Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

04-06-2014_12-07-43 / ChemDraw

.pdf
Скачиваний:
90
Добавлен:
13.04.2015
Размер:
619.69 Кб
Скачать

Назва пункту

"Гаряча"

Призначення

клавіша

 

 

 

 

кож і назв атомів необхідно додатково відмітити

 

 

опцію "Rotate Atom Labels"

 

 

Виклик панелі змінювання розміру об’єкту. Мож-

 

 

ливі варіанти:

 

 

Scale Selected objects so that median bond is

 

 

Fixed Length – встановити середню довжину

 

 

зв’язку відповідно до вказаної в меню

 

 

FileDrawing SettingsFixed Length

 

 

Scale Selected objects so that median bond is

Scale

Ctrl+K

– встановити середню довжину зв’язку відпо-

відно до необхідної довжини

 

 

 

 

Scale by – виконати масштабування об’єкту

 

 

відповідно до вказаного в полі вводу відсотка

 

 

вихідного розміру. Максимальне збільшення

 

 

об’єкта обмежене розмірами сторінки.

 

 

При необхідності зміни розміру також і назв атомів

 

 

необхідно додатково відмітити опцію "Scale Atom

 

 

Labels".

При вирівнюванні (Align) або розподіленні (Distribute) об’єктів для вказання необхідних достатньо виділити частини об’єктів, оскільки дані дії впливають цілком на весь об’єкт.

Для виклику панелей повороту (Rotate) або масштабування (Scale) можна також подвійно клацнути на відповідному маркері зони виділення.

При переміщенні виділених об’єктів на передній або задній план майте на увазі, що ChemDraw підтримує тільки три шари у документі, порядок слідування яких від заднього плану до переднього є фіксованим: шар імпортованих зображень, шар графічних об’єктів ChemDraw, текстовий шар. Переміщення відповідних об’єктів відбувається тільки в межах свого шару. Наприклад, імпортоване зображення не може перекрити структурну формулу, оскільки завжди знаходиться на самому задньому плані.

Імпортоване зображення – це будь-яке графічне зображення вставлене в документ ChemDraw з іншої програми (молекулярна модель з HyperChem, діаграма Excel, тощо) за допомогою вставки з буферу обміну. Графічний об’єкт ChemDraw – будь-який об’єкт створений в ChemDraw, за винятком тексту. Текст, який включає як назви та заголовки формул, так і назви атомів, завжди знаходиться на передньому плані.

Меню Structure (Структура)

Команди цього меню призначені для керування об’єктами програми як хімічними сполуками – описання властивостей об’єктів, елементний аналіз, розрахунки фізико-хімічних властивостей, тощо.

19

Назва пункту

Призначення

Atom Properties

Панель описання властивостей виділених атомів

Bond Properties

Панель описання властивостей виділених зв’язків

 

Дозволяє визначити брутто-формулу за структурною фор-

 

мулою, розрахувати точну масу, молекулярну вагу, елемен-

Analyze Structure

тний склад виділеного об’єкта. Вибрані параметри можна

внести в документ за допомогою кнопки Paste. Перед аналі-

 

зом автоматично виконується перевірка структури на ко-

 

ректність.

 

Перевірка структури на коректність з точки зору витримки

 

валентностей атомів. При виявленні атому з невірною

 

валентністю на екран виводиться вікно із зображенням фо-

Check Structure

рмули, що перевіряється, на якій помилка помічається

 

інверсним кольором. Помилку можна ігнорувати (Ignore чи

 

Ignore All) або зупинити перевірку (Stop) для її виправлен-

 

ня.

Clean Up Structure

Упорядкування виділеного об’єкта шляхом вирівнювання

 

довжин зв’язків, кутів між зв’язками.

 

Перетворення псевдонімів функціональних груп у виділе-

Expand Label

них об’єктах в структурні формули із створенням упоряд-

 

кованої структури (див. FileList Nicknames).

