
- •Краткий курс лекций по биологической химии для студентов, обучающихся по специальности Педиатрия
- •1.1. Содержание белковв организме человека
- •1.2. Биологические функции белков
- •1.3. Химический состав белков
- •1.3. 1. Элементарный состав белков
- •1.3.2. Аминокислотный состав белков
- •1.4. Виды связей аминокислот в белках
- •1. 5. Структурная организация белков
- •1. 5. 1. Первичная структура белков
- •1. 5. 2. Вторичная структура белков
- •1. 5. 3. Третичная структура белков
- •1.5.4. Четвертичная структура белков
- •1. 5. 5. Доменные белки
- •1. 6. Физико-химические свойства белков
- •1.6. 1. Растворимость белков
- •1. 6. 2. Молекулярная масса белков
- •1.6.3. Размеры и форма белковых молекул
- •1.6.4. Свойства белков, сходные со свойствами коллоидных растворов
- •1.6.5. Оптические свойства белковых растворов
- •1.6.6. Свойства белков как истинных растворов
- •1.6.6. 1. Заряд белковой молекулы
- •1.6.6.2. Формирование гидратной (водной) оболочки
- •1.7. Осаждение белков из растворов
- •1.8. Методы количественного определения белков
- •1.9. Выделение, фракционирование и очистка белков
- •1.10. Классификация белков
- •1.10.1. Простые белки (протеины)
- •1.10.2. Сложные белки (протеиды)
- •2. Структура, свойства и механизм действия ферментов
- •2.1. Краткая история ферментологии
- •2.2. Структура ферментов
- •2.3. Механизм действия ферментов
- •2.4. Номенклатура ферментов
- •2.5. Классификация ферментов
- •2.6. Свойства ферментов
- •2.6.1. Высокая каталитическая активность ферментов
- •2.6.2. Высокая специфичность ферментов
- •2.6.3. Термолябильность ферментов
- •2.6.4. Фотолябильность ферментов
- •2.6.5. Зависимость активности ферментов от рН.
- •2.6. 6. Зависимость скорости ферментативной реакции от концентрации фермента и концентрации субстрата
- •2.6.7. Зависимость скорости ферментативных реакций от присутствия активаторов и ингибиторов.
- •2.6.7.1. Влияние активаторов ферментов
- •2.6.7.2. Влияние ингибиторов ферментов
- •2.8. Регуляция активности ферментов в процессе метаболизма
- •2.9. Структурная организация ферментов в клетке
- •2.10. Принципы обнаружения и количественного определения ферментов:
- •2.10.1. Количественное определение ферментов
- •3. Введение в обмен веществ. Биохимия питания. Витамины
- •3.1. Общие сведения об обмене веществ
- •3.2. Биохимия питания
- •3.2.1. Краткая характеристика питательных веществ
- •3.3. Биохимия витаминов
- •3.3.1. Номенклатура витаминов
- •3.3.2. Классификация витаминов
- •3.3.3. Биологическая роль витаминов
- •3.3.4. Обмен витаминов
- •3.3.5. Краткая характеристика некоторых витаминов
- •3.4. Биохимические основы рационального вскармливания грудных детей
- •3.4.1. Химический состав грудного молока
- •Биологически активные компоненты грудного молока.
- •4. Биологическое окисление
- •4.1. Функции биологического окисления
- •4.2. Краткая история учения о биологическом окислении
- •4.3. Виды биологического окисления
- •4.4. Ферменты и коферменты биологического окисления
- •4.4.1. Никотинамидзависимые дегидрогеназы (над, надф-зависимые)
- •4.4.1.1. Витамин рр
- •4.4.2. Флавопротеиды (флавиновые дегидрогеназы)
- •4.4.2.1. Витамин в2
- •4.4.3. Убихинон (КоQ)
- •4.4.4. Цитохромы
- •4.4. 5. Оксигеназы
- •4.4.6. Пероксидазы
- •4.5. Внутримитохондриальное окисление
- •4.5.1. Длинная дыхательная цепь
- •4.5.2. Короткая дыхательная цепь
- •4.5.3. Окислительные комплексы и их ингибиторы
- •4.6. Энергетический обмен
- •5.6.1. Окислительное фосфолирирование
- •4.6.1. 1. Регуляция окислительного фосфолирирования
- •4.6.2. Особенности энергетического обмена у детей
- •4.6.3. Нарушение энергетического обмена.
