7. Отдел Диктиогломы - Dictyoglomi.

Филогенетическое положение: в филогенетических деревьях отдел имеет непостоянное положение.

Отдел основан на 1 виде, Dictyoglomus thermophilum.

Окраска по Граму: грамотрицательные. Поверхность клетки имеет сложную грамотрицательную структуру.

Форма клетки: палочки, неспорообразующие, неподвижные. Встречаются одиночно, в парах, нитях. Имеется тенденция к формированию агрегатов клеток (от нескольких до сотни), заключенных в общую оболочку. «Круглые тельца» формируются к концу экспоненциальной фазы роста, и представляют собой многоклеточные агрегаты внутри сплошной однослойной оболочки.

Физиология: хемоорганогетеротрофы.

Отношение к кислороду: облигатные анаэробы.

Отношение к температуре: экстремальные термофилы (растут при 50‒80С, оптимум +78С).

Местообитания: найден в континентальных горячих источниках со слегка щелочной реакцией.

8. Отдел Деферрибактерии – Deferribacteres.

Включает 7 родов.

Особенности генома: отдел выделен на основе особенностей 16S рДНК.

Морфология клетки: прямые или изогнутые палочки или спириллы. Могут иметь полярный жгутик.

Физиология: хемоорганогетеротрофы, восстанавливают Fe2+, Mn4+, S⁰, Co3+, нитраты. Встречаются солеустойчивые виды.

Отношение к кислороду: анаэробы.

Отношение к температуре: в основном термофилы (оптимум 60‒65С), встречаются мезофилы.

9. Отдел Синергисты – Synergistetes (Synergistes).

Филогенетическое положение:

Включает 11 родов, относящихся к нескольким обособленным филогенетическим линиям внутри отдела.

Молекулярные маркеры: предположительно, имеют атипичный химизм внешних клеточных покровов.

Окраска по Граму: отрицательная.

Форма клеток: палочки или вибриоиды. Клетки обладают двухслойным (дидермным) клеточным чехлом.

Отношение к кислороду: анаэробы.

Отношение к температуре:

Культивирование: поддержанию в культуре поддаются только некоторые представители отдела, выделенные из природных экосистем. Остальные известны на основе сиквенсов Synergistes-типа, полученных, в частности, из клинических образцов.

Особенности генома: гены, ответственные за ферментативные пути синтеза липополисахаридов клеточных покровов, пока не обнаружены.

Местообитания: желудочно-кишечный тракт животных (например, рубец коз); почва; нефтяные скважины; сточные воды; ротовая полость человека, включая кариозные полости, периодонтальные инфекции; желудочно-кишечные инфекции; перитонеальная жидкость человека; инфекции мягких тканей человека (абсцессы, цисты); фекалии. Предположительно, оппуртунистические патогены человека, но встречаются и как компонент нормальной микробиоты.

Практическое значение: имеются виды, дающие значительный вклад в разложение илов; виды, способные к выработке биогаза при анаэробном разложении отходов; потенциальные продуценты водорода (альтернативная энергетика).

Характерные виды: Synergistes jonesii.

10. Отдел Кальдисерики – Caldiserica.

Многоклеточные филаменты Caldisericum

Отдел описан в 2009 г. Включает 1 род и 1 вид, Caldisericum exile. Ранее назывался «кандидатный филум OP5». Основной маркер отдела ‒ своеобразный 16S рРНК сиквенс.

Хемотаксономические маркеры: главная жирная кислота ‒ iso-C(17 : 0). Дыхательные хиноны ‒ менахинон-8(H(6)), менахинон-8(H(8)), менахинон-8(H(10)).

Окраска по Граму: отрицательная.

Морфология клетки: клетки соединены в нити (филаменты), снабженные одиночным полярным жгутиком.

Физиология: тиосульфат-восстанавливающий (тиосульфат-редуцирующий). Восстанавливает соединения серы (тиосульфат, сульфит, элементарную серу) до сероводорода. Донор электронов неизвестен. Для роста нуждается в дрожжевом экстракте. На основе предсказанных генов, большинство путей биосинтеза аминокислот, кофакторов и нуклеотидов у микроорганизма утрачены, что предполагает его существование в окружающей среде как «падальщика».

Отношение к кислороду: анаэроб.

Отношение к температуре: термофил. Оптимальный рост наблюдается при +65С.

Особенности генома: геном ‒ одна кольцевая хромосома, 1 558 тыс. п.н., включает 1 582 предсказанных белок-кодирующих сиквенсов. Около 60% предсказанных белков наиболее близки к белкам Firmicutes, Dictyoglomi и Thermotogae. Около 9% предсказанных белков ‒ наиболее близки к белкам архей.

Местообитания: выделен из горячего источника.

Распространение: Япония.