Add Multi-Center

Створення багатоцентрової точки приєднання, яка дозволяє

Attachment

рисувати хімічно вірні багатошарові формули, такі, як, на-

приклад, ферроцен.

 

Add Variable

Створення змінної точки приєднання для рисування струк-

турних формул позиційних ізомерів із застосуванням ско-

Attachment

роченого запису без втрачання хімічного змісту.

 

Map Reaction

Автоматичне створення карти реакції. Підтримуються тіль-

Atoms

ки одностадійні реакції.

Clear Reaction

Видалення карти реакції.

Map

 

Define Nickname

Визначення псевдоніму для виділеної функціональної гру-

пи.

 

Команди Atom Properties, Bond Properties, Map Reaction Atoms та Clear Reaction Map призначені для створення запитів до баз даних по хімічним структурам та хімічним реакціям.

В розширених версіях ChemDraw крім аналізу структури (меню Analyze), також розраховується ряд фізичних та термодинамічних властивостей сполук (закладка Properties), а саме:

Назва

Властивість

Log(P)

Розрахунковий коефіцієнт розподілення в системі

н-октанол– вода.

 

MR

Розрахунковий індекс мольної рефракції.

Henry's Law

Логарифм газової константи Генрі

 

20

Назва

Властивість

 

Boiling Point

Розрахункова температура кипіння (в Кельвінах при 1 атм.)

Melting Point

Розрахункова температура плавлення (в Кельвінах при 1

атм.)

 

 

 

Critical

Розрахункова критична температура (в Кельвінах).

Temperature

 

 

Critical Pressure

Розрахунковий критичний тиск (в барах)

 

Critical Volume

Розрахунковий критичний об’єм речовини (см3/моль)

Heat of Formation

Розрахункова теплота утворення (в кДж/моль,

в нормаль-

 

них умовах)

 

Gibbs Energy

Розрахункова енергія Гібса (в кДж/моль, в

нормальних

умовах)

 

 

 

Для отримання деталей розрахунків властивостей можна натиснути кнопку Report. У звіт про розрахунки, крім зазначених даних, також включаються відомості про методи розрахунку, посилання на відповідні літературні джерела, тощо.

Меню Text (Текст)

В ChemDraw розрізнюється два види тексту – текст назв (Caption Text) та текст формул (Atom Label). Для визначення позиції де буде текст і подальшого вводу, застосовується інструмент "Текст" панелі графічних інструментів

ChemDraw.

Для створення тексту формули необхідно вибрати інструмент "Текст" та клацнути на необхідному атомі у формулі, крім того, під час рисування зв’язків для вводу тексту як частини формули, можна також виконати подвійне клацання в необхідному місці не змінюючи при цьому інструмента "Зв’язок". До такого тексту автоматично застосовується стиль Formula, в якому всі цифри вважаються нижнім індексом, текст формул автоматично вирівнюється таким чином, щоб лінія зв’язку йшла від атома, який введений першим. Для створення тесту назв необхідно вибрати інструмент "Текст" та клацнути будь-де поза формулою.

Незалежно від типу тексту в позиції вводу відображається прямокутник, який вказує границі поля вводу тексту. На правому боці прямокутника знаходиться маркер зміни розміру поля вводу, перетягування якого приводить до зменшення чи збільшення поля, причому текст автоматично переноситься по рядкам, щоб максимально заповнити поле вводу.

Параметри за умовчанням для тексту назв і тексту формул визначаються в меню FileCaption Text Settings та FileLabel Text Settings відповідно.

Меню Text дозволяє перевизначити параметри тексту, який буде вводитись, або виділеного тексту, проте основні параметри тексту – шрифт, розмір, начертання, стиль – простіше змінювати за допомогою кнопок управління текстом стандартної панелі інструментів (див. "Панелі інструментів програми ChemDraw") або відповідних "гарячих клавіш". Звернемо увагу на те, що для вводу кириличних текстів необхідно вибирати шрифти із суфіксом Cyr Arial Cyr, Times New Roman Cyr, тощо. Колір тексту або його частини визначається за допомогою ме-

ню Color.

