14. Какие варианты имеет классификация вирусов? Что положено в основу каждого из них?

После открытия вирусов, было известно единственное их физико-химическое свойство – способность проходить через бактериальные фильтры. В сущности, это была оценка размера вирусов, которая ставила их особняком от остальных микроорганизмов. В то время определение других свойств вирусов было невозможным, поэтому исследования были направлены на изучение инфекционного процесса и реакции на заражение со стронны организма. По этой причине первые попытки классификации основывались на сходстве патогенных свойств вируса, например выделяли «вирусы гепатита», или на их органотропности, например «респираторные вирусы». По мере проникновения в природу вирусов, с 1950-х годов предпринимались различные схемы классификации вирусов, на основе различных их свойств. Был предложен целый ряд классификаций, часто взаимоисключающих.

4.1. Классификация на основе типа заболевания

Первым и наиболее общим свойством вирусов является то, что они представляют собой инфекционные агенты, и является возможным сгруппировать вирусы в соответствии с природой болезни, с которой они ассоциированы. Так, можно рассматривать вирусы, вызывающие гепатит, или вирусы, вызывающие простуду. Такой подход привлекает своей простотой. Однако такой метод группировки вирусов, хотя и отражает важные характеристики, имеет большие недостатки. Он является очень антропоморфным, уделяя внимание болезни, которую мы распознаем, поскольку она влияет на людей или наших домашних животных. Однако при этом игнорируется факт, что большинство вирусов либо не вызывают заболеваний, либо вызывают заболевания, которые нам неизвестны, поскольку у нас нет полного понимания хозяев; например, мы мало что знаем о вирусных болезных рыб или амфибий. Подобным образом является возможным, что единственный вирус вызывает более чем одно заболевание; хорошим примером является вирус ветряной оспы, который вызывает ветрянку при первом заражении, однако при реактивации в более позднем возрасте вызывает опоясывающий лишай или опоясывающий герпес (Механизм реактивации вируса varicella-zoster, в результате которой развивается опоясывающий лишай, неизвестен; полагают, что при ветряной оспе вирус попадает в черепно-спинномозговые ганглии, где и остается в латентном состоянии.). Эта проблема усугубляется, если рассматривать вирусы, которые заражают более одного хозяина. При этом часто наблюдается, что вирус практически не вызывает болезни у одного хозяина, но очень сильно поражает другого, либо вызывает разные заболевания у разных хозяев. Классификация, основанная на заболевании, хотя и может быть полезна в некоторых ситуациях, не может предсказать общие фундаментальные особенности вируса. В случае гепатитов и простуды, их вызывают многие вирусы, имеющие самое разнообразное молекулярное строение, и изучение одного вируса практически ничего не может сообщить нам о других.

4.2. Классификация на основе вида хозяина

Альтернативным подходом является группировка вирусов в соответствии с видами хозяев, которых они инфицируют. Такой подход является привлекательным, поскольку подчеркивает паразитическую природу взаимодействия вирус-хозяин. Однако при практическом применении такой подход вызывает затруднения. Некоторые вирусы имеют очень ограниченный круг хозяев и поражают только один вид живых организмов, например вирус гепатита В заражает только людей. Другие вирусы имеют узкий круг хозяев, например полиовирусы (группа энтеровирусов (кишечных вирусов), вызывающих у человека полиомиелит) поражают несколько видов приматов. Однако вирусы могут поражать совершенно различных хозяев. Например, многие вирусы растений могут реплицироватся и в насекомых-переносчиках, и в растениях-хозяевах. По этой причине классификация вирусов на основе поражаемых видов хозяев часто приводит к неоднозначности. Кроме того, даже если вирусы поражают единственный вид, это не означает, что они подобны друг другу в смысле вызываемых заболеваний или генетической структуры. По этой причине, детальное изучение одного вируса, который поражает отдельный вид живого организма или даже только клетки конкретного типа в организме, ничего не скажет о фундаментальных свойствах многих других вирусов, которые поражают этот же вид и клетки этого же типа.