04-06-2014_12-07-43 / ChemDraw

О.В. Білий, Н.І. Біла

Створення та редагування

хімічної графіки в програмі

ChemDraw

учбово-методичний посібник

Створення та редагування хімічної графіки в програмі ChemDraw. Учбовометодичний посібник. – Донецьк: ДонНУ, 2003.–45 с.

В посібнику розглянуто основні прийоми роботи в редакторі хімічної графіки ChemDraw версії 5.0. Наведено приклади застосування даного редактора для вирішення типових задач створення та аналізу хімічних формул, рівнянь, схем, тощо.

Рецензент: д-р. хім. наук, проф. Шендрик О.М.

Вступ

Даний посібник написаний за лекційними та практичними матеріалами навчальних занять, що проводяться в рамках дисципліни "Інформатика, обчислювальна техніка та основи програмування", яку вивчають студенти 2-3 курсу спеціальності "Хімія" та "Біохімія" хімічного факультету Донецького національного університету. При створенні посібника автори вважали, що читач вже знайомий з комп’ютером, має базові знання та навички роботи в операційній системі Windows, отже не приділили уваги опису конструкції комп’ютера, "миші", особливостям будови файлової системи, інсталяції програм, тощо. Головна мета, яку вирішує посібник – надати хіміку інструмент для вирішення типових графічних задач, що зустрічаються в практичній роботі. Автори намагалися якнайповніше описати особливості редактора ChemDraw, але, оскільки посібник не є перекладом технічної документації, деякі можливості були випущені.

4

Загальна характеристика програми ChemDraw

Програма ChemDraw є частиною програмного комплексу ChemOffice, який розроблений фірмою CambridgeSoft для автоматизації роботи хіміка. Перша версія цього комплексу вийшла у 1995 році і від версії до версії склад і можливості програм ChemOffice змінювались та розширювались в напрямку полегшення роботи, розвитку інтуїтивно зрозумілого інтерфейсу програм, виправлення помилок, додавання нових інструментів та ін. При укладанні даного посібника використовувалась версія пакету програм ChemOffice Pro 5.0, отже деякі можливості, наведені в посібнику, можуть не працювати в старих версіях програми, проте більша частина описів команд справедливі для будь-якої версії.

Усклад пакету ChemOffice Pro 5.0 входять наступні програми:

∙ChemDraw Pro 5.0 – створення, редагування, аналіз хімічних формул, розрахунки термодинамічних властивостей речовин

∙Chem3D Pro 5.0 – тривимірне моделювання хімічних молекул на основі методу MOPAC, моделювання молекулярної динаміки

∙ChemFinder Pro 5.0 – система керування базами даних хімічних сполук, яка дозволяє сортувати сполуки, виконувати їх пошук за структурною формулою або

їїчастиною, за брутто-формулою, за назвою, за властивостями, тощо.

Пакет повністю інтегрований з операційною системою Windows, підтримує механізм вбудовування й зв’язування об’єктів (OLE) та роботу з буфером обміну даними, що дозволяє вільно використовувати об’єкти ChemOffice в інших програмах.

Програма ChemDraw є інструментом, який допомагає науковцям поводитися з хімічними структурами. Як зазначає розробник програми – " Нашою метою було створити ChemDraw зручним у використанні настільки, наскільки це можливо при забезпеченні максимальної якості рисунків". Легкість використання, підтримка великої кількості форматів даних, інтеграція з операційними системами і прикладними пакетами програм привели до того, що ChemDraw на сьогодні є одною з найпоширеніших програм редагування хімічних формул.

Основними можливостями програми є

∙створення структурних формул хімічних сполук будь-якої складності

∙копіювання і вбудовування об’єктів ChemDraw у документи інших програм

∙аналіз структурних формул на помилки у валентності атомів, в тому числі з урахуванням радикалів або іонів

∙розрахунки фізичних та термодинамічних властивостей речовин на основі їх структурних формул

∙створення структурних формул за хімічною назвою сполуки

∙використання шаблонів хімічних сполук, елементів хімічних рівнянь або псевдонімів (NickNames) хімічних сполук

∙керування розміщенням об’єктів відносно сторінки або один одного

∙імпорт-експорт даних в різних форматах, як графічних, так і форматах інших програм редагування формул.

