
- •Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования
- •Содержание
- •Список сокращений
- •Введение
- •І. Тема: белки
- •1. Строение и биологическая роль аминокислот, пептидов, белков
- •Аспарагиновая кислота (асп)
- •Лизин (лиз)
- •Серин (сер)
- •1.1. Первичная структура белка
- •1.2. Варианты вторичной структуры белка
- •1.3. Третичная структура белка
- •1.4. Четвертичная структура белка – высший уровень организации
- •Свойства протеинов
- •2.1. Физико - химические свойства биополимеров
- •2.2. Особенности биологических свойств белков
- •3. Методы очистки и выделения белков
- •4. Классификация белков
- •4.1. Простые белки
- •4.1.1. Глобулярные белки
- •4.1. 2. Фибриллярные белки
- •4.2. Сложные белки
- •Отличительные особенности строения углеводсодержащих белков
- •Характеристика липопротеиновых частиц
- •5. Биологическая роль протеинов
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний
- •Ситуационные задачи
- •II. Тема: ферменты
- •1. Особенности строения ферментов
- •1.1. Энзим – сложный белок
- •1.1.1. Природа и роль кофермента
- •Витамины – компоненты коферментов
- •1.1.2. Апофермент и его значение
- •1.2. Функциональные центры фермента
- •2. Энзимы как биокатализаторы
- •2.1. Теории, объясняющие механизм действия ферментов
- •I стадия. Образование es-комплекса
- •II стадия. Активация es-комплекса
- •III стадия. Образование eр-комплекса
- •IV стадия. Распад eр-комплекса
- •2.2. Специфичность действия энзимов
- •2.3. Кинетика ферментативных реакций
- •2.3.1. Зависимость скорости реакции от содержания субстрата
- •2.3.2. Влияние концентрации фермента на скорость реакции
- •2.3.3. Эффект колебаний температуры
- •2.3.4. Связь интенсивности процесса с величинами рН среды
- •3. Классификация, номенклатура ферментов
- •3.1. Классификация
- •2.1.1. Характеристика отдельных классов ферментов
- •4. Положительная и отрицательная регуляции работы ферментов
- •4.1. Механизмы аллостерической регуляции
- •4.2. Последствия белок - белкового взаимодействия
- •4.3. Регуляция путём ковалентной модификации
- •4.4. Частичный протеолиз как способ активации зимогена
- •Особенности конкурентного ингибирования
- •5. Использование ферментов в медицине
- •5.1. Энзимопатии
- •Энзимодиагностика
- •Энзимотерапия
- •Вопросы для самоконтроля
- •Тестовые задания для оценки уровня знаний:
- •Ситуационные задачи
- •Приложение № 1
- •Варианты правильных ответов на контрольные тесты
- •Список литературы
Ситуационные задачи
Природный дипептид карнозин содержится в мышцах человека и является -аланилгистидином. Напишите его структурную формулу и схему реакции гидролиза в кислой среде.
В результате кислотного гидролиза неизвестного трипептида образуются две аминокислоты – глицин и лейцин. Предложите возможные структуры исследуемого пептида.
Для лечения некоторых заболеваний глаз проводят электрофорез 2% водным раствором цистеина. К какому электроду – аноду (+) или катоду (-) будет смещаться эта кислота?
У больного с тяжелым инфекционным заболеванием величина белкового коэффициента оказалась равной 1,9. Какие лечебные мероприятия целесообразно провести?
Почему при стирке в горячей воде шерстяные вещи «садятся»?
Чем опасно ежедневное использование щипцов для завивки?
Что лучше растворяется в воде: нуклеиновые кислоты или нуклеопротеиды? Почему?
Можно ли по анализу крови судить о предрасположенности к атеросклерозу?
II. Тема: ферменты
Цели занятия:
изучить строение и свойства энзимов и химические основы структурной организации их молекул для дальнейшего понимания биологической роли;
основываясь на строении биокатализаторов, обосновать их свойства, разобрать механизм ферментативной реакции, аспекты влияния на активность энзимов;
сформировать представления о структуре простых и сложных ферментов, познакомиться с классификацией и биологической ролью важнейших классов. Использовать знания о биокатализаторах в клинической медицине для диагностики и лечения.