- •4.7. Внемитохондриальное окисление
- •4.7.1. Окисление с участием оксидаз. Активные формы кислорода
- •4.7.2. Окисление с участием оксигеназ.
- •4.7.3. Пероксидазное окисление.
- •5. Общие пути катаболизма
- •5.1. Окислительное декарбоксилирование пировиноградной кислоты
- •5.1.1. Пируватдегидрогеназный комплекс
- •5.2. Цикл трикарбоновых кислот (цикл г. Кребса)
- •5.2.1. Химизм цикла Кребса (цикла трикарбоновых кислот)
- •5.2.2. Биологическое значение цикла Кребса
- •5.2.3. Регуляция активности цикла трикарбоновых кислот
- •6. Обмен и функции углеводов
- •6.1. Содержание углеводов в организме и их биологические функции
- •6.2. Классификация углеводов
- •6.2.1. Моносахариды и их производные
- •6.2.2. Олигосахариды
- •6.2.3. Полисахариды
- •6.2.3.1. Гомополисахариды
- •6.2.3.2. Гетерополисахариды (гликозаминогликаны)
- •6.2.3.3. Особенности содержания и обмена гликозаминогликанов и протеогликанов у детей.
- •6.3. Переваривание и всасывание углеводов
- •6.3.1. Особенности переваривания углеводов в детском возрасте
- •6.4.2. Распад гликогена
- •6.5. Обмен глюкозы в тканях
- •6.5.1. Окисление глюкозы в тканях
- •6.5.1.1. Анаэробное окисление глюкозы
- •6.5.1.2. Аэробное окисление глюкозы
- •6.5. 2. Биосинтез глюкозы (глюконеогенез)
- •6.5.2.1. Витамин н
- •6.6. Пентозофосфатный путь окисления глюкозы
- •6.7. Утилизация фруктозы и её нарушения
- •6.8. Усвоение галактозы и его нарушения
- •6.9. Взаимные превращения углеводов (гексоз)
- •6.10. Особенности обмена глюкозы в различных тканях
- •6.11. Регуляция углеводного обмена
- •6.12. Патология углеводного обмена
- •6.12.1. Нарушение переваривания и всасывания углеводов
- •6.12.2. Нарушения содержания глюкозы в крови
- •6.12.3. Нарушения тканевого обмена углеводов
- •7. Обмен и функции липидов
- •7.2.1.2. Глицерофосфолипиды (фл)
- •7.2.2. Сфингозинсодержащие липиды
- •7.2.2.1. Сфингофосфолипиды (сфингомиелины)
- •7.2.2.2. Сфингогликолипиды
- •7.2.3. Холестеринсодержащие липиды
- •7.3. Содержание липидов в организме человека
- •7.4. Биологические функции липидов
- •7.5. Структура и функции клеточных мембран
- •7.6. Переваривание липидов
- •7.7. Всасывание продуктов расщепления липидов
- •7.8. Ресинтез липидов в слизистой тонкого кишечника
- •7.9. Особенности переваривания и всасывании липидов у детей
- •7.10. Транспорт липидов кровью
- •7.11. Обмен триацилглицеринов
- •7.11.1. Распад триацилглицеринов в тканях (липолиз)
- •7.11.1.1. Окисление жирных кислот.
