1. За исключением митохондрий, все мембранные органеллы цитоплазмы объединяются в т. Н. Вакуолярную систему. В последнюю входят следующие органеллы:

а) эндоплазматическая сеть (ЭПС), или эндоплазматический ретикулум (1 на рис.3.3) — совокупность плоских мембранных мешков (цистерн), вакуолей и трубочек;

б) комплекс (аппарат) Гольджи (2), или пластинчатый комплекс, — несколько скоплений плоских мембранных цистерн, от которых отшнуровываются мелкие пузырьки;

в) эндосомы и лизосомы (3) — мембранные пузырьки, содержащие ферменты гидролиза биополимеров (протеазы, нуклеазы, гликозидазы, липазы и т.д.);

г) пероксисомы — мембранные пузырьки, содержащие ферменты, которые нейтрализуют пероксид водорода, а также оксидазы — ферменты окисления субстратов непосредственно кислородом.

2. Особняком от вышеназванных структур стоят митохондрии (4) — органеллы, отграниченные (как и ядро) двумямембранами, из которых внутренняя образует многочисленные впячивания (кристы) внутрь митохондрии.

Б. Немембранные органеллы

Их тоже можно подразделить на две неравные группы.

1. К первой группе относятся гранулярные органеллы; это рибосомы (5) — многочисленные небольшие частицы, состоящие из двух субъединиц рибонуклеопротеидной природы.

2. Вторая группа немембранных органелл — фибриллярные органеллы:

I. сократительные структуры — миофибриллы и миофиламенты,

II. а также элементы цитоскелета:

а) микрофиламенты (МФ) — нити из белка актина (d = 5-7 нм), пронизывающие гиалоплазму в тангенциальномнаправлении (вдоль длинной оси клетки);

б) промежуточные филаменты — более толстые нити (d = 10 нм), белковый состав которых различен в клетках разных тканей;

в) микротрубочки (МТ) — полые трубки (d = 24 нм) из белка тубулина, имеющие в основном радиальную ориентацию в клетке.

3. Имеются также структуры, производные органелл второй группы.

а) Производным МФ является каркас микроворсинок (п. 2.4.1).

б) У МТ — производных больше.

I. Во-первых, это центриоли (6 на рис. 3.3), каждая из которых представляет собой полый цилиндр, образованный микротрубочками. В клетке обычно содержится пара центриолей (диплосома), причем она входит в состав клеточного центра — органоида общего значения.

II. Другое производное МТ — аксонема, служащая каркасом (осевой структурой) ресничек и жгутиков.

Теперь перейдем к более детальному описанию вышеперечисленных структур (кроме сократительных органелл. Структура цитоплазмыЖидкую составляющую цитоплазмы также называют цитозолем. Под световым микроскопом казалось, что клетка заполнена чем-то вроде жидкой плазмы или золя, в котором «плавают» ядро и другие органоиды. На самом деле это не так. Внутреннее пространство эукариотической клетки строго упорядочено. Передвижение органоидов координируется при помощи специализированных транспортных систем, так называемых микротрубочек, служащих внутриклеточными «дорогами», и специальных белков динеинов и кинезинов, играющих роль «двигателей». Отдельные белковые молекулы также не диффундируют свободно по всему внутриклеточному пространству, а направляются в необходимые компартменты при помощи специальных сигналов на их поверхности, узнаваемых транспортными системами клетки. Основное вещество цитоплазмы — гиалоплазма (цитозоль) — представляет собой бесцветный, слизистый, густой и прозрачный коллоидный раствор. Именно в нем  протекают все процессы обмена веществ, она обеспечивает взаимосвязь ядра и всех органоидов. В зависимости от преобладания в гиалоилазме жидкой части или крупных  молекул различают две формы гиалоплазмы: золь — более жидкая гиалоплазма и гель — более густая гиалоплазма. Между ними возможны взаимо переходы: гель легко превращается в золь и наоборот.  Функции гиалоплазмы: 1. объединение всех компонентов клетки в единую среду 2. среда для прохождения химических реакций 3. среда для существования и функционирования органоидов