Подготовка у универсиаде 2012 / Генетика (Жимулев) / 7-2ver7
.pdf
Структура гена |
Глава 7 |
|
|
Рисунок 7.25
Напрвлениедвижения |
фрагментовДНК |
Контроль |
Образцы ДНК из костных останков |
|
|||||||
Старт |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
Y - 112 ï.í. 
X - 106 ï.í. 

Определение половой принадлежности по анализу ДНК из костных останков (Из: Янковский, 1996, стр. 24).
112 п.н., соответствующий гену амелогенина |
7.4.9. Определение |
|
|
||
в Y хромосоме, и 106 п.н., соответствующий |
последовательности |
|
|||
этому же гену в Х хромосоме. У женщин |
нуклеотидов (секвенирование) |
||||
имеется две Х хромосомы, каждая из |
В 1970х годах были разработаны две |
||||
которых дает фрагмент 106 п.н. В |
|||||
методики определения последовательностей |
|||||
исследованных девяти образцах в 4 случаях |
нуклеотидов в клонированных фрагментах |
||||
видны две полосы, а в 5 - одна полоса (Рис. |
ДНК. Одну предложили А. Максам (A. |
||||
7.24). Следовательно, среди убитых было 4 |
Maxam) и У. Гилберт (W. Gilbert), другую – |
||||
мужчины и 5 женщин. Именно столько |
Ф. Сэнгер (F. Sanger). Метод Сэнгера, |
||||
женщинбыловцарскойсемье,расстрелянной |
используемый чаще, будет рассмотрен ниже. |
||||
в Екатеринбурге в июле 1918 года (Из: |
ДНК денатурируют до однонитчатого |
||||
Янковский, 1996). |
|||||
состояния щелочной обработкой |
èëè |
||||
|
|||||
Литература к разделу 7.4.8. |
нагреванием. Затем отжигают с одной из |
||||
нитейкороткийолигонуклеотидныйпраймер |
|||||
Иванов П.Л. Молекулярно-генетическая |
|||||
(Рис. 7.26). Олигонуклеотид синтезируется |
|||||
индивидуализация человека. Автореферат |
таким образом, чтобы его 3'-конец был |
||||
докт. диссер., Москва, 1995. |
последним |
перед |
секвенируемой |
||
Янковский Н.К. Молекулярно-генетические |
|||||
методы в руках детектива, или опыт |
последовательностью. Олигонуклеотид |
||||
исследования останков семьи последнего |
служит праймером для достраивания цепи |
||||
российского императора. Соросовский |
ДНК-полимеразой. |
|
|
||
образовательный журнал 2: 21-27, 1996. |
Для каждого эксперимента |
ïî |
|||
MullisK.B.Theunusualoriginofthepolymerasechain |
секвенированию ставятся четыре реакции с |
||||
reaction. Scientific American April: 56-65, |
однонитчатой ДНК и прикрепленным к ней |
||||
1990. |
праймером. Каждая реакционная смесь |
||||
Russell, P.J. Genetics Fifth edition. Addison Wesley |
содержит |
четыре |
нормальных |
||
Longman,Ins,MenloPark,California,476-478, |
предшественника ДНК: dATP, dTTP, dCTP и |
||||
1998. |
dGTP, а также ДНК-полимеразу (чаще |
||||
|
|||||
используют ДНК-полимеразу фага T7). Предшественники метятся радиоактивно изотопами ! P, !!P èëè !#S, или нерадиоактивно. Реакции различаются
167
Глава 7 |
Структура гена |
|
|
|
|
Рисунок 7.26 |
|
3’ 5’
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Радиоактивный |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
T |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
3’ |
олигонуклеотидный |
||||
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
C |
|
|
|
праймер |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
G |
|
|
|
достраивается |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
Анализируемая |
|
|
|
|
|
G |
|
|
|
ДНК-полимеразой |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
A |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
последовательность |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
T |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
T |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
G |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
A |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
5’ |
|
|
|
|
|
|||
Реакция |
|
ddA |
ddG |
ddC |
ddT |
||||||
5’ |
ddA A A |
|
A A |
A A A |
A A |
||||||
|
|
|
G G |
ddG G |
G G G |
G G |
|||||
Продукты |
|
|
C C |
|
|
C |
ddC C C |
C C |
|||
|
|
C C |
|
|
C |
ddC C |
C C |
||||
ÄÍÊ |
|
|
|
|
|||||||
|
|
T T |
|
|
T |
T |
ddT T |
||||
|
|
ddA A |
|
|
A |
A |
A |
||||
|
|
|
|
|
G |
|
ddG |
G |
G |
||
|
|
|
ddA |
|
|
|
A |
A |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ddC |
C |
3’ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ddT |
Число нуклеотидов |
1 6 8 |
2 7 |
3 4 9 |
510 |
|||||||
|
Длинные |
|
|
|
|
ddA |
|
|
|
ddG |
|
|
|
ddC |
|
|
|
ddT |
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
фрагменты |
10 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
меченогоДлина |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
фрагмента нуклеотидахв |
9 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
8 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
7 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
6 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
5 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Короткие |
1 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
фрагменты |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Последовательность: 5’ A - G - C - C - T - A - G - A - C - T 3’
Схема опыта по определению последовательности нуклеотидов.