21

Назва пункту

 

Призначення

Format

Виклик панелі визначення формату тексту (див. рис. 4).

Font

Дозволяє вибрати один з десяти нещодавно використаних

шрифтів або визначити інший.

 

Style

Виклик меню визначення стилю та начертання тексту (див.

далі).

 

 

 

 

 

 

Вибір необхідного розміру шрифту із фіксованого списку

Size

доступних розмірів або визначення іншого. Розмір літер

може становити від 1 до 999 пунктів (1 пункт=1/72"≈0.35

 

 

мм).

 

 

Flush Left

Вирівнювання тексту по лівому краю.

Centered

Вирівнювання тексту по центру.

Flush Right

Вирівнювання тексту по правому краю.

Justified

Тільки для тексту назв – вирівнювання тексту по ширині.

 

Тільки для тексту формул

створення багаторядкових на-

Stacked Above

зв атомів чи функціональних груп. Для переводу рядка на-

тиснути Ctrl+Enter (див. FilePreferences). Зв’язок рису-

 

ється до крайнього лівого атома у нижньому рядку.

Automatic

Тільки для тексту формул

автоматичне визначення по-

ложення тексту формули в

залежності від положення

 

зв’язку, для якого створюється текст.

 

Визначення міжрядкової відстані в тексті. Варіанти:

 

Automatic – відстань визначається розміром найви-

 

щої літери всього тексту і є однаковою для всіх рядків

Line Spacing

Variable – відстань визначається розміром найвищої

 

літери рядка і може бути змінною в різних рядках

 

 

Fixed at – відстань дорівнює вказаному в полі вводу

 

 

значенню. Одиниці виміру задаються в меню File

 

 

PreferencesUnit

 

Для тексту програма ChemDraw підтримує наступні начертання та стилі

(підменю TextStyle):

Назва пункту

"Гаряча"

Призначення

клавіша

 

 

Plain

Ctrl+T

Звичайне начертання тексту

Bold

Ctrl+B

Напівжирний текст

Italic

Ctrl+I

Курсивний текст

Underline

Ctrl+U

Підкреслений текст

Subscript

F9

Стиль "Верхній індекс"

Superscript

F10

Стиль "Нижній індекс"

Formula

Ctrl+F

Стиль "Формула", в якому всі цифри вважаються

 

 

нижнім індексом.

22

Меню Curves (Криві)

Меню визначає параметри кривих, а команди цього меню активні тільки коли виділена крива, створена за допомогою інструмента "Перо" панелі графічних інструментів ChemDraw. До однієї кривої можна одночасно застосовувати декілька параметрів, якщо вони не виключають один одного. Встановлення чи змінювання параметрів цього меню впливає також на всі криві, які будуть далі створюватись. Параметри рисування кривих – товщина ліній, довжина штриху, тощо, визначаються в меню FileDrawing Settings, колір виділеної кривої – в меню Color

(див.).

Назва пункту

Призначення

Plain

Звичайна лінія.

Dashed

Пунктирна лінія.

Bold

Напівжирна лінія.

Arrow at Start

Стрілка на початку лінії.

Arrow at End

Стрілка наприкінці лінії.

Half Arrow at Start

Напівстрілка на початку лінії.

Half Arrow at End

Напівстрілка наприкінці лінії.

Closed

Закрита лінія – початок і кінець автоматично з’єднується.

Filled

Створення на основі кривої області із суцільною заливкою

Меню Color (Колір)

Дане меню містить палітру кольорів, доступних для визначення кольору виділених об’єктів або тексту. Для рисування чи вводу тексту використовується колір рисування за умовчанням (Foreground Color), який разом з фоном документа (BackGround Color) і додатковими кольорами (Other Colors) визначається або змінюється в меню FileColor Palette. Панель Color Palette визначає всі кольори, доступні в меню Color – колір рисування, фоновий колір та до 20 додаткових кольорів.

