
- •Предисловие
- •Введение
- •Глава 1. Питание микроорганизмов
- •1.1. Транспорт веществ в клетку бактерий
- •1.2. Автотрофные способы питания микроорганизмов
- •1.3. Ассимиляция со2 хемогетеротрофными микроорганизмами
- •Глава 2. Метаболизм микроорганизмов
- •2.1. Общая характеристика типов метаболизма
- •2.2. Общая характеристика энергетического метаболизма
- •2.2.1. Аэробное дыхание
- •2.2.2. Процессы анаэробного дыхания
- •Нитратное дыхание, или денитрификация
- •Сульфатное дыхание, или диссимиляционная сульфатредукция
- •Серное дыхание
- •Карбонатное дыхание
- •Анаэробное дыхание с использованием в качестве акцепторов электронов других неорганических ионов
- •Фумаратное дыхание и другие типы анаэробного дыхания с использованием органических веществ в качестве акцепторов электронов
- •2.2.3. Процессы брожения
- •Спиртовое брожение
- •Молочнокислое брожение
- •Маслянокислое и ацетонобутиловое брожение
- •Пропионовокислое брожение
- •Брожение смешанного типа, или муравьинокислое брожение
- •2.2.4. Неполное окисление органических веществ микроорганизмами
- •2.2.5. Разложение микроорганизмами природных высокополимерных органических соединений
- •Разложение целлюлозы
- •Разложение гемицеллюлоз
- •Разложение крахмала и других глюканов
- •Разложение лигнина
- •Разложение пектиновых веществ
- •Разложение хитина и хитозана
- •2.2.6. Использование белков микроорганизмами
- •Аэробное расщепление аминокислот
- •Сбраживание аминокислот микроорганизмами
- •2.2.7. Использование микроорганизмами азотистых оснований
- •Анаэробное разложение (сбраживание) азотистых оснований
- •Аэробное окисление азотистых оснований
- •2.2.8. Окисление липидов и фосфолипидов микроорганизмами
- •2.2.9. Разложение углеводородов микроорганизмами
- •Разложение алканов (парафинов) микроорганизмами
- •Разложение ароматических углеводородов (аренов) микроорганизмами
- •2.2.10. Разложение ксенобиотиков микроорганизмами
- •2.2.11. Окисление неорганических соединений бактериями
- •Процесс нитрификации
- •Окисление восстановленных соединений серы
- •Окисление ионов железа
- •Окисление молекулярного водорода
- •Окисление оксида углерода
- •2.2.12. Использование микроорганизмами одноуглеродных соединений
- •2.2.13. Использование микроорганизмами солнечной энергии
- •Фотосинтез у прокариот
- •Глава 3. Конструктивный метаболизм микроорганизмов
- •3.1. Биосинтез аминокислот
- •3.2. Биосинтез нуклеотидов
- •3.3. Биосинтез липидов
- •3.4. Биосинтез углеводов
- •3.5. Биосинтез пептидогликана
- •Глава 4. Фиксация молекулярного азота (азотфиксация, диазотрофия) микроорганизмами
- •4.1. Биохимия азотфиксации
- •Глава 5. Биолюминесценция бактерий
- •Глава 6. Регуляция метаболизма у бактерий
- •6.1. Регуляция активности ферментов
- •6.2. Регуляция на уровне генов, или регуляция синтеза ферментов
- •Литература
- •Оглавление
Разложение гемицеллюлоз
Гемицеллюлозы представляют собой второй после целлюлозы наиболее важный источник углеводов в природе. Они входят в состав растительных клеточных стенок. По химическому строению это слаборазветвленные гомо- или гетерополимеры из остатков ксилозы, маннозы, глюкозы и галактозы (все в D-форме), соединенных β-гликозидными связями (β-1,4, β-1,6, β-1,3 и др.); их цепи содержат заместители различной природы (ацетиловые или метиловые эфиры, уроновые кислоты, другие пентозы). Гемицеллюлозы различного происхождения различаются по типам связей между остатками сахаров и степени ветвления. Наиболее распространены среди гемицеллюлоз ксиланы, маннаны и галактаны, содержащие в качестве основных мономеров D-ксилозу, D-маннозу и D-галактозу соответственно. Мономеры в них соединены β-1,4-гликозидной связью. Ксилан можно рассматривать как аналог целлюлозы (ксилан отличается тем, что в нем β-D-ксилоза вместо СН2–ОН-группы в положении 6 содержит водородный атом), но с меньшей степенью полимеризации и наличием ветвления. Кроме ксилозы, ксилан содержит остатки арабинозы, глюкозы, галактозы и глюкуроновой кислоты.
Ксиланы и другие гемицеллюлозы сравнительно легко гидролизуются, поэтому способность к использованию гемицеллюлоз широко распространена среди микроорганизмов. Для полного гидролиза гемицеллюлоз требуется набор различных ферментов. Например, в расщеплении ксилана принимают участие эндо-β-1,4-ксиланаза, гидролизующая основную цепь, и β-ксилозидаза (экзогликозидаза), последовательно отщепляющая остатки D-ксилозы от нередуцирующего конца цепи. Активность гемицеллюлазного комплекса определяют по скорости накопления редуцирующих сахаров (ксилозы или ксилобиозы). Установлено, что у бактерий, использующих преимущественно ксиланы (например, у видов рода Clostridium) ксиланаза синтезируется конститутивно; у других микроорганизмов ее синтез индуцируют ксиланы.
