- •Словарь основных терминов
- •Биомасса (Biomass)
- •Длинные концевые повторы, ltr (Long terminal repeats)
- •Периплазматическое пространство (Periplasmatic space)
- •Плазмидная несовместимость (Plasmid incompatibility)
- •Проект «Геном человека» (Human Genome Project)
- •Самореплицирующийся элемент (Self-replicating element)
- •Функциональное картирование (Functional cloning)
- •Цитозин
Самореплицирующийся элемент (Self-replicating element)
Внехромосомная молекула нуклеиновой кислоты, способная к независимой от хромосомной ДНК (автономной) репликации. Примером такого элемента служит плазмида.
Сателлитная ДНК. Высокоповторяющиеся нетранслируемые участки ДНК в эукариотических клетках.
Саузерн-блотгинг (Southern blotting) Обнаружение специфических нуклеотидных последовательностей путем переноса денатурированных молекул ДНК, подвергнутых электрофорезу, с агарозного геля на нитроцеллюлозный или нейлоновый фильтр за счет капиллярного эффекта и гибридизации с меченым зондом, комплементарным искомой последовательности.
Сбраживание. Анаэробное расщепление молекул питательного вещества, например глюкозы, сопровождающееся выделением энергии.
Сведберг (S). Единица скорости седиментации частицы в центрифуге.
Сдвиг рамки. Мутация, которая обусловлена вставкой или потерей одной или нескольких пар нуклеотидов; приводит к смещению рамки считывания кодонов при биосинтезе белка, в результате чего образующийся белок, начиная с кодона, подвергшегося изменению, имеет искаженную аминокислотную последовательность.
Секвенирующий гель (Sequencing gel) Длинная пластина полиакриламидного геля, позволяющая проводить электрофоретическое разделение олиго- и полинуклеотидов, различающихся по длине всего на 1 нуклео-тид.
Секреция (Secretion) Выведение веществ из клетки во внешнюю среду.
Селекция (Selection) 1. Наука о методах создания новых сортов культурных растений и пород животных. 2. Отбор нужных организмов (клеток) в смешанной популяции.
Сигнальная последовательность (Signal region, initiator element) Нуклеотидная последовательность в гене, служащая местом связывания белка (фактора транскрипции), который регулирует транскрипцию.
Сигнальная последовательность. 5/-лидерная аминокислотная последовательность полипептида, сигнализирующая о месте назначения новосинтезированного белка; с ее помощью белок проходит сквозь определенную мембрану.
Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид (Signal peptide) ЭД-концевой участок белковой молекулы длиной 15—30 аминокислот, обеспечивающий секрецию белка (перенос через мембрану). После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы.
Сидерофор (Siderophore) Низкомолекулярное вещество, эффективно связывающее железо. Синтезируется многими почвенными микроорганизмами, обеспечивая их железом, которое затем поставляется растениям, находящимся с этими микроорганизмами в симбиотических отношениях.
Симбиоз (Symbiosis) Сосуществование разных организмов, при котором каждое из них выполняет свои функции. В некоторых случаях взаимовыгодно.
Синдром (Syndrome) Совокупность ряда симптомов (признаков), характерных для данного заболевания.
Скрининг (Screening) Метод (или комплекс методов) идентификации единичного объекта (особи в популяции, клетки с искомыми свойствами, участка нуклео-тидной последовательности и т.д.) путем перебора большого числа объектов.
Соматическая клетка (Somatic cell) Любая неполовая клетка многоклеточного организма.
Сплайсинг (Splicing) Вырезание из предшественника мРНК интронов и ковалентное соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.
Стволовые клетки (Stem cells) Митотически активные стволовые клетки, в результате деления которых происходит замещение погибших клеток в многоклеточном организме.
Стериды — сложные эфиры ВЖК и полициклических спиртов.
Стерины - полициклические спирты, относящиеся к классу стероидов.
Стерины содержатся в биологических мембранах всех организмов.
Стероиды. Класс липидов, содержащих циклопентанфенантреновую кольцевую структуру.
Структурный ген (Structural gene) Ген, кодирующий какой-либо белок.
Структурный ген. Ген, кодирующий белки и РНК.
Ступенчатый разрыв (Staggered cut) Разрезание двухцепочечной ДНК, при котором разрывы в комплементарных цепях располагаются не строго один напротив другого, а немного смещены.
