Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Скачиваний:
7
Добавлен:
06.06.2015
Размер:
1.14 Mб
Скачать

Структура гена

Глава 7

 

 

Рисунок 7.25

Напрвлениедвижения

фрагментовДНК

Контроль

Образцы ДНК из костных останков

 

Старт

1

2

3

4

5

6

7

8

9

Y - 112 ï.í.

X - 106 ï.í.

Определение половой принадлежности по анализу ДНК из костных останков (Из: Янковский, 1996, стр. 24).

112 п.н., соответствующий гену амелогенина

7.4.9. Определение

 

 

в Y хромосоме, и 106 п.н., соответствующий

последовательности

 

этому же гену в Х хромосоме. У женщин

нуклеотидов (секвенирование)

имеется две Х хромосомы, каждая из

В 1970х годах были разработаны две

которых дает фрагмент 106 п.н. В

методики определения последовательностей

исследованных девяти образцах в 4 случаях

нуклеотидов в клонированных фрагментах

видны две полосы, а в 5 - одна полоса (Рис.

ДНК. Одну предложили А. Максам (A.

7.24). Следовательно, среди убитых было 4

Maxam) и У. Гилберт (W. Gilbert), другую –

мужчины и 5 женщин. Именно столько

Ф. Сэнгер (F. Sanger). Метод Сэнгера,

женщинбыловцарскойсемье,расстрелянной

используемый чаще, будет рассмотрен ниже.

в Екатеринбурге в июле 1918 года (Из:

ДНК денатурируют до однонитчатого

Янковский, 1996).

состояния щелочной обработкой

èëè

 

Литература к разделу 7.4.8.

нагреванием. Затем отжигают с одной из

нитейкороткийолигонуклеотидныйпраймер

Иванов П.Л. Молекулярно-генетическая

(Рис. 7.26). Олигонуклеотид синтезируется

индивидуализация человека. Автореферат

таким образом, чтобы его 3'-конец был

докт. диссер., Москва, 1995.

последним

перед

секвенируемой

Янковский Н.К. Молекулярно-генетические

методы в руках детектива, или опыт

последовательностью. Олигонуклеотид

исследования останков семьи последнего

служит праймером для достраивания цепи

российского императора. Соросовский

ДНК-полимеразой.

 

 

образовательный журнал 2: 21-27, 1996.

Для каждого эксперимента

ïî

MullisK.B.Theunusualoriginofthepolymerasechain

секвенированию ставятся четыре реакции с

reaction. Scientific American April: 56-65,

однонитчатой ДНК и прикрепленным к ней

1990.

праймером. Каждая реакционная смесь

Russell, P.J. Genetics Fifth edition. Addison Wesley

содержит

четыре

нормальных

Longman,Ins,MenloPark,California,476-478,

предшественника ДНК: dATP, dTTP, dCTP и

1998.

dGTP, а также ДНК-полимеразу (чаще

 

используют ДНК-полимеразу фага T7). Предшественники метятся радиоактивно изотопами ! P, !!P èëè !#S, или нерадиоактивно. Реакции различаются

167

Глава 7

Структура гена

 

 

 

 

Рисунок 7.26

 

3’ 5’

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Радиоактивный

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3’

олигонуклеотидный

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C

 

 

 

праймер

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G

 

 

 

достраивается

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Анализируемая

 

 

 

 

 

G

 

 

 

ДНК-полимеразой

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

последовательность

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

T

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5’

 

 

 

 

 

Реакция

 

ddA

ddG

ddC

ddT

5’

ddA A A

 

A A

A A A

A A

 

 

 

G G

ddG G

G G G

G G

Продукты

 

 

C C

 

 

C

ddC C C

C C

 

 

C C

 

 

C

ddC C

C C

ÄÍÊ

 

 

 

 

 

 

T T

 

 

T

T

ddT T

 

 

ddA A

 

 

A

A

A

 

 

 

 

 

G

 

ddG

G

G

 

 

 

ddA

 

 

 

A

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ddC

C

3’

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ddT

Число нуклеотидов

1 6 8

2 7

3 4 9

510

 

Длинные

 

 

 

 

ddA

 

 

 

ddG

 

 

 

ddC

 

 

 

ddT

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фрагменты

10

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

меченогоДлина

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фрагмента нуклеотидахв

9

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

8

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

7

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

6

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Короткие

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фрагменты

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Последовательность: 5’ A - G - C - C - T - A - G - A - C - T 3’

Схема опыта по определению последовательности нуклеотидов.

168

Структура гена

 

 

 

 

 

Глава 7

 

 

 

 

 

присутствием

òîãî

èëè

иного

Зеленин А.В. Генная терапия: этические

модифицированного

основания,

аспекты и проблемы генетической

называемого дидезоксинуклеотидом,

безопасности. Генетика 35: 1605-1612,

поскольку у этих нуклеотидов в 3' позиции

1999.

 

 

Лещинская И.Б. Генетическая инженерия.

дезоксирибозы находится H, а не OH как у

дезоксинуклеотидов. Дидезоксинуклеотид

Соросовский образовательный журнал

1: 32-39, 1997.