Гемицеллюлозы активно разлагаются грибами, аэробными и анаэробными бактериями. В этом процессе участвует значительно большее количество видов микроорганизмов, чем в разложении целлюлозы. К микроорганизмам, обладающим гемицеллюлозоразлагающими свойствами, относятся бактерии родов Clostridium, Bacillus, Cytophaga, Sporocytophaga, Vibrio, Streptomyces; грибы родов Aspergillus, Rhizopus, Fomos, Polyporus и др. Гемицеллюлозы в кислых почвах обычно разлагают грибы, в нейтральных и щелочных – бациллы, бактерии рода Sporocytophaga и ряд других бактерий.
Разложение крахмала и других глюканов
Крахмал является основным запасным веществом растений и представляет собой полимер α-D-глюкозы. Растительный крахмал состоит из двух глюканов – амилозы и амилопектина. Амилоза – это полимер в виде длинной неразветвленной цепи, в которой остатки D-глюкозы соединены α-1,4-гликозидными связями. Цепи амилозы спирально закручены и могут содержать от нескольких сотен до нескольких тысяч остатков глюкозы. Амилопектин состоит из амилозных фрагментов, связанных α-1,6-гликозидными связями. Цепи амилопектина сильно разветвлены. Амилоза и амилопектин способны связывать йод, при этом амилоза окрашивается в синий цвет, а амилопектин – в красно-фиолетовый или коричневый. Глюкан гликоген состоит из более разветвленных цепей и при добавлении йода окрашивается в коричневый цвет. Поллулан – линейный полимер из остатков мальтотриозы, соединенных α-1,6-гликозидными связями. Поллулан синтезируется дрожжеподобным грибом Aureobasidium pollulans. Глюканы циклодекстрины – циклические полисахариды, состоящие из 6, 7 или 8 остатков глюкозы, соединенных α-1,6-гликозидными связями. У них С4-атом «последнего» остатка глюкозы связан с С1-атомом «первого» остатка глюкозы, поэтому редуцирующего конца не остается.
Крахмал и другие глюканы разлагают ферменты амилазы. Они расщепляют их α-1,4- и α-1,6-гликозидные связи с образованием смеси водорастворимых сахаров, от глюкозы до мальтодекстринов, содержащих в среднем десять остатков глюкозы. В соответствии с субстратной специфичностью и расположением атакуемой связи в молекуле полисахарида амилазы делятся на эндоамилазы и экзоамилазы. Эндоамилазы расщепляют гликозидную связь внутри молекулы полисахарида. К ним относятся α-амилаза, пуллуланаза и циклодекстрингликозилтрансферазы. При их действии на молекулы глюканов образуются мальтоолигосахариды. Циклодекстрингликозилтрансферазы, помимо α-амилазной активности, обладают способностью замыкать в кольцо короткоцепочечные (из 6-8 остатков глюкозы) полисахариды (рис. 29).
К экзоамилазам относятся β-амилаза, амилоглюкозидазы и глюкозидазы. Эти ферменты расщепляют α-1,4-гликозидные связи на нередуцирующем конце цепи, не нарушая при этом общей целостности полимерной структуры полисахарида. Гидролиз под действие β-амилазы приводит к образованию дисахарида мальтозы. Амилоглюкозидазы последовательно отщепляют от полисахаридной цепи по одному остатку глюкозы. Глюкозидазы гидролизуют короткоцепочечные декстрины, например мальтозу, с образованием глюкозы.
Мальтоза
Рис. 29. Разложение крахмала:
1 – глюкозидаза; 2 – циклодекстринглюкозилтрансфераза
Некоторые растения синтезируют кроме глюканов или вместо них фруктаны, или леваны – гомополисахариды, состоящие из остатков D-фруктозы. Они гидролизуются при участии фермента α-фруктаназы.
Способность к расщеплению крахмала и других глюканов при помощи амилолитических ферментов широко распространена у микроорганизмов. К типичным микроорганизмам, разлагающим глюканы, относятся бактерии родов Bacillus, Bacteroides, Clostridium, Klebsiella, Pseudomonas, Pyrococcus, Streptomyces, Thermotoga, Thermus, Thermomonospora, Thermoactinomyces, Thermoanaerobacter и грибы рода Aspergillus (A. oryzae, A. niger, A. wentii).
Амилолитические ферменты, продуцируемые микроорганизмами, используются для получения из крахмала мальтозы, глюкозы, глюкозо-мальтозного сиропа, декстринов и циклодекстринов. Особую ценность представляют термостабильные амилолитические ферменты, выделенные из термофильных микроорганизмов, так как они длительно сохраняют активность при температуре до 100 °С.