
- •Часть1.
- •5 Семестр.
- •19 Занятий по 2 академических часа. Заключительные практические занятия: 7, 13, 19 занятие № 1
- •Последовательный процесс поиска модели
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Правила, используемые при интерпретации спектров ямр
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14-15
- •Открытая ферментативная система с субстратным угнетением
- •Колебания в ферментативных системах Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Термодинамическая вероятность и энтропия
- •Внутренняя энергия и теплосодержание
- •Концентрации натрия и потенциалы внутри и вне клетки (гигантский аксон кальмара в морской воде)
- •Литература
- •Занятие № 18
- •Часть2.
- •6 Семестр.
- •19 Занятий по 3 академических часа. Заключительные практические занятия: 13, 17 занятие № 1 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 2 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 3 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 4 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 5 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Часть3.
- •7 Семестр.
- •18 Занятий по 3,5 академических часа. Заключительные практические занятия: 10, 18 занятие № 1
- •Литература
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Литература
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Литература
- •Занятие № 18
Литература
-
Фрайфелдер Д. Физическая биохимия. – М., 1980, стр. 415-449 (Глава 15)
-
Владимиров Ю.А. Потапенко А.Я. Физико-химические основы фотобиологических процессов. – М., 1989, стр. 27-69 (Глава 2)
-
Рубин А.Б. Современные методы биофизических исследований. Практикум по биофизике. – М., 1988, стр. 98-110
-
Губанов Н.И. Медицинская биофизика. – М., 1978, стр. 79-88
-
Волькенштеин М.В. Биофизика. – М., 1988, стр. 144-148
-
Рощупкин Д.И., Артюхов В.Г. Основы фотобиофизики. – Воронеж, 1997, стр. 19-34 (Глава 2,3)
Занятие № 10
ТЕМА: Перенос электрона и миграция энергии в биосистемах
Цель: Изучить физические механизмы процессов переноса электрона и безызлучательной миграции энергии и их роль в биологических процессах
Перенос энергии электронного возбуждения между двумя молекулами можно представить в виде схемы: D* + A → D + A*. Перенос энергии между одинаковыми молекулами называют миграцией энергией.
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Значимость процессов переноса электрона и миграции энергии для биологических систем.
-
Перенос электрона в двухуровневой системе. Обратимость процесса. Условия обеспечения необратимости процесса переноса электрона.
-
Туннелирование электронов и ядер. Электронно-колебательные взаимодействия при туннелировании электрона.
-
Проводимость белков. Модели проводимости белков.
-
Индуктивно-резонансный перенос энергии электронного возбуждения. Механизм Фёрстера. Расстояния переноса. «Флуоресцентная линейка».
-
Обменно-резонансный перенос энергии. Возможность переноса в системах триплет-триплет, синглет-синглет, синглет-триплет. Расстояния переноса.
-
Экситонный механизм миграции энергии.
-
Динамика электронно-конформационных взаимодействий. Связь конформационной энергии с переносом электрона.
Самостоятельная работа
-
Перенос электрона в процессе фотосинтеза.
-
Использование явления переноса энергии в изучении структуры биологических мембран.
Литература
-
Владимиров Ю.А. Потапенко А.Я. Физико-химические основы фотобиологических процессов. – М., 1989, стр. 70-81 (Глава 3)
-
Рубин А.Б. Биофизика. Т 1. – М., 2000, стр. 372-418
Занятие № 11
ТЕМА: Метод электронного парамагнитного резонанса в исследованиях свойств биосистем
Цель: Изучить принцип метода ЭПР и возможности его применения в медико-биологических исследованиях
Явление ЭПР заключается в том, что парамагнитные частицы, помещенные в постоянное магнитное поле, поглощают микроволновое электромагнитное излучение определенной (резонансной) частоты.
Электрон обладает магнитным моментом, ориентация которого во внешнем магнитном поле характеризуется спиновым квантовым числом MS=±1/2. Условия резонанса обычно выражают в виде
ΔE=hv=gβH,
где g – безразмерная постоянная, называемая фактором Ланде и равная 2,0023 (g-фактор это отношение магнитного момента электрона к его спиновому угловому моменту), а β – магнетон Бора, равный eh/2πmc.
Аппаратурные особенности спектрометров ЭПР (в поле 3400 Гс на частоте 9,5 ГГц) обычно приводят к тому, что регистрируется первая производная линий поглощения.
В большинстве молекул, согласно принципу Паули, электроны образуют пары с противоположно направленными спинами. Поэтому с такими молекулами наблюдать ЭПР не удается. Лишь немногие молекулы (O2, NO, NO2) содержат один или несколько неспаренных электронов в своем основном состоянии и для всех таких молекул наблюдается спектр ЭПР.
Сверхтонкое расщепление возникает при наличии магнитного взаимодействия между неспаренным электроном и ядром. Расстояние между линиями сверхтонкой структуры дает константу сверхтонкого взаимодействия.
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Принцип метода ЭПР. Механический и магнитный моменты электрона. Магнетон Бора.
-
Эффект Зеемана. Основное уравнение резонанса. G-фактор.
-
Характеристики спектров ЭПР: амплитуда, форма линии, ширина линии.
-
Времена продольной и поперечной релаксации (T1, T2).
-
Расщепление линий. Сверхтонкая структура спектров ЭПР.
-
Устройство радиоспектрометра ЭПР.
-
Зависимость характеристик спектра ЭПР от параметров среды.
-
Применение ЭПР в медико-биологических исследованиях.
-
Естественные сигналы ЭПР, наблюдаемые в биологических системах.
-
Метод спиновых меток и зондов.
-
Метод спиновых ловушек.
Самостоятельная работа
-
Для регистрации спектров ЭПР ферродоксинов, цитохромов, пластоцианов приходится проводить измерение при достаточно низких температурах (вплоть до 4-20 К). Почему?
-
Измеряя интенсивность радиационно-индуцированного сигнала ЭПР, можно определить дозу ионизирующего излучения, поглощенного организмом (человеком) в течении всей его жизни. Предположите месторасположение такого стабильного радиационно-индуцированного парамагнитного центра.
-
С помощью спиновых меток было показано, что липидные мембраны имеют неоднородный профиль «жесткости». Как? Какой?
-
Как с помощью спиновых меток можно узнать о том, что в цитоплазматической мембране появились дефекты (разрывы, поры)?