Учебные задачи
Изучить:
принципы классификации и номенклатуры ферментов;
основные свойства и функции биокатализаторов;
общие представления о химическом и ферментативном катализе;
основы специфичности энзимов;
кинетику действия ферментов;
механизмы активации и ингибирования ферментов.
Уметь:
определять класс ферментов;
предполагать варианты колебаний каталитической активности в зависимости от изменяющихся условий;
устанавливать тип катализируемой реакции по названию энзима;
правильно предвидеть свойства биокатализаторов в зависимости от строения молекул;
применять знания о ферментах в клинике.
Ознакомиться:
с принципами формирования молекул;
с разнообразными классами ферментов;
с путями использования их в медицине.
1. Особенности строения ферментов
Основу жизнедеятельности любого организма составляют химические процессы, которые обычно протекают с участием природных биокатализаторов, называемых ферментами, или энзимами. В научной литературе утвердились оба термина, но предпочтение отдают первому, хотя наука об этих соединениях называется энзимологией. Слово «фермент» происходит от лат.fеrmentum – закваска, слово – «энзим» от греч. еn – в, внутри и zyme – дрожжи.
Ферменты (энзимы) - это высокоспецифичные белки, являющиеся катализаторами, веществами, которые ускоряют химическую реакцию, но сами в её ходе не расходуются. Вещество, преобразуемое энзимом в результате взаимодействия в один или несколько конечных продуктов (Р) носит название субстрат (S). В настоящее время известно более 3700 биокатализаторов.
Фермент подчиняется общим законам катализа и обладает всеми свойствами, характерными для небиологических катализаторов, однако имеет и отличия, обусловленные особенностями строения.
Сходство ферментов с минеральными катализаторами:
1) Катализируют только энергетически возможные реакции, то есть те, которые могут протекать и без них.
2) Не способны изменять направление процесса.
3) Не сдвигают равновесие обратимой реакции, а лишь ускоряют его наступление.
4) Не расходуются в процессе катализа и выходят из реакции в первоначальном виде.
Oтличия энзимов от небиологических катализаторов:
1) Все ферменты имеют белковую природу, а минеральные катализаторы неорганического происхождения.
2) Характеризуются крупными размерами, потому что обычно состоят из более 100 аминокислотных остатков.
3) Интенсивность ферментативных реакций выше, чем у катализируемых небелковыми веществами и прямо пропорциональна количеству энзима. При минимальных концентрациях максимально увеличивают эффективность реакции (в 107-1014 раз). Одна молекула биокатализатора способна преобразовать от 1000 до 1 млн. субстратов за минуту. Эта скорость недостижима для их небиологических аналогов.
4) Биокатализаторы обладают высокой специфичностью (избирательностью) действия по отношению к субстрату, минеральные же безразличны к его природе.
5) Энзимы катализируют реакции в очень мягких условиях (обычное давление, значения рН, близкие к нейтральным, невысокая tº ≈ 330- 430С), что их выгодно отличает от неорганических, чаще всего требующих ужесточение параметров (давление больше атмосферного, температура выше 1000С, среда сильно кислая или сильно щелочная).
6) Активность ферментов в клетках строго регулируется как на генетическом уровне, так и посредством определённых низкомолекулярных соединений (субстратов и продуктов реакции, катализируемой этими же энзимами) а также с помощью БАВ (витаминов, гормонов, медиаторов, ядов, лекарственных препаратов).
Биокатализаторы, как все протеины, обладают рядом свойств, характерных для высокомолекулярных веществ: амфотерностью, электрофоретической подвижностью и неспособностью к диализу через полупроницаемые мембраны. Их Mr колеблется от десятков тысяч до нескольких миллионов Дальтон. Энзимам присущи все особенности пространственной организации белковых молекул (первичная, вторичная, третичная и четвертичная структуры).