168
Структура гена |
|
|
|
|
|
Глава 7 |
|
|
|
|
|
|
|||
присутствием |
òîãî |
èëè |
иного |
Зеленин А.В. Генная терапия: этические |
|||
модифицированного |
основания, |
аспекты и проблемы генетической |
|||||
называемого дидезоксинуклеотидом, |
безопасности. Генетика 35: 1605-1612, |
||||||
поскольку у этих нуклеотидов в 3' позиции |
1999. |
|
|
||||
Лещинская И.Б. Генетическая инженерия. |
|||||||
дезоксирибозы находится H, а не OH как у |
|||||||
дезоксинуклеотидов. Дидезоксинуклеотид |
Соросовский образовательный журнал |
||||||
1: 32-39, 1997. |
|
||||||
может включаться в растущую цепь ДНК, |
|
||||||
Свердлов |
Е.Д. Очерки |
современной |
|||||
однако на этом синтез останавливается, |
молекулярной генетики. Молекулярная |
||||||
поскольку отсутствие 3'-OH предотвращает |
|||||||
генетика, микробиология и вирусология |
|||||||
|
|
|
|
||||
образование фосфодиэфирной связи с |
2, 3, 4, 1995. |
|
|||||
последующим нуклеотидом. Поэтому в |
Фаворова О.О. Лечение генамифантастика |
||||||
каждой реакционной смеси присутствуют по |
èëè |
реальность? |
Соросовский |
||||
4 нормальных dNTP и один ddNTP, в |
образовательный журнал 2: 21-27, 1997. |
||||||
соотношении примерно 100:1. Таким |
Alberts B., Bray D., Lewis J., Raff M., Roberts K., |
||||||
образом, ДНК растет от праймера до того |
Watson J.D. Molecular biology of the cell |
||||||
момента, когда |
â îäíó |
èç |
позиций |
(Third edition) Garland Publishing, Inc. New |
|||
York, London, 287-301, 1994. |
|||||||
встраивается дидезоксинуклеотид. Поэтому |
|||||||
Antonarakis S.E., Scott H.S. The human genome |
|||||||
в реакции будет множество фрагментов, |
|||||||
различающихся по длине, так как синтез их |
project and its impact in medicine. European |
||||||
Review 4 4: 415-426, 1996. |
|
||||||
начинается с фиксированной точки (от |
|
||||||
Birnstiel M.L. Gene therapy. European Review 4 4: |
|||||||
праймера), а кончается в положении одного |
335-356, 1996. |
|
|||||
|
|
|
|
|
|||
из нуклеотидов, |
соответствующему |
Birnstiel M.L. The genetic revolution 1950-1996: an |
|||||
дидезоксинуклеотида. В электрофорезе они |
introduction. European Review 4 4: 333-334, |
||||||
разделяются и последовательность легко |
1996. |
|
|
||||
определяется (Рис. 7.26). |
|
|
Lewin B. Genes. Oxford, New York, Tokyo; Oxford |
||||
|
|
|
|
University Press, 633-656, 1994. |
|||
Литература к разделу 7.4.9. |
Murrey N.E. Gene cloning. European Review 4 4: |
||||||
Russell, P.J. Genetics, Fifth edition. Addison Wesley |
357-370, 1996. |
|
|||||
Russell, P.J. Genetics Fifth edition. Addison Wesley |
|||||||
Longman, Ins, Menlo Park, California, 473- |
|||||||
Longman, Ins, Menlo Park, California, 479- |
|||||||
476, 1998. |
|
|
|
||||
|
|
|
493, 1998. |
|
|||
|
|
|
|
|
|||
7.4.10. Применение |
|
|
SibiliaM.,WagnerE.F.Transgenicanimals.European |
||||
|
|
Review 4 4: 371-391, 1996. |
|
||||
технологий с использованием |
|
||||||
Shizuyer H., Birren B., Kim U.-J., Mancino V., |
|||||||
рекомбинантной ДНК |
|
||||||
|
Slepak T., Tachiiri Y., Simon M. Cloning and |
||||||
|
|
|
|
||||
С начала 1970х годов, когда появилась |