Ці та інші можливості будуть розглянуті в наступних главах.

5

Перш ніж пояснювати роботу програми визначимо деякі терміни, які будуть далі використовуватися:

∙Навести – пересувати "мишу" по поверхні поки вказівник "миші" не накриє необхідний об’єкт

∙Клацнути – натиснути і відпустити кнопку "миші"

∙Подвійно клацнути – двічі швидко натиснути і відпустити кнопку "миші"

∙Перетягнути – навести вказівник "миші" на необхідний об’єкт, натиснути необхідну кнопку "миші" і утримуючи її пересунути "мишу" в необхідному напрямку, а потім відпустити кнопку.

∙Виділити – помітити об’єкт або пункт меню. Виділення сам по собі не означає дію, воно вказує на елемент, з яким буде виконуватись дія. Для скасування необхідно виділити інший елемент або клацнути поза вибраним об’єктом.

∙Вибрати – виділити пункт меню і клацнути лівою кнопкою, або клацнути на кнопці панелі інструментів, або на кнопці діалогового вікна. Вибір елемента приводить до виконання команди

∙Клавіша+клацнути – натиснути відповідну клавішу і клацнути кнопкою

∙Клавіша+перетягування – натиснути вказану клавішу і перетягнути виділений об’єкт.

∙Кнопка (панелі інструментів, панелі задач, тощо) – прямокутна область екрану, одинарне клацання в якій ініціює виконання певної дії. Малюнок або текст на кнопці вказує яку саме дію виконує дана кнопка.

Вікно та елементи управління програми

Загальний вигляд вікна програми наведений на рис. 1. Розглянемо призначення окремих елементів вікна:

∙Заголовок вікна – містить назву програми, назву документа (якщо він розгорнутий на все вікно), що редагується, а також кнопки згортання, відновлення та закриття вікна.

∙Смуга меню – структурований список всіх команд, які можна виконати в програмі. Доступ до команд меню звичайний – за допомогою миші, клавіш, тощо.

∙Смуги прокрутки – застосовуються для прокручування вмісту вікна.

∙Індикатор масштабу – відображення поточного масштабу зображення у вікні по відношенню до стандартного для даного типу документу розміру об’єкта.

∙Робоча область вікна або вікно документу – область вікна, де будуються об’єкти.

∙Смуга статусу вікна – містить коротку підказку по виділеному меню, пункту меню, інструменту під вказівником миші. Під час рисування формул відображує кут нахилу та довжину лінії зв’язку, кут повороту виділеного об’єкту, тощо.

∙Панель інструментів – містить кнопки доступу до команд, які найчастіше використовуються. Кожній кнопці панелі відповідає певна команда меню.

∙ Панель графічних інструментів (Tools) – містить шаблони рисування зв’язків, хімічних формул, інструменти виділення, редагування тексту, тощо. Кнопки цієї панелі інструментів не дублюються командами меню.

6

Панелі інструментів програми ChemDraw

Як і будь-які інші, панелі інструментів програми ChemDraw надають швидкий доступ до команд, що найчастіше використовуються при роботі з документом. В цій програмі таких панелей дві (рис. 1) – стандартна панель, призначена для виконання команд меню, та панель Tools, призначена для графічних робіт.

Стандартну панель можна умовно розбити на декілька груп кнопок:

1.Група кнопок, загальна для Windows-програм:

∙операції над документом:

∙ операції над виділеним об’єктом

∙ відміна та повтор останньої відміненої дії

∙ зміна масштабу документу

∙ зміна положення об’єкту відносно інших

2. Кнопки, специфічні для ChemDraw (активуються при виділенні об’єкта)

– визначення властивостей виділених атомів

–визначення властивостей виділених зв’язків

–аналіз виділеної формули

–перевірка валентностей атомів у виділеній формулі або її частині

–упорядкування (Clean Up) структури (вирівнювання довжин

зв’язків, кутів, тощо)

3. Група кнопок управління шрифтами (активуються при корегуванні або вводі тексту)

– вибір необхідного шрифту

– визначення розміру літер

– напівжирне начертання літер

– курсивне начертання літер

– підкреслене начертання літер

8