Простетическая группа
Примером простетической группы
является витамин Н (биотин)
биотин связан с апоферментом ковалентно через остаток лизина.
Является кофактором ферментов осуществляющих карбоксилирование, напр. пируваткарбоксилаза.
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
22 |
Тиаминпирофосфат, ТПФ
|
|
|
|
|
CH3 |
Cl- |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
N |
|
|
N+ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
O |
|
OH |
|||||||||||||
|
|
|
|
|
||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
S |
O |
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
H3C N NH2 |
|
P |
|
P |
|
OH |
||||||||||||||
|
|
|
|
|||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
O |
||||||||||
Тиаминпирофосфат, ТПФ (производное витамина В1, тиамин) – кофермент пируватдегидрогеназного и альфа-кетоглутаратдегидрогеназного комплексов;
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
23 |
Витамин PP
OH
O
N
NH2
O
N
Витамин PP
(никотиновая кислота,
ниацин) в форме
никотинамида входит в состав NAD+ и NADP+, которые являются коферментами NAD(P)-зависимых (пиридиновых) дегидрогеназ.
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
24 |
Строение NAD+ и NADP+
NH2
O
|
|
|
|
|
|
|
N+ |
|
|
|
|
|
NH2 |
O |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
|
H |
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
H |
|
|
|
|
N+ |
|
|
OH |
OH |
|
|
|
|
O |
P |
O- |
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|||
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
H |
H |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
H |
|
|
|
N |
|
|
|
OH |
OH |
-O |
|
|
N |
|
O |
P |
O- |
|
P |
O |
|
||
|
O |
|
|
NH2 |
|
|
N |
|
|
|
|
|
|
|
N |
||
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
N |
|
O |
|
|
|
-O |
P |
O |
N |
|
O |
|
||
|
|
|
|
|||||
|
|
|
N |
|
|
H |
H |
|
|
|
|
N |
|
H |
H |
|
|
|
O |
|
|
|
|
|||
|
O |
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
OH |
O |
|
|
|
|
H |
H |
|
|
|
|
|
|
|
H |
H |
|
|
|
O P OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
OH |
OH |
|
|
|
|
|
OH
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
25 |
Рибофлавин, витамин B2. Строение ФАД
OH
O
|
|
OH |
H3C |
|
|
|
|
|
OH |
|
H3C |
|
OH |
|
|
|
|
|
|
H3C |
N N O |
|
|
NH H3C N 
Рибофлавин O
Образует ФАД и ФМН – коферменты ряда дегидрогеназ, напр. сукцинатдегидрогеназы.
N
NH
NN 
O
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2C |
CH |
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
HO |
|
|
|
|
|
CH |
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
O |
CH2 |
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
||||
O |
|
P |
|
O- |
|
N |
|
|
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
-O |
|
|
O |
|
|
O |
|
|
|
N |
||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
P |
|
|
|
N |
|
N |
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2 |
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
O |
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
H |
H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
H |
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|||
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
26 |
Пантотеновая кислота
H3C
|
|
CH3 |
|
|
|
|
|
HO |
C |
|
HN |
|
CH2 |
|
O |
|
|
||||||
C |
|
|
|
|
|
|
|
H2 |
CH |
|
C |
|
H2C |
|
C |
|
|
||||||
HO |
O |
OH |
Пантотеновая кислота – входит в состав
коэнзима А (кофермента ацилирования ).
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
27 |
Металлы как кофакторы
Многие двухвалентные металлы (Сu2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+, Mn2+, Мg2+, Ca2+) тоже выполняют роль кофакторов, хотя и не относятся ни к простетическим группам, ни к коферментам.
Металлы входят в состав активного центра или стабилизируют оптимальный вариант структуры активного центра фермента.
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
28 |
Металлы как кофакторы (прод.)
Металл |
Фермент |
Fe2+, Fe3+ |
гемоглобин, каталаза, пероксидаза |
Cu+, Cu2+ цитохромоксидаза |
|
Zn2+ |
ДНК-полимераза, алкогольдегидрогеназа |
Mg2+ |
гексокиназа |
Mn2+ |
аргиназа |
Ni2+ |
уреаза |
Se2+ |
глутатионредуктаза |
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
29 |
Структурно-функциональная организация ферментов.
Активный центр
Активный (субстратный) центр - это совокупность функциональных групп, расположенных в разных участках ПП цепи, но близко структурно и функционально ориентированных (в третичной структуре) и имеющих прямое отношение к катализу.
Этот центр состоит из функциональных групп и радикалов: SH-(цистеина); -ОН(серина); COOH-(АСП); имидазольного кольца гистидина.
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
30 |
Структурно-функциональная организация ферментов. Строение активного центра фермента
Активный центр включает в себя:
1. Каталитический участок или центр, непосредственно взаимодействующий с субстратом, осуществляющий катализ.
2. Контактная, или якорная площадка - она обеспечивает специфическое сродство фермента к субстрату и является местом фиксации субстрата на поверхности фермента.
3. Вспомогательные участки - карманы, щели и др.
07/06/19 |
Коваль А. Н. (C), 2006 |
31 |