- •Практикум по микробиологии
- •Часть 2. Микробиоценозы природных экосистем
- •Тема 1 микроорганизмы как часть экосистемы. Методы изучения микроорганизмов, входящих в состав микробиоценозов. Определение омч (кмафанм).
- •Микробиоценозы как часть экосистемы
- •Способы существования микроорганизмов в составе микробиоценоза
- •Методы изучения микроорганизмов, входящих в состав микробиоценозов
- •Идентификация микроорганизмов возможна при использовании системы классификации. Принципы современной систематики и классификации бактерий.
- •Определение общего микробного числа
- •Методика определения общего числа микроорганизмов омч (количества мафАнМ) бактериологическим методом
- •Методика выявления и определения количества термофильных и психрофильных микроорганизмов
- •Нормальная микрофлора кожи
- •Нормальная микрофлора дыхательных путей
- •Микрофлора разных отделов полости рта
- •Нормальная микрофлора пищевода
- •Микрофлора желудка
- •Микрофлора толстого кишечника
- •Микробиоценоз мочеполовой системы
- •Представители микробиоценоза организма человека и животных
- •Грамположительные кокки
- •Тема 3. Энтеробактерии
- •Коринебактерии, бактероиды, микобактерии
- •Модуль 6. Микрофлора пищевых продуктов и кормов.
- •Источники и пути обсеменения пищевых продуктов микроорганизмами
- •Особенности пищевых продуктов как среды обитания микроорганизмов
- •Особенности санитарно-микробиологического исследования пищевых продуктов
- •Тема 6 аэробные микроаэрофильные палочки и кокки семейств псевдомонады и ацетобактерии
- •Тема 7 молочнокислые палочки и кокки. Бифидобактерии.
- •Характеристика молочнокислых бактерий
- •Практическое значение молочнокислого брожения и молочнокислых микроорганизмов
- •Тема 8 Патогенные микроорганизмы в пищевых продуктах и кормах – листерии и иерсинии
- •Выявление и идентификация l. Monocytogenes при санитарно-микробиологических исследованиях
- •Выявление и идентификация Yersinia enterocolitica и Yersinia pseudotuberculosis
- •1 Этап. Предварительное холодовое обогащение в неселективной жидкой среде.
- •3 Этап. Выявление характерных колоний.
- •Санитарно-показательные микроорганизмы
- •Тема 9. Микробиоценозы объектов внешней среды Микрофлора воздуха. Санитарно-микробиологическое исследование воздуха.
- •Микрофлора воздуха
- •Санитарно-микробиологические исследования воздуха
- •Седиментационный метод (метод оседания) по Коху.
- •Аспирационный метод
- •Фильтрационный метод
- •Тема 10. Микроэкологические методы исследования почвы. Свободноживущие и симбиотические микроорганизмы почвы: – обитатели почвы
- •Условия обитания микроорганизмов в почве.
- •Антропогенное воздействие на почву
- •Экологические методы бактериологического исследования почвы.
- •Почвенные микроорганизмы, принимающие участие в круговороте азота
- •Свободноживущие и симбиотические азотфиксаторы семейств
- •Свободноживущие автотофные серо- железо- и марганецокисляющие почвенные бактерии
- •Грамположительные, не образующие спор палочки неправильной формы, род Arthrobacter.
- •Тема 11 санитарно-микробиологические методы бактериологического исследования почвы. Почвенные бациллы
- •Санитарно-микробиологическое исследование почвы
- •Бациллы
- •Сибирская язва
- •Диагностика сибирской язвы.
- •Тема 12 клостридии. Фузобактерии.
- •Ботулизм
- •Профилактика ботулизма
- •Столбняк
- •Газовая гангрена
- •Фузобактерии
- •Тема 13 обитатели почвы - актиномицеты и родственные им микроорганизмы
- •Тема 14 свободноживущие водные микроорганизмы – автотрофы
- •Тема 15 санитарно-микробиологическое исследование воды
- •Санитарно-микробиологическое исследование воды
- •Тема 16 водные микроорганизмы возбудители болезней
Способы существования микроорганизмов в составе микробиоценоза
В среде обитания микроорганизмы могут находиться как в свободном (взвешенном в воде), так и в прикрепленном состоянии. При этом значительно отличаются физическое окружение и поведение микробных клеток.
В свободном состоянии пребывают, в основном, молодые, активно подвижные микроорганизмы в стадии расселения.
Ассоциации микроорганизмов, оформленные структурно, называются консорциумами. В них складываются тесные пространственные связи, выражающиеся в физическом контакте клеток и образовании такой интегрирующей структуры как матрикс. В природных местообитаниях большинство микроорганизмов предпочитают расти в прикрепленном состоянии, так как на границе раздела фаз концентрация веществ обычно выше из-за их адсорбции.
Прикрепление нитчатых форм к твердым поверхностям с образованием косм можно наблюдать в текучих водах. При этом один конец нити с помощью специальных структур закрепляется на твердом субстрате, а другой свободно колышется в текущей воде.
Более сложное образование называется биопленкой. Формирование биопленки начинается с образования монослоя из клеток одного вида, обладающего высокими адгезивными свойствами. Слизистые выделения этих клеток способствуют прикреплению других микроорганизмов. В зависимости от особенностей обитания микроорганизмов (свет, наличие питательных веществ и скорости диффузии) структура биопленки может усложняться.
Могут образоваться слои, представленные различными типами микроорганизмов, микроколонии и смешанные клеточные агрегаты. Такая сложная пленка развивается как трехмерная структура, компоненты которой связаны внутренними порами и сквозными каналами.
Биопленка может разрастаться до макроскопического размера, образуя микробный мат. Иногда слои микроорганизмов имеют различный цвет, и тогда структура мата видна невооруженным глазом. Такие маты часто формируются на поверхности камней или осадков в сверхсоленых и пресноводных озерах, лагунах, горячих источниках и морских прибрежных областях. Состояние клеток в биопленках значительно отличается от состояния свободноживущих клеток. В составе агрегатов микроорганизмы находятся в тесном соседстве и погружены в матрикс.
Матрикс – это продукт жизнедеятельности микробного сообщества, состоящий из поверхностных клеточных структур и экзометаболитов, в основном, полисахаридной природы. Он является средой обитания клеток и выполняет определенные функции в сообществе. Физико-химические условия матрикса отличаются от условий в водных растворах. Матрикс ограничивает поступление из окружающей среды вредных факторов и концентрирует в себе питательные вещества, продукты обмена и сигнальные молекулы. Поступление веществ к клеткам осуществляется не только путем диффузии, но и через каналы и поры в матриксе. В разных частях агрегата, состоящего даже из микроорганизмов одного вида, клетки находятся в различном физиологическом состоянии из-за разницы в притоке питательных веществ. Ограниченность пространства и тесное соседство микробных клеток в составе агрегатов приводит к более быстрому обмену продуктами жизнедеятельности. Матрикс не только пространственно удерживает микробные клетки, но и связывает их между собой. Сохранение формы под действием внешних нагрузок позволяет ему защищать клетки от механических повреждений и «смягчать» колебания физико-химических факторов, обеспечивая стабильное микроокружение.
Матрикс способствует дифференциации клеток внутри популяции и может обеспечивать «коллективные» реакции - «чувство кворума». По достижении определенной плотности клеток в ограниченном пространстве матрикса накапливается сигнальное вещество, действующее на все клетки популяции и приводящее к «коллективному» ответу. В сообществе, содержащем несколько видов микроорганизмов, реакции будут значительно более сложными.
