004 lec bio
.pdfБиосинтез белка: трансляция
продолжение...
1
Белки: строение -- уровни организации
Говоря о строении белка, различают:
первичную структуру -- последовательность аминокислот , прочитываемую, начиная от С-конца молекулы, в направлении к N- концу;
вторичную структуру -- наличие и локализацию альфа-спиральных участков цепи и участков, сложеных в бэта-структуры;
третичную структуру (пространственная структура) -- взаимное расположение аминокислотных остатков молекулы белка в пространстве (мотивы и домены);
четвертичную структуру -- компонентный состав, стехиометрию и взаимную ориентацию субъединиц комплекса (в том случае, когда молекулы белка обладают способностью к его образованию).
2
Белки: строение -- уровни организации
3
Белки: строение -- уровни организации
Согласно современным представлениям первичная структура белковой молекулы в значительной степени определяет то, как сложится полипептидная цепочка в пространственную структуру (ее фолдинг) и, по-видимому, также определяет комплексообразование белковых молекул, т.е. вторичную, третичную и четвертичную структуры белка. Вместе с тем предполагается [Monod et al, 1965], что у многих белков первичная структура определяет не одну, а несколько возможных пространственных структур (конформаций), в каждой из которых с определенной вероятностью может находиться молекула белка.
Пространственная структура белка зависит от физико-химических условий (температура, рН, ионная сила), их изменение может привести к денатурации белка, к изменению его пространственной структуры.
4
Домен
•Домен – это часть полипептидной цепи (или вся цепочка), которая сворачивается независимо в стабильную третичную структуру [C.Brenden & John Tooze]
•Доменами в белках называют области в третичной структуре, которым свойственна определенная автономия структурной организации [Степанов В.М.]
5
Пептидная связь
6
Вращение валентных связей в полипептидной цепи
7
Конформационные карты Рамачандрана
8
Виды взаимодействий
Многие белки, как фибриллярные, так и глобулярные, обладают способностью образовывать прочные комплексы определенной стехиометрии, компоненты которых удерживаются вместе нековалентными связями.
9
Виды взаимодействий
10