Биохимия / Классификация ферментов. МСГ. Метода. БХ
.pdfКлассификация ферментов
В зависимости от типа катализируемой реакции выделяют 6 классов ферментов.
Рабочее название фермента строится так: название субстрата + подкласс фермента.
Класс |
|
Тип катализируемой |
|
реакции |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Окислительно- |
Оксидоредуктазы |
|
восстановительные |
|
|
реакции. |
|
|
|
|
|
Перенос отдельных групп |
Трансферазы |
|
атомов от донорной |
|
молекулы к акцепторной |
|
|
|
|
|
|
молекуле. |
|
|
|
|
|
Гидролитическое (с |
Гидролазы |
|
участием воды) |
|
|
расщепление связей. |
|
|
|
|
|
Расщепление связей |
Лиазы |
|
способом, отличным от |
|
|
гидролиза или окисления. |
Изомеразы
Лигазы (синтетазы)
Взаимопревращение различных изомеров.
Образование связей в реакции конденсации двух различных соединений (используется энергия АТР).
1 класс – оксидо-редуктазы, они катализируют окислительновосстановительные реакции.
Подклассы оксидо-редуктаз: а) дегидрогеназы б) цитохромы в) оксидазы г) пероксидазы
а) Дегидрогеназы отщепляют водород от молекулы субстрата. SH2 + НАД+↔ S + НАДНН+
Дегидрогеназы разделяют на пиридиновые и флавиновые.
Пиридиновые дегидрогеназы в качестве кофермента содержат НАД+ (NAD+) или НАДФ+(NADP+). НАД – никотинамид аденин динуклеотид.
Пример: реакция окисления этилового спирта:
Алкогольдегидрогеназа
Пример::реакция окислениясоли яблочной кислоты (малата):
Рабочее название дегидрогеназ строится так: название субстрата (восстановленная форма) + дегидрогеназа.
Флавиновые дегидрогеназы в качестве простетической группы содержат ФАД.
(ФАД-флавинадениннуклеотид).
Пример:: реакция окисления соли янтарной кислоты (сукцината):
сукцинатдегидрогенназа
Дегидрогеназы бывают аэробные и анаэробные. Аэробные дегидрогеназы отдают атомы водорода кислороду с образованием перекиси водорода:
ФАДН2 + О2 →ФАД+ Н2О2 Пиридиновые дегидрогеназы, как правило, анаэробные, а флавиновые
бывают и аэробные и анаэробные.Дегидрогеназы бывают первичные и вторичные . Первичные окисляют небелковый субстрат. Вторичные – белковый. Обычно они окислябт другую дегидрогеназу.. Реакция выглядит так: НАДНН++ФАД→ФАДН2+НАД+
б) Цитохромы - это гем, содержащие ферменты, они переносят электроны. Цитохромы участвуют в тканевом дыхании и микросомальном окислении. Они бывают аэробные и анаэробные. В
качестве аэробных цитохромов можно привести пример цитохрома Р450 микросомальной системы гидроксилирования.
в) оксидазы (гидроксилазы)
Пример: реакция окисления дофамина до норадреналина
Пример: :реакция окисления фенилаланина до тирозина
г) Пероксидазы расщепляют перекиси. В качестве примера можно привести:
2Н2О2→2Н2О+ О2 каталаза
RH+ Н2О2→ RОH+ Н2О Пероксидаза
Эти ферменты защищают наш организм от токсичных форм кислорода.
2 класс – трансферазы. Эти ферменты переносят группы с одного субстрата на другой или обмен группами между субстратами. В зависимости от того, какие группы переносят трансферазы их разделяют на подклассы:
а) аминотрансферазы б) ацилтрансферазы, в) метилтранс-феразы,
г) гликозилтрансферазы, д)фосфо-трансферазы (киназы). В качестве примера приведем:
Аминатрансферазу : обмен аминогруппы на кетогруппу (реакция трансаминирования)
Фосфотрансфераза (киназа). Фосфатная группа переносится с АТФ на субстрат.
3 класс – гидролазы. Эти ферменты катализируют реакции гидролиза (распада веществ под действием воды). В зависимости от вида связи гидролазы подразделяются на подклассы.
а) эстеразы –гидролиз сложноэфирных связей б) фосфоэстеразы – гидролиз фосфоэфирных связей в) пептидазы – гидролиз пептидных связей.
г) гликозидазы –гидролиз гликозидных связей между молекулами углеводов. В качестве примера приведем ацетилхолинэстеразу .
гликозидазу (мальтазу)
4 класс –лиазы. Эти ферменты катализируют реакции распада веществ без участия воды). В зависимости от вида связи гидролазы подразделяются на подклассы.
а) С-С лиазы б) С-N лиазы в) C-О лиазы
Фумаратгидротаза
Гистидиндекарбоксилаза
5 класс – изомеразы. Эти ферменты катализируют реакции изомеризации.
Фосфоглицеральдегидизомераза
изомераза глюкоза-6- фосфат
6 класс – синтетазы. Эти ферменты катализируют реакции синтеза веществ с затратой АТФ.
Синтетаза щавелевоуксусной кислоты
Название синтетаз строится так: снтезируемое соединение + синтетаза.
Микросомальная система гидроксилирования
Микросомальная система работает в эндоплазматической сети. Она представляет из себя мультиферментный комплекс в состав, которого входят 3 фермента :
1- флавопротеид,
2- цитохром b5
3- цитохром Р450.
Суммарная реакция окисления может быть записана: RH + НАДФН2+ О2 → ROH + Н2О + НАДФ
Реакция идет в 3 этапа
1.Сначала с НАДФН2 атомы водорода переносятся на флавопротеид.
2.С флавопотеида электроны переносятся на цитохром b5 и далее на цитохром Р450. Атом железа в цитохроме восстанавливается Fe3+→ Fe2+
3.Двухвалентное железо связывает молекулу кислорода. Один атом кислорода встраивается в окисляемую молекулу, а второй взаимодействует с двумя протонами , образуя воду.
НАДФН2 образуется при окислении глюкозы в пентозном цикле и при окислении яблочной кислоты яблочным ферментом.:
яблочная кислота +НАДФ → ПВК +СО2+ НАДФН2 Роль микросомальной системы гидроксилирования:
1. Участвует в синтезе холестерина
2.Участвует в синтезе желчных кислот
3.Участие в синтезе стероидных гормонов
4.Обезвреживание токсинов.
При окислении токсичных гидрофобных веществ встраивается ОН группа. Из-за этого возрастает полярность соединения
увеличивается растворимость в воде
облегчается выведение в мочу и желчь
ухудшается их транспорт в клетку через мембрану
появление ОН группы также позволяет далее обезвреживать токсины путем их взаимодействия с серной или глюкуроновой кислотами
Регуляция активности микросомальной системы окисления
Регуляция активности микросомальной системы осуществляется на уровне транскрипции или посттранскрипционных изменений. Индукция синтеза позволяет увеличить количество ферментов в ответ на поступление или образование в организме веществ, выведение которых невозможно без участия системы микросомального окисления.
В настоящее время описано более 250 химических соединений, вызывающих индукцию микросомальных ферментов. К числу этих индукторов относят барбитураты, полициклические ароматические углеводороды, спирты, кетоны и некоторые стероиды. Несмотря на разнообразие химического строения, все индукторы имеют ряд общих признаков; их относят к числу липофильных соединений, и они служат субстратами для цитохрома Р450. Микросомальное окисление активируется витаминами С и Е.