Субклонирование (Subcloning) Перенос части уже клонированной молекулы ДНК в другой клонирующий вектор.
Субстрат – вещество, на которое действует фермент.
Субстрат (Substrate) Вещество, превращение которого катализируется специфическим ферментом.
Субстрат — вещество, подвергающееся ферментативному воздействию.
Субстрат. Определенное соединение, на которое действует фермент.
Субстратный центр фермента — участок полипептидной цепи фермента, в котором происходит присоединение субстрата.
Субтилизин (Subtilisin) Протеолетический фермент, синтезируемый клетками Bacillus substilis.
Субъединица (или протомер) — единая полипептидная цепь в эпимолекуле (или мультимере).
Супрессия (Supression) Восстановление утраченной генетической функции, обусловленное подавлением эффекта одной мутации под действием второй.
Сфингофосфолипиды — сложные эфиры ВЖК и сфингозина, содержащие остаток фосфорной кислоты и связанное с ней добавочное соединение.
Сфинголипиды - сложные липиды, в состав которых входит аминоспирт
сфингозин. Сфинголипиды содержатся в растительных и животных клетках, в биологических мембранах, миелиновой оболочке нервов (сфингомиелины) и др.
Тандемный повтор (Tandem array) Нуклеотидная последовательность, состоящая из нескольких одинаковых элементов, соединенных «голова-к-хвосту».
ТАТА-бокс (TATA box) Участок, располагающийся в промоторной области генов эукариот за 25 нуклеотидов до сайта инициации транскрипции, с которым связывается РНК-полимераза. Другое название - бокс Хогнесса. Аналогом у прокариот служит бокс Прибнова.
Т-ДНК (T-DNA) Фрагмент Ti-плазмиды, который встраивается в ядерную ДНК клетки-хозяина и стабильно наследуется ею. Вызывает образование опухоли у растений (корончатого галла).
Тельца включения (Inclusion bodies) Мелкие частицы из кристаллизовавшегося белка, образующегося в избыточном количестве в бактериальной клетке при заражении ее вирусом или при встраивании вирусного генома в ДНК клетки-хозяина. Их наличие свидетельствует о патологических изменениях в клетке.
Температура плавления, Тт (Melting temperature) Температура, при которой происходит разрыв половины водородных связей в полинуклеотидном дуплексе.
Терминальная трансфераза (Terminal transferase, deoxymicleotidyl transferase) Фермент, катализирующий присоединение к 3'-концу молекулы ДНК дезок-синуклеозидмонофосфатов. Используется для клонирования кДНК при участии комплементарных гомополимерных «хвостов» [poly (A) — poly (Т)].
Терминатор - участок ДНК, отвечающий за прекращение (терминацию) транскрипции.
Терминация (Termination) Остановка синтеза макромолекулы.
Терминирующая последовательность. Последовательность ДНК, которая находится на конце транскрипционной единицы и служит сигналом окончания транскрипции.
Терминирующий кодон (Terminating codon) Кодон, определяющий окончание (терминацию) синтеза полинуклеотидной цепи. Обычно это кодоны UAA, UAG и UGA.
Терминаторные кодоны — кодоны мРНК, не несущие информации ни об одной аминокислоте.
Терминирующие кодоны. Три кодона UAA, UAG и UGA, которые служат сигналами окончания синтеза полипептидной цепи.
Термофильный (Thermophylic) Характеризует теплолюбивые организмы, обычно растущие при температуре выше 50 "С. Некоторые термофильные организмы могут расти при температуре от 90 до 100 °С.
Тетрагидрофолиевая кислота. Кофермент, представляющий собой восстановленную активную форму витамина фолиевой кислоты.
Тимидилатсинтаза (Thymidylate synthase) Фермент, катализирующий метилирование урацила с превращением его в тимин.
Тиамин (витамин В1) - водорастворимый витамин, участвующий в составе кофермента тиаминпирофосфата в реакциях декарбоксилирования кетокислот. Тиамин регулирует углеводный обмен, участвует в тканевом дыхании и передаче возбуждения в нервной системе.
Тимин, Т (Thymine) Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК.
Токсины. Белки, которые вырабатываются некоторыми организмами и являются ядовитыми для других видов.
Топоизомеразы. Ферменты, способные осуществлять положительное или отрицательное сверхскручивание колец двухцепочечной ДНК.
Трансаминазы. Ферменты, катализирующие перенос аминогрупп от α-аминокислот к α-кетокислотам; их также называют аминотрансферазами.