stable maintenance of 300-kilobase-pair |
||||||
первая публикация о получении in vitro |
fragments of human DNA in Escherichia coli |
||||||
рекомбинантной ДНК, возникла новая наука |
using an F-factor-based vector. Proc. Natl |
||||||
– генная инженерия. Основные направления |
Acad. Sci. USA 89: 8794-8797, 1992. |
||||||
Strachan T., Read A.P. Human Molecular Genetics. |
|||||||
–созданиетрансгенныхживотныхирастений, |
|||||||
иразработкапринциповгеннойтерапии. |
Bios Scientific Publishers limited. Oxford, 96- |
||||||
106, 1996. |
|
||||||
|
|
|
|
|
|||
Литература к разделу 7.4.10. |
Walden R., Maas C., Martini N., Schell J. Transgenic |
||||||
plants. European Review 4 4: 393-414, 1996. |
|||||||
Алиханян С.И., Акифьев А.П., Чернин Л.С. |
|||||||
|
|
|
|||||
Общая генетика. Москва, Высшая школа, |
7.4.11. Трансформация у |
||||||
411-426, 1985. |
|
|
|
дрозофилы |
|
||
Глеба Ю.Ю. Биотехнология |
растений. |
|
|||||
Соросовский образовательный журнал |
Трансформацией в генетике называют |
||||||
6: 3-8, 1998. |
|
|
|
перенос генов из одного организма в другой. |
|||
169
Глава 7 |
|
Структура гена |
|
|
|
|
|
ТрансформацииупрокариотпосвященРаздел |
|
|
|
|
Рисунок 7.27 |
||
5.10. |
|
|
|
Уэукариоттрансформациявприродедо |
|
|
|
сих пор не обнаружена. Что же касается |
|
|
|
экспериментальной передачи ДНК из одной |
|
|
|
клеткивдругую,тонапротяжениимногихлет |
|
|
|
она у исследователей не получалась. Многие |
|
|
|
группыученыхазартноконкурировалидругс |
|
|
|
другом в конце 1970-х - начале 1980-х годов, |
|
|
|
пытаясьпервымиосуществитьпереносДНК. |
|
|
|
Успехибыливесьмаредкими:молекулыДНК, |
|
|
|
инъецированныемикрохирургическивранние |
|
|
|
эмбрионынекоторыхвидовмлекопитающих, |
|
|
|
амфибий,морскихежей,иногдавстраиваются |
|
|
|
в хромосомы клетки-хозяина. У дрозофилы |
|
|
|
искусственно введенная ДНК почти не |
|
|
|
включается в хромосомы эмбриона, хотя в |
|
Джеральд Рубин |
|
культуреклетоктипичнаятрансформация(или |
|
||
|
ðîä. 1950 |
||
|
|
|
|
как говорят, трансфекция) происходит |
|
|
|
довольно часто. Однако, очевидно, что из |
|
||
|
Рисунок 7.28 |
||
такой клетки трудно получить целый |
|
|
|
организм, и трансформированная ДНК не |
|
|
|
может передаваться потомству. |
|
|
|
В конце концов повезло двум |
|
|
|
американским исследователям Дж. Рубину и |
|
|
|
А. Спрадлингу (Рис. 7.27 и 7.28) в 1982 году. |
|
|
|
Для переноса ДНК они использовали |
|
|
|
мобильный P-элемент. Для осуществления |
|
|
|
транспозиции у Р-элемента существуют |
|
|
|
специальноустроенныеструктуры-концевые |
|
|
|
повторы - по 150 п.н. определенной |
|
|
|
последовательностинакаждомконцеэлемента, |
|
|
|
совершенно необходимые для перемещений. |
|
|
|
Именно с этими участками связывается |
|
|
|
транспозаза и |
катализирует процесс |
|
|
встраивания-вырезания Р-элемента. Таким |
|
Аллан Спрадлинг |
|
образом, для нормального перемещения Р- |
|
ðîä. 1949 |
|
элемента нужно, чтобы были выполнены два |
|
|
|
|
|
||
условия: наличие у него неповрежденных |
легко компенсирован, если в геноме |
||
концевыхповторовинормальнаяактивность |
присутствуетещеодинР-элемент,нормальный, |
||
транспозазы.Еслибудетнарушенкакой-либо |