Для змінювання кольору виділеного об’єкта достатньо вибрати необхідний колір із списку. Якщо виділений об’єкт чи об’єкти містять декілька кольорів, то в меню Color ці кольори позначаються маркерами.

Меню Window (Вікно)

Містить команди управління розташуванням вікон документів та список усіх відкритих документів. Вибір документу із списку переводить вікно документа на передній план.

Назва пункту

Призначення

Cascade

Впорядковує вікна накладанням одного на інше таким чи-

ном, щоб було видно тільки заголовки вікон заднього плану.

 

Tile Horizontal

Розташовує всі вікна одне над одним по вертикалі, встанов-

лює для вікон однаковий розмір.

 

Tile Vertical

Розташовує всі вікна одне поряд з одним по горизонталі,

встановлює для вікон однаковий розмір.

 

Arrange Icons

Впорядковує значки згорнутих вікон розташовуючи в лінію в

нижньому рядку вікна програми.

 

 

23

Меню Help (Допомога)

Містить команди доступу до довідкової системи програми CS ChemDraw.

Назва пункту

"Гаряча"

Призначення

клавіша

 

 

Contents

F1

Зміст довідки для пошуку по темі.

Help Mode

Shift+F1

Контекстна допомога по вибраному меню або

 

 

панелі інструментів.

Search for Help on

 

Пошук довідки за ключовими словами.

How to Use Help

 

Довідка по користуванню довідковою системою.

Getting Started

 

Приклади використання ChemDraw для створен-

 

ня структурних формул, схем, тощо.

 

 

What’s New

 

Нові можливості даної версії програми.

About ChemDraw

 

Інформація про розробників програми.

В режимі Help Mode вказівник "миші" набуває наступного вигляду:, після чого вибір пункту меню чи кнопки приводить до виводу короткої довідки по відповідному елементу.

24

Створення хімічних формул у ChemDraw

В даному розділі ми розглянемо як за допомогою програми ChemDraw можна вирішувати найпоширеніші задачі відображення хімічних формул, схем, тощо. Звертаємо увагу, що оскільки програма автоматично враховує валентності атомів, при рисуванні зв’язків треба керуватися простим правилом – рисувати від вже існуючого атома (зв’язку). Індикатором вибору атома чи зв’язку є поява поля виділення (див. FilePreferencesTolerance) при наведенні вказівника миші на відповідний елемент зображення.

В залежності від задачі, яку ставить перед собою хімік, запуск програми можна робити по-різному. Якщо передбачається, що друк структури, сама структура, тощо, буде виконуватись чи використовуватись в межах пакету ChemOffice, то для запуску програми краще застосувати головне меню операційної системи:

ПускПрограмиCS ChemOfficeCS ChemDraw. Така дія приведе до запус-

ку програми і автоматичному створенню нового документа на основі шаблона, який використовується за умовчанням (див. Меню Файл (File)). Для збереження документу після роботи треба буде використати команди FileSave або

FileSave As.

Якщо хімічну структуру треба вбудувати в документ іншої програми, наприклад Word, то це можна зробити за допомогою копіювання та вставки через буфер обміну або за допомогою команд вбудовування об’єктів відповідної про-

грами (для Word: ВставкаОбъектCS ChemDraw Drawing).

У першому випадку треба запустити програму ChemDraw, нарисувати потрібний об’єкт, скопіювати чи вирізати його в буфер обміну (EditCopy або EditCut відповідно), потім переключитися на необхідний документ і застосувати команду вставки з буферу обміну відповідної програми (для Word: ПравкаВставить або Ctrl+V). У другому випадку автоматично викликається програма ChemDraw, а після завершення редагування для внесення змін у цільовий документ треба використати відповідну команду меню File (див. Меню Файл (File)). Занотуйте, що і в даному випадку для визначення параметрів рисування програма використовує шаблон за умовчанням. Для редагування вже вбудованих об’єктів програма ChemDraw викликається згідно з документацією по програмі, в документ якої був вбудований об’єкт.