Трансаминирование (переаминирование) - обратимый перенос аминогруппы от аминокислот к кетокислотам. Играет важнейшую роль в обмене азотистых соединений в тканях животных, растений, в микроорганизмах.
Трансгенный организм (Transgenic organism) Организм, геном которого содержит чужеродный генетический материал, включенный методами генной инженерии.
Трансгеноз (Transgenesis) Введение чужеродного гена в растительную или животную клетку и его передача в ряду поколений.
Трансдукция (Transduction) Перенос генетического материала из одной бактериальной клетки в другую с помощью бактериофага.
Трансдукция. Перенос генетического материала из одной клетки в другую с помощью вирусного вектора.
Транскрипт (Transcript) Молекула РНК, синтезированная на специфической ДНК как на матрице.
Транскрипционный контроль. Регуляция белкового синтеза при помощи регуляции образования мРНК.
Транскрипция - биосинтез РНК на матрице ДНК, осуществляющийся в клетках организма. Транскрипция - первый этап реализации генетического кода, в ходе которого последовательность нуклеотидов ДНК переписывается в нуклеотидную последовательность РНК.
Транскрипция (Transcription) Процесс синтеза РНК, катализируемый РНК-полимеразой, в котором в качестве матрицы используется одна из цепей ДНК.
Транскрипция. Ферментативный процесс, при котором генетическая информация, содержащаяся в одной цепи ДНК, используется для синтеза комплементарной нуклеотидной последовательности в цепи мРНК.
Транслирующая рибосома — комплекс, состоящий из рибосомы, мРНК и N-формилметионил-тРНК.
Транслоказа. Фермент, вызывающий какое-либо движение, например перемещение рибосомы вдоль мРНК.
Транслокация (Translocation) 1. Хромосомная перестройка, заключающаяся в переносе участка хромосомы в новое положение на той же или на другой хромосоме или в переносе целой хромосомы на другую хромосому. 2. Перемещение молекулы мРНК во время трансляции на один кодон.
Трансляционный контроль. Регуляция синтеза белка за счет изменения скорости его трансляции в рибосоме.
Трансляция - синтез полипептидных цепей белков, идущий в клетках путем считывания генетической информации, записанной в виде последовательности нуклеотидов в молекулах информационных или матричных РНК. Трансляция - второй этап реализации генетического кода.
Трансляция — процесс биосинтеза белка на рибосомах.
Трансляция. Процесс, при котором генетическая информация, содержащаяся в молекуле мРНК, направляет синтез соответствующей аминокислотной последовательности в белке.
Транспозиция. Перемещение гена или группы генов из одного места генома в другое.
Транспортная РНК (тРНК). Класс молекул РНК (мол. масса 25000-30000), каждая из которых на первом этапе белкового синтеза ковалентно соединяется со специфической аминокислотой.
Третичная стурктура белка — способ укладки полипептидной цепи в пространстве.
Углеводы — полигидроксикарбонильные соединения и их производные.
Убихинон (кофермент Q) - производное бензохинона. В живых клетках убихинон участвует в окислительно-восстановительных реакциях тканевого дыхания.
ФАД (флавинадениндинуклеотид) - кофермент, состоящий из соединенных в цепочку рибофлавина, рибита, двух фосфорных групп, рибозы и аденина. ФАД служит передатчиком (акцептором) водорода и электронов.
Флавинадениндинуклеотид (FAD). Кофермент ряда окислительно-восстановительных ферментов, содержащий рибофлавин.
ФМН (флавинмононуклеотид) - кофермент; небелковая часть некоторых ферментов, катализирующих окислительно-восстановительные реакции в живых клетках.
Факторы инициации. Специфические белки, необходимые для инициации синтеза полипептида в рибосомах.
Фермент (энзим) - биологический катализатор; по химической природе - белок или рибонуклеиновая кислота (рибозим). Ферменты обязательно присутствуют во всех клетках живого организма. Ускоряя биохимические реакции, ферменты направляют и регулируют обмен веществ.
Ферменты (энзимы) — биокатализаторы белковой природы.
Ферментный иммуносорбентный анализ, ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) Метод обнаружения специфических молекул в образце. Образец фиксируют на твердой подложке и добавляют антитело, специфичное к маркерной молекуле (первое антитело). Несвязавшиеся молекулы первого антитела смывают и добавляют второе антитело, специфически связывающееся с первым. Ко второму антителу присоединен фермент, превращающий неокрашенный субстрат в окрашенный продукт. Добавляют неокрашенный субстрат и проводят количественное определение окрашенного продукта.