которыйиобеспечитналичиетранспозазы. |
||
из экзонов гена транспозазы или во время |
|
Учитывая все перечисленное выше, |
|
транскрипции и созревания матричной РНК |
экспериментпотрансформацииудрозофилы |
||
транспозазынебудетудаленодинизинтронов, |
схематическивыглядитследующимобразом: |
||
полноценного фермента транспозазы не |
готовят ДНК двух Р-элементов, один из |
||
получится, и Р-элемент не будет |
которыхможетсинтезироватьтранспозазу,но |
||
перемещаться. |
Однако, недостаток |
не способен встраиваться в геном, так как у |
|
транспозазыизодногоР-элементаможетбыть |
негоповрежденодинизконцевых(с3’-конца) |
||
170
Структура гена
повторов-рπ 25.7wcна Рисунок 7.29 Рис. 7.29 - в то время
как во втором Р- элементе удалена значительная часть генатранспозазы,ноон
может перемещаться по геному, поскольку имеет нормальные концевыеповторы-это
P[(ry+)A] на Рис. 7.29. В Р-элемент P[(ry+)A],являющийся вектором и имеющий дефективный ген транспозазы, обычно
âс т р а и в а ю т дополнительный фрагментДНКдлиной
до20т.п.н.,которыйхотяттрансформировать
âгеном дрозофилы. Р-элемент P[(ry+)A] называют транспозоном, а ρπ 25.7wc - элементом-хелперомилипомощником.
Затем смесь этих двух сортов ДНК инъецируют в эмбрион дрозофилы. Там некоторая ее часть встраивается в ДНК полярных клеток, из которых позднее образуютсяклеткизародышевогопути.Таким образом,чужероднаяДНК,инъецированнаяв эмбрион на ранних стадиях развития, передаетсяследующимпоколениямпотомков.
Многие факторы, в том числе и размер встроенного в Р-элемент фрагмента чужеродной ДНК влияют на успех трансформации; в среднем только около 14% инъецированных эмбрионов развиваются в плодовитоепотомство.Поэтомувстаетвопрос о том как различить мух, у которых инъецированнаяДНКвстроиласьвгеномимух безвстройки.ДляэтоговР-элемент P[(ry+)A] вводятспециальныемаркерныегены.Этомогут бытьлибогеныдрозофилы,контролирующие окраску глаз, например, ген rosy (ry+ на Рис. 7.29), гены дрозофилы, кодирующие синтез ферментов,например,алкогольдегидрогеназы или даже ген, выделенный из генома медузы, кодирующийбелок-GFP,обнаруживающийпри
определенных условиях флюоресценцию.
Разберем сначала схему, в которой используется ген rosy (Рис. 7.29). В этом случаевР-элементP[(ry+)A] введенфрагмент ДНК, содержащий нормальный аллель гена rosy. ДНК этого транспозона вместе с ДНКхелпераинъецируютвэмбрионы,гомозигоные по мутации rosy - ry506. Если транспозон P[(ry+)A] встроился в геном, то в поколении G1появятся мухи с нормальнымцветомглаз, посколькууних-гомозиготпомутацииry506 - появитсяДНКснормальнымаллелемгенаry+ втранспозоне.
Недавно для маркировки произошедшего встраивания транспозона в качестве маркера стали использовать кДНК гена GFP, подшитого вместе с подходящим промотором.Вслучаеинсерциитранспозона в различных клетках дрозофилы синтезируется белок GFP. В результате облучения этих клеток длинноволновым ультрафиолетовым светом белок GFP начинаетфлуоресцироватьзеленымсветом.
С какими целями используют трансформациювэкспериментальнойгенетике?
Можновыделитьнескольконаправлений. 1.Впроцессеклонированияивыделения генов всегда остается вопрос о том, весь ли
171
