
- •Взаимосвязь структура-функция
- •АМИНОКИСЛОТЫ и БЕЛКИ
- •ФУНКЦИИ БЕЛКОВ
- •По обеим сторонам жесткой пептидной связи возможно
- ••Уровни структурной организации белков: 1 — первичная, 2 — вторичная, 3 — третичная,
- ••Вторичная структура — упорядоченное свертывание полипептидной цепи в спираль (имеет вид растянутой пружины).
- •ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА
- •ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА
- ••Если по каким-либо причинам пространственная конформация белков отклоняется от нормальной, белок не может
- •«Он истинный гений» -
- •• «Однажды, когда я работал в Оксфорде (дело было в апреле
- •Модель Полинга оказалась очень удачной, и на её основе был разработан промышленный стандарт
- •• Высказывание Полинга в книге «Как жить дольше и чувствовать
- •ТуrGlyGlyPheLeu - лейцинэнкефалин
- •1953 г. – первый синтез биологически активных пептидов (два девятизвенных пептидных гормона –
- •Химический синтез пептидов и полипептидов
- •1969 г. – впервые синтезирован фермент – РНКаза А (124 аминокислотных остатка)
- •Химический синтез пептидов – конденсация аминокислот с элиминированием молекулы воды и образованием пептидной
- •Химический синтез пептидов и полипептидов
- •Смешивание водных растворов двух аминокислот – одной с непротонированной (потенциально нуклеофильной) аминогруппой и
- •Другая проблема, возникающая на пути успешного получения полипептида, – это обеспечение специфичности при
- •Осуществление эффективного пептидного синтеза требует: а) создания различия между аминокомпонентом (аминокислота, участвующая своим
- •Схема синтеза пептидов
- •углеро дн ы й ат о м L-ам ин о кисло т ы
- •В случае пептидов рацемизация через образование енолят-аниона примерно в 100 раз менее вероятна,
- •Карбоксиангидридный метод синтеза пептидов
- •Метод с использованием ангидридов Лейкса наилучшим образом подходит для синтеза гомополимеров.
- •Азидный метод синтеза пептидов
- •Механизм образования азидов из гидразидов защищенных аминокислот или пептидов похож на механизм реакции
- •Основная побочная реакция, протекающая при азидной конденсации, – это перегруппировка
- •Активация карбоксильной группы
- •Побочные процессы при активации карбодиимидом
- •Активация карбодиимидом в присутствии нуклеофила
- •«F-комплекс», состоящий из трех молекул пентафторфенола и одной молекулы ДЦК. Для получения комплекса,
- •Твердофазный вариант синтеза пептидов
- •В качестве полимерного носителя Меррифилд предложил использовать микропористый сополимер стирола и м-дивинилбензола, на
- •Одним из основных этапов пептидного синтеза является защита функциональных групп аминокислот. Существуют два
- •БЛОКИРОВАНИЕ АМИНОГРУПП
- •Избирательное введение защиты по -аминогруппе и
- •Для защиты -аминогруппы широкое
- •После завершения реакции образования пептидной
- •Наиболее перспективной среди защитных групп, лабильных в щелочной среде, является
- •Fmoc-группа стабильна в кислой среде, но отщепляется основаниями: пиперидином,
- •Защитные группы, отщепляемые каталитическим гидрированием.
- •Защитные группы, удаляемые УФ-облучением.
- •Комбинаторная химия – это комбинация метода одновременного множественного синтеза однотипных соединений и выявления
- •Блокирование карбоксильной группы
- •Блокирование карбоксильной группы
- •Блокирование карбоксильной группы
- •Избирательное блокирование карбоксильной группы
- •Избирательное блокирование карбоксильной группы
- •Избирательное блокирование карбоксильной группы
- •Осложнения при удалении защитной группы
- •Блокирование глутамина и аспарагина
- •Блокирование гидроксигруппы аминокислот
- •Осложнение при деблокировании гидроксигруппы тирозина
- •Блокирование
- •Блокирование SH-группы
- •Деблокирование SH-группы
- •Блокирование SH-группы
- •Блокирование бокового заместителя метионина
- •Блокирование гистидина
- •Блокирование и деблокирование гистидина
- •Блокирование
- •Блокирование аргинина
- •Синтез дисульфидных мостиков
- •H-Ala-Cys(Trt)-Asp(OtBu)-Cys-Arg-Gly-Asp(OtBu)-Cys-Phe-Cys(Trt)
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции

