
- •Часть1.
- •5 Семестр.
- •19 Занятий по 2 академических часа. Заключительные практические занятия: 7, 13, 19 занятие № 1
- •Последовательный процесс поиска модели
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Правила, используемые при интерпретации спектров ямр
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14-15
- •Открытая ферментативная система с субстратным угнетением
- •Колебания в ферментативных системах Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Термодинамическая вероятность и энтропия
- •Внутренняя энергия и теплосодержание
- •Концентрации натрия и потенциалы внутри и вне клетки (гигантский аксон кальмара в морской воде)
- •Литература
- •Занятие № 18
- •Часть2.
- •6 Семестр.
- •19 Занятий по 3 академических часа. Заключительные практические занятия: 13, 17 занятие № 1 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 2 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 3 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 4 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 5 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Часть3.
- •7 Семестр.
- •18 Занятий по 3,5 академических часа. Заключительные практические занятия: 10, 18 занятие № 1
- •Литература
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Литература
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Литература
- •Занятие № 18
Литература
-
Владимиров Ю.А. Биофизика.- М., 1983, стр. 193-212
-
Губанов Н.И. Медицинская биофизика.- М., 1978, стр. 315-329
Занятие № 5
ТЕМА: Структура сократительного аппарата
Цель: Изучить физические механизмы работы мышечного аппарата при стационарных нагрузках
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Взаимосвязи между механическими и энергетическими параметрами мышечного сокращения в стационарном режиме сокращения. Уравнения Хилла.
-
Зависимость теплопродукции от смещения.
-
Соотношение между скоростью изотонического сокращения и развиваемой силой.
-
Эффективность преобразования энергии.
-
Справедливость уравнений Хилла.
-
Структура сократительного аппарата.
-
Пространственная конфигурация миозиновых нитей.
-
Пространственная конфигурация актиновых нитей.
-
Дифракционная картина малоуглового рассеяния рентгеновских лучей при замыкании мостиков.
-
Мостиковая гипотеза генерации силы.
-
Биохимические стадии сокращения, соответствующие механическим стадиям рабочего цикла мостика.
Литература
-
Владимиров Ю.А. Биофизика. – М., 1983, стр. 213-225
-
Рубин А.Б. Биофизика. Т 2. – М., 2000, стр. 225-257
-
Гусев Н.Б. Молекулярные механизмы мышечного сокращения. // СОЖ, №8, 2000, стр. 24-32
-
Губанов Н.И. Медицинская биофизика. – М., 1978, стр. 251-270
-
Тихонов А.И. Молекулярные моторы. Часть 2. Молекулярные основы биологической подвижности. // СОЖ, №6, 1999, стр. 17-24
Занятие № 6
ТЕМА: Модели мышечного сокращения. Справедливость моделей мышечного сокращения при стационарных и нестационарных режимах нагрузки
Цель: Провести сравнительный анализ моделей мышечного сокращения и их соответствия совокупности экспериментальных данных
Механическая модель головки миозина. Полный цикл работы мостика. (по Erwin W. Becker 2000)
M1-M4,
домены центральной области;
CO, область конвертера с механическим механизмом;
L, рука рычага;
PB, фосфатный карман;
C1, 50-кДа щель; C2, ATP щель; C3, SH щель;
PT, поршень притягивающий фосфат на АТФ;
HE, спираль, связывающая группу фосфатов к M1; E1, E2, упругие элементы.
После перемещения АТФ головка из прочного связывающего состояния (a) переходит на непрочное связывающее состояние (b). Отделение и перераспределение приводит к другому неустойчивому состоянию (c) и другому положению актина с оптимальной конформацией для рабочего хода. Для экономии места, диаграммы (с) и (d) перемещены направо по сравнению с их истинным положением относительно (a) и (b). При переходе к устойчивому состоянию (d) (рабочий ход) вытягивается упругий элемент E2, позволяя уйти фосфату. Передача свободной энергии, запасенной в E2 на филаменты (нити актина и миозина) возвращает систему назад (a) в результатt замены АДФ на АТФ.
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Анализ моделей Хаксли и Дещеревского для стационарных режимов сокращения.
-
Зависимость механических свойств от степени перекрытия нити.
-
Теория Э.Хаксли. Смысл параметров.
-
Модель Дещеревского. Смысл параметров.
-
Связь параметров модели Дещеревского с параметрами уравнений Хилла.
-
Нестационарные режимы сокращения.
-
Фазы изменения напряжения при одноступеньчатом укорочении.
-
Изменения напряжения при многоступеньчатом укорочении.
-
Фазы сокращения, соответствующие модели Войта.
-
Модели мостика, генерирующего силу: модель Хаксли и Симмонса, модель Айзенберга и Хилла.
-
Молекулярный мотор мышцы.
-
Трехмерная структура субфрагмента 1 миозина.
-
Молекулярная модель рабочего цикла мостика.