Ферредоксин (Ferredoxin) Железосерный белок, переносчик электронов.
Фертильность (Fertility) Способность организмов приносить жизнеспособное потомство.
Фибриллярные белки – белки, по форме молекулы близкие к вытянутому эллипсу (кератин, эластин, коллаген). Практически не растворимы в воде и солевых растворах.
Физическая карта (Physical map) Расположение генов на хромосоме, установленное с помощью различных методов (электронная микроскопия, секвенирование, рестрикционное картирование). Расстояние на такой карте измеряется в числе пар нуклеотидов.
Фиксация азота (Nitrogen fixation) Превращение атмосферного азота в аммиак. Катализируется ферментом нитрогеназой, обнаруженным только у прокариот.
Фитогормон (Phytohormone) Вещество, стимулирующее рост растений или другие процессы. Примеры: ауксин, цитокинин, этилен и т.д.
Фитопатогены (Phytopathogen) Организмы (грибы, бактерии, вирусы), вызывающие заболевания у растений.
Флавоноиды (Flavonoids) Фенольные соединения, синтезируемые растениями. Их структурную основу составляют два ароматических кольца, соединенных трехуглеродным мостиком. Отвечают за пигментацию растений, защищают их от грибов и насекомых.
Флуоресцеин (Fluorescent) Флуоресцирующий краситель, часто использующийся в качестве метки для антител. Позволяет визуализировать антитела после их связывания с антигеном.
Флуорофор (Fluorophore) Химическая группа, ответственная за флуоресценцию данного соединения.
Фосфатиды — сложные эфиры ВЖК и глицерина, содержащие остаток фосфорной кислоты и связанное с ней добавочное соединение.
Фосфдиэфирная связь (Phosphodiester bond) Связь между фосфатными группами при 3'- и 5'- углеродных атомах соседних нуклеотидов одной полинуклео-тидной цепи.
Фосфолипиды – сложные липиды, фосфатзамещенные эфиры органических спиртов (глицерина, сфингозина).
Фосфолипиды - сложные липиды, содержащие фосфорную кислоту. Фосфолипиды содержатся во всех живых клетках, являются важнейшими компонентами биологических мембран нервной ткани. В составе липопротеидов крови фосфолипиды участвуют в транспорте жиров, жирных кислот и холестерина.
Фосфорилирование - химическая реакция, приводящая к введению в молекулу органического или неорганического вещества остатков кислот фосфора. Фосфорилирование играет важную роль в обмене веществ: в процессах окисления, при синтезе белков, нуклеиновых кислот и т.д.
Фосфорилирование. Образование фосфатного производного биомолекулы обычно за счет ферментативного переноса фосфатной группы от АТР.
Фосфорилирование в дыхательной цепи. Окислительное фосфорилирование, т.е. фосфорилирование ADP, сопряженное с переносом электронов от субстрата к кислороду.
Фосфорилирование на уровне субстрата. Фосфорилирование ADP и некоторых других нуклеозид-5'-дифосфатов, сопряженное с дегидрированием органического субстрата и протекающее независимо от переноса электронов.
Фосфоролиз. Ферментативное расщепление соединения в результате взаимодействия с фосфатом, аналогичное гидролизу.
Фотосинтез (Photosyntesis) Процесс превращения клетками высших растений энергии видимого света в энергию химических связей, сопровождаемый образованием органических соединений и кислорода из диоксида углерода и воды.
Фотосинтетическое фосфорилирование (фотофосфорилирование). Ферментативное образование АТР из ADP, сопряженное со светозависимым переносом электронов в фотосинтезирующих организмах.
Фрагмент Кленова (Henov fragment) Более крупный из двух фрагментов ДНК-полимеразы I E.coli, образующийся при ее протеолитическом расщеплении. Сохраняет полимеразную активность в направлении 5'->3' и экзонуклеазную — в направлении 3'—>5'. Используется, в частности, при секвенировании ДНК.
Фрагментация ДНК (Shearing) Разрыв молекул ДНК под действием гидродинамических сил (например, при пропускании раствора ДНК через иглу шприца). Гидродинамические силы в растворе возникают в результате скольжения одного слоя жидкости относительно другого.