Химический синтез пептидов – конденсация аминокислот с элиминированием молекулы воды и образованием пептидной связи

Химический синтез пептидов и полипептидов
Пептидный синтез, казалось бы, можно свести к реакции конденсации с отщеплением воды от двух молекул аминокислот или пептидов. Однако на практике все намного сложнее.
|
|
|
|
-(n-1) H2O |
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
O |
||||||||||||
nH NCHCO H |
H2N |
|
CH |
|
|
|
|
|
( |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
C |
|
|
|
NH |
|
CH |
|
C |
|
|
NH |
|
CH |
|
C |
|
OH |
|||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||
2 |
|
|
2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
n-2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
R |
|
|
|
R |
|
|
|
R |
|
|
|
R |
Смешивание водных растворов двух аминокислот – одной с непротонированной (потенциально нуклеофильной) аминогруппой и второй с протонированной карбоксильной группой (потенциально электрофильный центр) – при комнатной температуре привело бы только к образованию соли. Поэтому, с химической точки зрения, гидроксильный компонент карбоксильной группы следует превратить в хорошую уходящую группу. С энергетической точки зрения, следует активировать карбоксильную группу для компенсации работы, затрачиваемой при образовании пептидной связи.
Другая проблема, возникающая на пути успешного получения полипептида, – это обеспечение специфичности при синтезе, т. е. последовательного присоединения аминокислот. Природные пептиды и белки – это полиамиды с определенной аминокислотной последовательностью. Самое незначительное изменение ее приводит к нарушению или даже полному исчезновению биологической активности полипептида. Поэтому химики, приступающие к синтезу полипептида, должны не только знать структуру синтезируемого гетерополимера, но и правильно выбирать стратегию синтеза для его получения.
Осуществление эффективного пептидного синтеза требует: а) создания различия между аминокомпонентом (аминокислота, участвующая своим атомом азота в образующейся пептидной связи) и карбоксикомпонентом (аминокислота, участвующая своей карбонильной группой в образующейся пептидной связи); б) активации последней так, чтобы образование связи между аминокислотами протекало эффективно и в условиях, обеспечивающих сохранение оптической чистоты синтезируемого пептида; в) в связи с проведением синтеза в органической среде решения проблемы крайне низкой растворимости природных -аминокислот путем преодоления
цвиттер-ионного характера реагирующих аминокислот