Рисування схем реакцій

Наприклад, для використання в якості демонстративного матеріала необхідно створити наступну схему реакції:

2-пропанон

4-гидрокси-4-метил-2-пентанон

2 моля

1 моль

25

Послідовність дій, яка приведе до виконання поставленої задачі, може бути наступна:

1.Запустити ChemDraw.

2.Встановити фіксовані довжини зв’язків та фіксований кут повороту за допомогою меню ToolsFixed Length (Fixed Angles). Зверніть увагу – встановлення цих параметрів дозволяє створювати формули з однаковими еле-

ментами, що приводить до кращого естетичного вигляду рисунка. Довжина зв’язку визначається в меню FileDrawing SettingsFixed Length.

3.Створити "базовий" зв’язок, від якого будуть створюватись всі інші елементи. Ця операція завжди виконується на початку рисування нового об’єкту.

Клацнути на інструменті "Суцільна лінія зв’язку"

Навести вказівник миші в будь-яке місце документу, при цьому вказівник набуває вигляду перехрестя (+), та натиснути ліву кнопку "миші"

Перетягнути вказівник діагонально вгору-вправо під кутом 30о (тут і далі пунктирною стрілкою вказується напрям перетягування):

Під час перетягування слідкуйте за повідомленням у лівому кутку рядка статусу вікна програми (рис. 1), яке відображує поточну довжину лінії та кут повороту. Коли кут буде дорівнювати заданій величині відпустити кнопку.

4.Додати другий зв’язок:

Навести вказівник на правий атом зв’язку – повинно з’явитися поле виділення:

Клацнути лівою кнопкою для додавання лінії:

Занотуйте, що лінія з’являється під кутом, який визначений в меню

FileDrawing SettingsChain Angle (звичайно 120о). Якщо нарисува-

ти зв’язок під таким кутом неможливо, автоматично застосовується менший кут.

5.Додати третій зв’язок:

Не зсуваючи вказівник з виділеного атому ще раз клацнути лівою кнопкою "миші"

26

6.Перетворити одинарний зв’язок на подвійний. Для цього необхідно навести вказівник на центральний атом структури натиснути ліву кнопку "миші" і перетягти вказівник як показано на наступному рисунку:

7.Додати назву атому:

Навести вказівник "миші" на атом як показано на рисунку

Двічі клацнути лівою кнопкою "миші", після чого з’явиться поле вводу тексту. Зверніть увагу, що для такого тексту автоматично застосовується стиль "Формула"

Надрукуйте літеру О

Закрийте поле вводу тексту, для чого необхідно клацнути будь-де поза формулою, або вибрати інший інструмент

8.Скопіювати структуру (для спрощення подальших дій):

Вибрати інструмент "Ласо". Зверніть увагу, що останній нарисований елемент виділяється автоматично

Навести вказівник в середину прямокутника виділення (вказівник набуває вигляду руки)

27

Натиснути кнопку Ctrl, на вказівнику додатково з’являється символ +, який означає, що включено режим копіювання виділеного об’єкту

Не відпускаючи кнопки Ctrl перетягти прямокутник виділення разом з копією об’єкту вправо на необхідну відстань

Занотуйте, якщо об’єкт необхідно пересувати точно горизонтально або вертикально, перетягування виконується при натисненій кнопці Alt. При копіюванні пертягуванням (як показано вище) треба натиснути кнопки Ctrl та Alt одночасно.

9.Змінити скопійовану структуру

Клацнути на інструменті "Суцільна лінія зв’язку"

Навести вказівник "миші" на атом як показано на рисунку та клацнути лівою кнопкою

10.Додати декілька зв’язків до атома

Навести вказівник "миші" на атом як показано на рисунку

Клацнути лівою кнопкою послідовно три рази з паузою між клацаннями.Якщо цю дію виконувати швидко, то ця дія може бути сприйнята програмою як подвійне або потрійне клацання, що приведе до появи поля вводу тексту або повтору останньої назви атому відповідно. Якщо дія виконана вірно, об’єкт буде таким:

11.Пересунути зв’язок

28