- •Химизм β - окисления насыщенных жирных кислот
- •7.11.2.3. Синтез триацилглицеринов
- •7.12. Обмен глицерофосфолипидов
- •7.12.1. Синтез глицерофосфолипидов
- •7.12.2. Распад глицерофосфолипидов
- •7.13. Обмен сфинголипидов
- •7.13.1. Синтез сфинголипидов
- •7.13. 2. Распад сфинголипидов
- •7.14. Обмен холестерина
- •7.14.1. Биосинтез холестерина
- •7.14.2. Использование холестерина в тканях
- •7.14.3. Выведение холестерина из организма
- •7.14.4. Нарушение обмена холестерина
- •7.15. Взаимосвязь липидного и углеводного обменов
- •7.15.1. Ацетоновые тела
- •7.16. Регуляция липидного обмена
- •7.17. Патология липидного обмена
- •7.18. Перекисное окисление липидов (пол)
- •7.18.1. Витамин е
- •7.19. Эйкозаноиды
- •7.19.1. Синтез и краткая характеристика эйкозаноидов
- •8. Обмен белков и аминокислот
- •8.1. Общие сведения об азотистом обмене
- •8.2. Переваривание белков
- •8.3. Всасывание аминокислот
- •8.4. Гниение белков в толстом кишечнике
- •8.4.1. Обезвреживание продуктов гниения белков в печени
- •8.5. Динамическое состояние белков в тканях организма
- •8.5.1. Пути образования и использования аминокислот в тканях
- •8.6. Катаболизм аминогруппп аминокислот
- •8.6.1. Трансаминирование аминокислот
- •8.6.1.1. ВитаминВ6
- •8.6.2. Дезаминирование аминокислот
- •8.6.2.1. Окислительное дезаминирование
- •8.6.2.2. Непрямое дезаминирование
- •8.6.2.3. Внутримолекулярное дезаминирование
- •8.7. Декарбоксилирование аминокислот. Биогенные амины
- •8.8. Образование и обезвреживание аммиака в организме
- •8.8.1. Пути временного (экстренного) связывания аммиака в тканях
- •8.8.1.1. Восстановительное аминирование альфа-кетокислот
- •8.8.1.2. Амидирование тканевых белков
- •8.8.1.3. Биосинтез глютамина
- •8.8.2. Конечные продукты азотистого обмена
- •8.8.2.1. Синтез аммонийных солей в почках
- •8.8.2.2. Биосинтез мочевины и его нарушения
- •Особенности выведения конечных азотистых продуктов у детей
- •Аферментозы биосинтеза мочевины
- •8.9. Обмен безазотистых радикалов аминокислот
- •8.10. Особенности обмена отдельных аминокислот
- •8.10.1. Обмен глицина и серина
- •8.10. 1.1. Фолиевая кислота
- •8.10. 2. Обмен серосодержащих аминокислот цистеина и метионина
- •8.10. 2.1. Витамин в12
- •8.10.2.2. Нарушения обмена серосодержащих аминокислот
- •8.10.3. Обмен фенилаланина и тирозина и его нарушения
- •8.11. Регуляция белкового обмена
- •8.12. Патология белкового обмена
- •9. Обмен и функции нуклеиновых кислот
- •9.1. Химический состав и строение нуклеиновых кислот
- •9.2. Обмен нуклеиновых кислот
- •9.2.1. Переваривание нуклеиновых кислот
- •9.2.2. Распад нуклеиновых кислот в тканях
- •9.2.2.1. Распад пуриновых нуклеотидов и его нарушения
- •9.2.2.2. Распад пиримидиновых нуклеотидов
- •9.2.3. Биосинтез пуриновых нуклеотидов и его нарушения
- •9.2.4. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов
- •9.3. Биосинтез днк
- •9.4. Биосинтез рнк (транскрипция)
- •9.5. Биосинтез белков (трансляция)
- •9.5.1. Характеристика генетического кода
- •9.5.2. Трансляция
- •9.5.3. Посттрансляционная модификация белков
- •9.5.4. Ингибиторы биосинтеза белка
- •9.5.5. Регуляция биосинтеза белка
- •10. Биохимия гормонов
- •10.1. Классификация гормонов по их химической природе
- •10.2. Общие сведения об обмене гормонов
- •10.3. Механизмы действия гормонов
- •10.3.2. Мембранный механизм действия водорастворимых гормонов
- •10.3.2.1. Циклические нуклеотиды - цАмф, цГмф - вторичные посредники
- •10.4. Краткая характеристика гормонов
- •10.4.1. Белково-пептидные гормоны
- •10.4.1.1. Гормоны гипофиза
- •10.4.1.2. Гормоны паращитовидных желез
- •10.4.1.3. Гормоны поджелудочной железы
- •10.4.1.4. Гормоны вилочкой железы
- •10.4.2. Гормоны- производные аминокислот
- •10.4.2.1. Гормоны щитовидной железы
- •10.4.2.2. Гормоны мозгового слоя надпочечников (катехоламины)
- •10.4.2.3. Гормоны эпифиза
- •10.4.3. Стероидные гормоны
- •10.4.3.1. Гормоны коры надпочечников
- •10.4.3.2. Мужские половые гормоны (андрогены)
- •10.4.3.3. Женские половые гормоны (эстрогены)
- •10.5. Гормоны плаценты
- •10.7. Особенности гормонального статуса у детей
- •11. Биохимия крови
- •11.1. Биохимия эритроцитов.