 

может включаться в растущую цепь ДНК,

 

Свердлов

Е.Д. Очерки

современной

однако на этом синтез останавливается,

молекулярной генетики. Молекулярная

поскольку отсутствие 3'-OH предотвращает

генетика, микробиология и вирусология

 

 

 

 

образование фосфодиэфирной связи с

2, 3, 4, 1995.

 

последующим нуклеотидом. Поэтому в

Фаворова О.О. Лечение генамифантастика

каждой реакционной смеси присутствуют по

èëè

реальность?

Соросовский

4 нормальных dNTP и один ddNTP, в

образовательный журнал 2: 21-27, 1997.

соотношении примерно 100:1. Таким

Alberts B., Bray D., Lewis J., Raff M., Roberts K.,

образом, ДНК растет от праймера до того

Watson J.D. Molecular biology of the cell

момента, когда

â îäíó

èç

позиций

(Third edition) Garland Publishing, Inc. New

York, London, 287-301, 1994.

встраивается дидезоксинуклеотид. Поэтому

Antonarakis S.E., Scott H.S. The human genome

в реакции будет множество фрагментов,

различающихся по длине, так как синтез их

project and its impact in medicine. European

Review 4 4: 415-426, 1996.

 

начинается с фиксированной точки (от

 

Birnstiel M.L. Gene therapy. European Review 4 4:

праймера), а кончается в положении одного

335-356, 1996.

 

 

 

 

 

 

из нуклеотидов,

соответствующему

Birnstiel M.L. The genetic revolution 1950-1996: an

дидезоксинуклеотида. В электрофорезе они

introduction. European Review 4 4: 333-334,

разделяются и последовательность легко

1996.

 

 

определяется (Рис. 7.26).

 

 

Lewin B. Genes. Oxford, New York, Tokyo; Oxford

 

 

 

 

University Press, 633-656, 1994.

Литература к разделу 7.4.9.

Murrey N.E. Gene cloning. European Review 4 4:

Russell, P.J. Genetics, Fifth edition. Addison Wesley

357-370, 1996.

 

Russell, P.J. Genetics Fifth edition. Addison Wesley

Longman, Ins, Menlo Park, California, 473-

Longman, Ins, Menlo Park, California, 479-

476, 1998.

 

 

 

 

 

 

493, 1998.

 

 

 

 

 

 

7.4.10. Применение

 

 

SibiliaM.,WagnerE.F.Transgenicanimals.European

 

 

Review 4 4: 371-391, 1996.

 

технологий с использованием

 

Shizuyer H., Birren B., Kim U.-J., Mancino V.,

рекомбинантной ДНК

 

 

Slepak T., Tachiiri Y., Simon M. Cloning and

 

 

 

 

С начала 1970х годов, когда появилась

stable maintenance of 300-kilobase-pair

первая публикация о получении in vitro

fragments of human DNA in Escherichia coli

рекомбинантной ДНК, возникла новая наука

using an F-factor-based vector. Proc. Natl

– генная инженерия. Основные направления

Acad. Sci. USA 89: 8794-8797, 1992.

Strachan T., Read A.P. Human Molecular Genetics.

–созданиетрансгенныхживотныхирастений,

иразработкапринциповгеннойтерапии.

Bios Scientific Publishers limited. Oxford, 96-

106, 1996.

 

 

 

 

 

 

Литература к разделу 7.4.10.

Walden R., Maas C., Martini N., Schell J. Transgenic

plants. European Review 4 4: 393-414, 1996.

Алиханян С.И., Акифьев А.П., Чернин Л.С.

 

 

 

Общая генетика. Москва, Высшая школа,

7.4.11. Трансформация у

411-426, 1985.

 

 

 

дрозофилы

 

Глеба Ю.Ю. Биотехнология

растений.

 

Соросовский образовательный журнал

Трансформацией в генетике называют

6: 3-8, 1998.

 

 

 

перенос генов из одного организма в другой.

169

Глава 7

 

Структура гена

 

 

 

ТрансформацииупрокариотпосвященРаздел

 

 

 

Рисунок 7.27

5.10.

 

 

 

Уэукариоттрансформациявприродедо

 

 

сих пор не обнаружена. Что же касается

 

 

экспериментальной передачи ДНК из одной

 

 

клеткивдругую,тонапротяжениимногихлет

 

 

она у исследователей не получалась. Многие

 

 

группыученыхазартноконкурировалидругс

 

 

другом в конце 1970-х - начале 1980-х годов,

 

 

пытаясьпервымиосуществитьпереносДНК.

 

 

Успехибыливесьмаредкими:молекулыДНК,

 

 

инъецированныемикрохирургическивранние

 

 

эмбрионынекоторыхвидовмлекопитающих,

 

 

амфибий,морскихежей,иногдавстраиваются

 

 

в хромосомы клетки-хозяина. У дрозофилы

 

 

искусственно введенная ДНК почти не

 

 

включается в хромосомы эмбриона, хотя в

 

Джеральд Рубин

культуреклетоктипичнаятрансформация(или

 

 

ðîä. 1950

 

 

 

как говорят, трансфекция) происходит

 

 

довольно часто. Однако, очевидно, что из

 

 

Рисунок 7.28

такой клетки трудно получить целый

 

 

организм, и трансформированная ДНК не

 

 

может передаваться потомству.

