема 15 санитарно-микробиологическое исследование воды
- •Санитарно-микробиологическое исследование воды
- •Тема 16 водные микроорганизмы возбудители болезней
Тема 10. Микроэкологические методы исследования почвы. Свободноживущие и симбиотические микроорганизмы почвы: – обитатели почвы
Цель занятия.
1.Ознакомить студентов с основными биологическими свойствами свободноживущих и симбиотических микроорганизмов почвы: азотфиксаторов семейств Azotobacteriaceae, Rhizobiaceae. хемолитотрофных сероокисляющих, железо- и марганецокисляющих бактерий.
2.Освоить микроэкологические методы бактериологического исследования почвы.
Материалы и оборудование:
Набор готовых красок во флаконах в штативе, йодированный спирт, раствор Люголя, дистиллированная вода, предметные стекла, фильтровальная бумага, бактериологические петли, пинцеты, пробирки с микробными культурами в штативе. Микроскопы. Пробирки и чашки Петри с характерным ростом изучаемых микроорганизмов на питательных средах.
Методические указания.
ЛЕКЦИОННЫЙ МАТЕРИАЛ
Условия обитания микроорганизмов в почве.
Почва является благоприятной средой для обитания и размножения различных микроорганизмов. По количеству и разнообразию видов она является основным резервуаром, откуда микробы поступают в окружающую среду – воздух и воду. Группа почвенных микроорганизмов образует микробные биоценозы почвы и принимает участие в круговороте азота, серы, фосфора и других веществ, минерализации органических отбросов, процессах самоочищения. Существенную роль в формировании микробного биоценоза почвы играют высшие растения, насекомые и животные.
Содержание микроорганизмов в почве зависит от её химического состава, влажности, температуры, кислотности. До 90% микроорганизмов находится в адсорбированном состоянии на поверхности почвенных частиц.
Наиболее богат микроорганизмами слой перегноя, особенно у чернозёмов и каштановых почв. Так, в 1 г чернозема содержится до 3 млрд. клеток микроорганизмов; в бедных органическими веществами подзолистых почвах – от 300 млн до 2 млрд. В песчаных почвах, бедных питательными веществами и влагой, находится до 100 тысяч микроорганизмов. Микроорганизмы располагаются в почве неравномерно. Большая их часть сосредоточена в верхнем слое от 5 до 20 см, а уже на глубине 1 – 2 м количество микроорганизмов резко уменьшается.
Почвы различаются по содержанию воды: слишком сухие и слишком влажные ограничивают рост и развитие микроорганизмов. Оптимальна для большинства микроорганизмов влажность, равная 50-60% максимальной влагоемкости (наибольшего количества воды, которое почва может удерживать). Некоторые, например Clostridium pasteurianum, могут расти при 100 %-й влагоемкости почвы.
Для микроорганизмов важна концентрация солей в почвенном растворе. Засоленные почвы беднее микроорганизмами, однако некоторые грибы родов Aspergillus, Peniclillium хорошо развиваются на субстратах с 20-30% NaCl, некоторые почвенные микроорганизмы развиваются при высоких концентрациях минеральных солей (осмофильные).
Почвенный воздух отличается по составу от атмосферного. Экологически важным компонентом почвенного воздуха является количество СО2, необходимого для автотрофных организмов. При растворении в воде он образует кислоту и, изменяя рН почвы, становится фактором, ограничивающим жизненные процессы микроорганизмов. Например, гриб Rhizoctonia solani погибает при концентрации СО2 10%. Почвенные микроорганизмы очень чувствительны к изменениям рН среды: грибы лучше растут в кислой среде, а бактерии – в нейтральной или слегка щелочной. Изменение рН почвы вызывает изменения в популяциях почвенных микроорганизмов.
Из внешних факторов, существенно влияющих на развитие микроорганизмов в почве, основным является температура. Лучше всего почвенные микроорганизмы развиваются при температуре 15-25оС, но могут встречаться термофильные (оптимум 50°С) и криофильные (психрофильные), развивающиеся при температуре, близкой к 0 оС.
На распределение микроорганизмов в почве влияют корни растений, выделяющие во внешнюю среду органические вещества. На поверхности корней и в прикорневой зоне сосредоточено большое количество микроорганизмов.
Различные виды обработки почв (рыхление, орошение, вспашка, внесение удобрений) способствуют усиленному размножению микроорганизмов, поэтому в окультуренных почвах число их в несколько раз больше, чем в целинных.
Микробиоценозы почвы
В состав биоценоза почвы входят различные микроорганизмы, в том числе автотрофы и гетеротрофы. Среди них имеются свободно живущие азотфиксирующие бактерии рода азотобактер (Azotobacter), клубеньковые бактерии рода ризобиум (Rhisobium), нитрифицирующие бактерии родов нитрозомонас, нитробактер, псевдомонас, грибы, денитрифицирующие бактерии, уробактерии, серо- и железобактерии, актиномицеты, гнилостные микроорганизмы, а также простейшие, бактериофаги и многие другие организмы.
Из микробиологических процессов, происходящих в почве, наибольшее значение имеют минерализация растительных и животных остатков, образование гумуса и его разложение. Минерализация нерастворимых в воде соединений (целлюлозы, гемицеллюлозы) идет медленно, с участием немногих видов, прежде всего грибов.
В плодородном слое почвы могут быть обнаружены микроорганизмы из семейств энтеробактерий (Enterobacteriaceae), псевдомонад (Pseudomonadaceae), бацилл (Bacillaceae) и многих других. Такие микроорганизмы, попав в почву и размножаясь в ней, могут изменить рН в кислую сторону. Тогда в ней начинают особенно активно развиваться молочнокислые бактерии, дрожжи, плесневые грибы. При внесении избыточного количества разлагающихся органических веществ бурно размножаются различные аэробные и анаэробные гнилостные микроорганизмы, в том числе Proteus, Micrococcus, Streptococcus и др.
Изменение количественного и видового состава микробных биоценозов почвы обусловлено также влажностью, временем года, характером и степенью загрязнения.