Схема синтеза пептидов
|
|
|
|
|
|
|
|
R1 |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
R2 |
|
|
|
O |
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H3N |
|
|
|
CH |
|
|
C |
|
|
|
O |
|
H3N |
|
|
|
|
CH |
|
|
|
C |
|
|
|
O |
|||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cò àäèÿ 1 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
Введен ие защ ит - |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
í û õ ãðóï ï |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R1 |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
R2 |
|
|
|
O |
|||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||
Z |
|
HN |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
|
|
CH |
|
C |
|
O |
|
H3N |
|
|
CH |
|
C |
|
Y |
||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
карбо ксильн ы й |
àì èí î êî ì ï î í åí ò |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
êî ì ï î í åí ò |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
Cò àäèÿ 2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||
Акт ивация |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
карбо ксильн о го |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
êî ì ï î í åí ò à |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R1 |
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Z |
|
HN |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
Cò àäèÿ 3 |
|
|
|
|
|
|
|
CH |
|
|
|
|
C |
|
|
|
X |
|
|
|
|
àì èí î êî ì ï î í åí ò |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
О бразо ван ие |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
ï åï ò èäí î é |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
связи |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R1 |
|
|
O |
R2 |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Z |
|
|
HN |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
|
Cò àäèÿ 4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH |
|
|
C |
|
HN |
|
|
|
CH |
|
|
C |
|
|
Y |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
çàù èù ¸í í û é |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||
О т щ еп лен ие(селект ивн о е) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ï åï ò èä |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||
çàù èò í û õ ãðóï ï |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||
|
|
|
|
R1 |
O |
|
|
|
|
|
|
R2 |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
R1 |
O |
|
|
|
R2 |
|
O |
||||||||||||||||||||||||||||
Z |
|
HN |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||
|
|
CH |
|
C |
|
|
|
HN |
|
|
|
CH |
|
C |
|
|
OH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2N |
|
|
|
|
CH |
|
C |
|
HN |
|
|
CH |
|
C |
|
Y |
|||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|

углеро дн ы й ат о м L-ам ин о кисло т ы
R H |
O |
(акт ивиро ван ы й |
|
|
* |
|
карбо н ил или |
H N |
X |
п еп т идн ая связь) |
|
|
X-óõî äÿù àÿ ãðóï ï à |
O
Yацильн ая
î ñí î âàí èå |
çàù èò í àÿ |
|
ãðóï ï à |
||
|
R O
H
N O
Y
î ñí î âàí èå
R H O
NO
Y
п ро м ежут о чн ы й 5(4H)-о ксазо ло н
RO
N O
Y
ï ðî ò î í ì î æåò |
|
|
ï ðèñî åäèí ÿò üñÿ |
|
|
ñ ëþ áî é ñò î ðî í û |
резо н ан сн о -ст абилизиро ван ы й |
|
ï ëî ñêî ñò è |
||
карбан ио н |
||
|
R |
H |
O |
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
||
|
* |
O |
|
|
|
|
N |
|
|
||
|
Y |
|
|
|
|
|
|
|
O |
O |
|
|
|
H2N R' |
Y C NH |
CH C NH R' |
|
|
R |
|
|
R |
|
H |
O |
о п т ически н еакт ивн ы й п ро дукт |
|||
|
|||||
* |
|
||||
|
O |
|
|
||
|
N |
|
|
Y

В случае пептидов рацемизация через образование енолят-аниона примерно в 100 раз менее вероятна, чем через образование 5(4Н)-оксазолона
H O NH C* C
R X
(L)
NH
B |
|
O |
|
O |
YH |
|
NH C |
C |
NH C |
C |
|
- BH |
R |
X |
R |
X |
|
|
|
|
|
O C C
HR
Y (D, L)

Карбоксиангидридный метод синтеза пептидов
COO
R CH
NH2 Cl
R H
C
H NH
O O
O
C Cl
O
R'
HN CH
COO
H
CO2
O
R CH C
HN O
C O
Cl
pH 10,2
O R CH C HN
NH3
R H O
HN O
O
R'
H2N CH
R' |
COO |
|
CH
COO

Метод с использованием ангидридов Лейкса наилучшим образом подходит для синтеза гомополимеров.
Обработка N-карбоксиангидрида аминокислоты небольшим количеством нуклеофильного инициатора в органическом растворителе ведет к раскрытию цикла и отщеплению диоксида углерода с образованием нового нуклеофила, который атакует следующую молекулу N-карбоксиангидрида и т. д., приводя к образованию гомополиаминокислоты
H |
R |
|
|
R |
R |
|
R |
|
O |
NH |
-CO2 Nu |
|
H |
N |
-CO2 Nu |
|
N |
NH2 |
|
O |
|
O |
|
NH2 |
|
|
|
|
|
O |
O |
O |
O |
O |
O |
H |
R |
Nu
гомополи -аминокислота