 

 

В конце концов повезло двум

 

 

американским исследователям Дж. Рубину и

 

 

А. Спрадлингу (Рис. 7.27 и 7.28) в 1982 году.

 

 

Для переноса ДНК они использовали

 

 

мобильный P-элемент. Для осуществления

 

 

транспозиции у Р-элемента существуют

 

 

специальноустроенныеструктуры-концевые

 

 

повторы - по 150 п.н. определенной

 

 

последовательностинакаждомконцеэлемента,

 

 

совершенно необходимые для перемещений.

 

 

Именно с этими участками связывается

 

 

транспозаза и

катализирует процесс

 

 

встраивания-вырезания Р-элемента. Таким

 

Аллан Спрадлинг

образом, для нормального перемещения Р-

 

ðîä. 1949

элемента нужно, чтобы были выполнены два

 

 

 

 

условия: наличие у него неповрежденных

легко компенсирован, если в геноме

концевыхповторовинормальнаяактивность

присутствуетещеодинР-элемент,нормальный,

транспозазы.Еслибудетнарушенкакой-либо

которыйиобеспечитналичиетранспозазы.

из экзонов гена транспозазы или во время

 

Учитывая все перечисленное выше,

транскрипции и созревания матричной РНК

экспериментпотрансформацииудрозофилы

транспозазынебудетудаленодинизинтронов,

схематическивыглядитследующимобразом:

полноценного фермента транспозазы не

готовят ДНК двух Р-элементов, один из

получится, и Р-элемент не будет

которыхможетсинтезироватьтранспозазу,но

перемещаться.

Однако, недостаток

не способен встраиваться в геном, так как у

транспозазыизодногоР-элементаможетбыть

негоповрежденодинизконцевых(с3’-конца)

170

Схема скрещиваний для осуществления трансформации у дрозофилы (Из: Spradling, 1986, p. 177).
зеленую
Глава 7

Структура гена

повторов-рπ 25.7wcна Рисунок 7.29 Рис. 7.29 - в то время как во втором Р- элементе удалена значительная часть генатранспозазы,ноон может перемещаться по геному, поскольку имеет нормальные концевыеповторы-это

P[(ry+)A] на Рис. 7.29. В Р-элемент P[(ry+)A],являющийся вектором и имеющий дефективный ген транспозазы, обычно

âс т р а и в а ю т дополнительный фрагментДНКдлиной

до20т.п.н.,которыйхотяттрансформировать

âгеном дрозофилы. Р-элемент P[(ry+)A] называют транспозоном, а ρπ 25.7wc - элементом-хелперомилипомощником.

Затем смесь этих двух сортов ДНК инъецируют в эмбрион дрозофилы. Там некоторая ее часть встраивается в ДНК полярных клеток, из которых позднее образуютсяклеткизародышевогопути.Таким образом,чужероднаяДНК,инъецированнаяв эмбрион на ранних стадиях развития, передаетсяследующимпоколениямпотомков.

Многие факторы, в том числе и размер встроенного в Р-элемент фрагмента чужеродной ДНК влияют на успех трансформации; в среднем только около 14% инъецированных эмбрионов развиваются в плодовитоепотомство.Поэтомувстаетвопрос о том как различить мух, у которых инъецированнаяДНКвстроиласьвгеномимух безвстройки.ДляэтоговР-элемент P[(ry+)A] вводятспециальныемаркерныегены.Этомогут бытьлибогеныдрозофилы,контролирующие окраску глаз, например, ген rosy (ry+ на Рис. 7.29), гены дрозофилы, кодирующие синтез ферментов,например,алкогольдегидрогеназы или даже ген, выделенный из генома медузы, кодирующийбелок-GFP,обнаруживающийпри

определенных условиях флюоресценцию.

Разберем сначала схему, в которой используется ген rosy (Рис. 7.29). В этом случаевР-элементP[(ry+)A] введенфрагмент ДНК, содержащий нормальный аллель гена rosy. ДНК этого транспозона вместе с ДНКхелпераинъецируютвэмбрионы,гомозигоные по мутации rosy - ry506. Если транспозон P[(ry+)A] встроился в геном, то в поколении G1появятся мухи с нормальнымцветомглаз, посколькууних-гомозиготпомутацииry506 - появитсяДНКснормальнымаллелемгенаry+ втранспозоне.

Недавно для маркировки произошедшего встраивания транспозона в качестве маркера стали использовать кДНК гена GFP, подшитого вместе с подходящим промотором.Вслучаеинсерциитранспозона в различных клетках дрозофилы синтезируется белок GFP. В результате облучения этих клеток длинноволновым ультрафиолетовым светом белок GFP начинаетфлуоресцироватьзеленымсветом.

С какими целями используют трансформациювэкспериментальнойгенетике?

Можновыделитьнескольконаправлений. 1.Впроцессеклонированияивыделения генов всегда остается вопрос о том, весь ли

171

Соседние файлы в папке Генетика (Жимулев)