- •11.2. Обмен гемопротеидов
- •11.2.1. Синтез гема и его нарушения
- •11.2.2. Переваривание и распад гемоглобина в тканях
- •11.2.3. Нарушения распада гемоглобина
- •11.3. Химический состав плазмы крови
- •11.3.1. Белки плазмы крови
- •11.3.1.1. Изменение белкового состава крови при заболеваниях
- •11.3.2. Небелковые азотсодержащие вещества крови
- •11.3.2.1. Кининовая система крови.
- •11.3.3. Безазотистые органические вещества крови
- •11.3.4. Минеральные вещества крови
- •11.4. Физико-химические свойства крови.
- •11.4.1. Нарушения кислотно-основного баланса
- •11.4.2. Особенности кислотно-основного состояния у детей.
- •11.5. Дыхательная функция крови
- •11.5.1. Транспорт кислорода и его нарушения
- •11.5.2. Транспорт со2
- •11.6. Регуляция агрегатного состояния крови
- •11.6.1. Свёртывающая система крови
- •11.6.1.1. Плазменные факторы свёртывающей системы крови
- •11.6.1.2. Схема свёртывания крови
- •11.6.1.3. Витамин к
- •11.6.2. Противосвёртывающая система крови
- •11.6.3. Детские особенности системы гемостаза
- •11.6.4. Нарушения гемостаза
- •12. Водно–минеральный обмен
- •12.1. Водно-солевой обмен
- •12.1.1. Обмен натрия и калия
- •12.1.2. Регуляция водно-солевого обмена
- •12.1.3. Нарушение водно-солевого обмена
- •12.1.4. Роль почек в водно-солевом обмене
- •12.1.5. Особенности водного обмена у детей
- •12.2. Кальций - фосфорный обмен
- •12.2.1. Регуляция кальций – фосфорного обмена.
- •13.2.1.1. Витамин d
- •12.2.2. Нарушения кальций – фосфорного обмена
- •12.3. Обмен железа и его нарушения
- •13. Тканевая биохимия
- •13.1. Биохимия соединительной ткани
- •13.1.1. Витамин с
- •13.2. Биохимия мышечной ткани
- •13.3. Биохимия нервной ткани
- •13.4. Биохимия печени
- •Оглавление
2.6.7. Зависимость скорости ферментативных реакций от присутствия активаторов и ингибиторов.
2.6.7.1. Влияние активаторов ферментов
Активаторы – вещества, повышающие скорость ферментативных реакций. Различают специфические активаторы, повышающие активность одного фермента (НСl- активатор пепсиногена) и неспецифические активаторы, увеличивающие активность целого ряда ферментов (ионыMg– активаторы гексокиназы, К,Na–АТФ-азы и ряда других ферментов). В качестве активаторов могут служить ионы металлов, метаболиты, нуклеотиды.
Механизм действия активаторов может быть различным.
Достраивание активатором активного центра фермента, в результате чего облегчается взаимодействие фермента с субстратом. Таким механизмом обладают в основном ионы металлов.
Аллостерический активатор взаимодействует с аллостерическим участком (субъединицей) фермента, через его изменения опосредованно изменяет структуру активного центра и увеличивает активность фермента. Аллостерическим эффектом обладают метаболиты ферментативных реакций, АТФ.
