
- •IX. Общие принципы самоорганизации белков §9.1. Общие принципы и модели самоорганизации глобулярных белков
- •9.1.1. Модель ко-трансляционного сворачивания
- •9.1.2. Модель пост-трансляционного сворачивания
- •9.1.3. Шапероны и шаперонины
- •9.1.4. Общая картина формирования вторичной и третичной структур
- •Вторичная структура
- •Третичная структура
- •§9.2. Образование α-спирали
- •9.2.1. Образование α-спирали (термодинамика)
- •9.2.2. Образование α-спирали (кинетика)
- •§9.3. Образование β-структуры
- •§9.4. Нуклеационный механизм сворачивания
- •§9.5. Денатурация белков
- •9.5.1. Определение
- •9.5.2. Причины, вызывающие денатурацию
- •9.5.3. Характерные особенности денатурации
- •§9.5.4. Расплавленная глобула
- •9.5.5. Механизм денатурации
- •9.5.6. Энергетическая щель в спектре конформационных состояний
- •§9.6. Ренатурация – спонтанная самоорганизация. Полиморфизм
- •9.6.1. Ренатурация
- •9.6.2. Полиморфизм
- •§9.7. Физические основы функциональной организации белков
- •Связывание → трансформация → освобождение.
- •9.7.1. Связывающие белки
- •9.7.2. Трансформирующие белки – ферменты
- •9.7.3. Белки, осуществляющие транспорт
- •9.7.4. Белки, осуществляющие механохимические функции
- •§9.8. Регуляция деления клетки
- •9.8.1. Контроль за делением клеток
- •9.8.2. Апоптоз
- •9.8.3. Естественный предел продолжительности жизни
- •Теломеры
- •Репликационное укорочение хромосом
- •Теломераза. Синтез теломеров
- •Старение
- •О возможности продления жизни
- •Антионкогены и онкогены
- •Фотодинамическая терапия
- •§9.9. Генная инженерия. Моноклональные антитела. Гибридомы
- •§9.10. Мутации и молекулярная эволюция
9.6.2. Полиморфизм
Если у полипептидной цепи не одна, а две структуры отделены от прочих состояний энергетической щелью, и обе стабильны по сравнению с клубком Fклубок, то первой свернется та структура, к которой ведет путь сворачивания с меньшим энергетическим барьером. Однако, если она менее стабильна, чем другая, то затем последует медленный переход в более стабильную структуру.
Переходы такого типа похожи на полиморфные переходы в кристаллах. Интересной аналогией является низкотемпературный фазовый переход белого β-олова в серое α-олово, рассмотренный выше (см. с. 76–79). При медленной кристаллизации оловянного расплава сначала образуется γ-модификация, которая при температуре 173°С переходит в β-модификацию (белое олово). При понижении температуры ниже 13,1°С термодинамическая выгодность α-фазы олова увеличивается, соответственно увеличивается стабильность α-фазы, энергетическое расстояние между минимумами энергии α-фазы и β-фазы уменьшается и уменьшается высота потенциального барьера между фазами. В результате скорость фазового перехода β-Sn → α-Sn возрастает. Однако при понижении температуры уменьшается энергия теплового движения атомов, что тормозит скорость перехода. Конкуренция этих процессов приводит к тому, что при понижении температуры сначала скорость перехода возрастает, проходит через максимум, а затем уменьшается, обращаясь в нуль при Т → 0°К. Скорость фазового перехода β-Sn → α-Sn максимальна при температуре –33°С.
На скорость перехода, как указывалось выше (с. 78), сильное влияние оказывает наличие зародышей новой фазы в матрице старой (см. т.1, стр.176). Образование стабильных зародышей новой фазы всегда требует затрат энергии больше, чем их дальнейший рост. Появление зародышей β-фазы (пылинок серого олова) на белом α-Sn (оловянная чума) ускоряет процесс фазового перехода β-Sn → α-Sn, при котором олово рассыпается в серый порошок, и изделия из олова разрушаются.
В отличие от металлов появление зародышей новой фазы в белках приводит к агрегации (слипанию) белковых молекул. Возникший зародыш новой формы агрегированного белка переводит в новую форму и втягивает в агрегат все остальные белковые молекулы, как при «оловянной чуме». В результате перестройка структуры белка замедляется и нарушается функционирование его нативной фазы.
Переход такого типа происходит в водорастворимом аминокислотном полимере полилизине в пробирке при рН > 10 и температуре (20÷50)°С. Сначала за миллисекунды полилизин переходит из клубка в α-спираль, а затем очень медленно из α-спирали в β-структуру. Замедление связано с агрегацией белковых β-молекул, которая приводит к снижению стабильности β-структуры. В результате скорость перехода α → β экспоненциально замедляется. Поэтому переход из α- в β-структуру может длиться часы, недели и более.
Аналогичные полиморфные переходы происходят в белках прионах в клетках мозга животных, приводя к заболеванию «коровьим бешенством» и, после большого инкубационного периода, – к летальному исходу.
Возможно, медленная полиморфная перестройка белковых структур мозга, приводящая к нарушению их нормального функционирования, может являться причиной, так называемого, старческого маразма.