Аллостерический механизм может сочетаться с изменением олигомерности фермента. Под действием активатора происходит объединение нескольких субъединиц в олигомерную форму, что резко увеличивает активность фермента. Например, изоцитрат является активатором олигомерного фермента ацетил-КоА карбоксилазы.
Фосфолирирование - дефосфолирирование ферментов относится к обратимой модификации ферментов. Присоединение Н3РО4чаще всего резко увеличивает активность фермента. Например, два неактивных димера фермента фосфорилазы соединяются с четырьмя молекулами АТФ и образуют активную тетрамерную фосфорилированную форму фермента. Фосфолирирование ферментов может сочетаться с изменением их олигомерности. В некоторых случаях фосфорилирование фермента, наоборот, снижает его активность (например, фосфорилирование фермента гликогенсинтетазы)
Частичный протеолиз (необратимая модификация). При данном механизме от неактивной формы фермента (профермента) отщепляется фрагмент молекулы, блокирующий активный центр фермента. Например, неактивный пепсиноген под действием HCLпереходит в активный пепсин.
2.6.7.2. Влияние ингибиторов ферментов
Ингибиторы – вещества, понижающие активность фермента. Выделяют различные виды ингибиторов.
По специфичностивыделяют специфичные и неспецифичные ингибиторы
По обратимостиэффекта различают обратимые и необратимые ингибиторы.
По месту действиявстречаются ингибиторы, действующие на активный центр и вне активного центра.
По механизму действияразличают конкурентные и неконкурентные ингибиторы.
Конкурентные ингибиторыимеют структуру, близкую к структуре субстрата. В силу этого ингибитор и субстрат конкурируют за связывание активного центра фермента. Конкурентное ингибирование - это обратимое ингибирование Эффект конкурентного ингибитора может быть уменьшен путём повышения концентрации субстрата реакции
Примером конкурентного ингибирования может служить угнетение активности сукцинатдегидрогеназы, катализирующей окисление дикарбоновой янтарной кислоты, дикарбоновой малоновой кислотой, сходной по структуре с янтарной кислотой.
Принцип конкурентного ингибирования широко используется при создании лекарственных средств. Например, сульфаниламидные препараты имеют структуру, близкую к структуре парааминобензойной кислоты, необходимой для роста микроорганизмов. Сульфаниламиды блокируют ферменты микроорганизмов, необходимые для усвоения парааминобензойной кислоты. Некоторые противоопухолевые препараты являются аналогами азотистых оснований и, тем самым, ингибируют синтез нуклеиновых кислот (фторурацил).
Графически конкурентное ингибирование имеет вид, представленный на рисунке.
Неконкурентные ингибиторыструктурно не схожи с субстратами реакций и поэтому не могут вытесняться при высокой концентрации субстрата. Существует несколько вариантов действия неконкурентных ингибиторов:
Блокирование ингибитором функциональной группы активного центра фермента и, вследствие этого, уменьшение активности. Например, активность SН - групп могут уменьшать тиоловые яды обратимо (соли металлов, ртути, свинца) и необратимо (монойодацетат). Эффект ингибирования тиоловых ингибиторов может быть уменьшен введением добавочных веществ, богатыхSHгруппами (например, унитиол). Существуют сериновые ингибиторы, блокирующие ОН - группы активного центра ферментов. Таким эффектом обладают органические фосфофторсодержащие вещества. Эти вещества могут, в частности, ингибировать ОН - группы в ферменте ацетилхолинэстеразе, разрушающей нейромедиатор ацетилхолин.
Блокирование ингибитором ионов металлов, входящих в состав активного центра ферментов. Например, цианиды блокируют атомы железа, ЭДТА (этилендиаминтетраацетат) блокирует ионы Са 2+,Mg2+.
Аллостерический ингибитор взаимодействует с аллостерическим участком, опосредованно через него по принципу кооперативности, меняя структуру и активность каталитического участка. Графически неконкурентное ингибирование имеет вид:
Как видно из рисунка, максимальная скорость реакции при неконкурентном ингибировании не может быть достигнута путём повышения концентрации субстрата.