005 lec bio
.pdf
Ферменты: АК, определяющие пространственную структуру
R¨ |
C |
H |
|
|
R¨ |
H |
O |
|
|
|
|
|
|
C |
|
H |
|||
|
|
C N |
|
¨ |
|||||
|
O |
|
|
|
C |
|
|
|
|
|
H |
∑ |
C |
O |
C |
N |
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
O |
|
|
|
|
|
|
trans |
|
|
cis |
|
|
|
|
|
|
|
SH |
|
|
|
65 |
|
|
|
HS |
HS |
|
58 |
72 |
40 |
|
||
|
|
|
|
|
|
SH |
SH |
HS |
26 |
|
84 |
|
|
||
|
|
|
95 |
|
HS |
HS |
|
|
110 |
|
|
21
Ферменты: активный центр
Химотрипсин -- ферментный препарат протеолитического действия, получаемый из поджелудочной железы крупного рогатого скота. Гидролизует белки и пептиды, расщепляет связи, образованные остатками ароматических аминокислот (тирозин, триптофан, фенилаланин, метионин) при участии воды.
22
Ферменты: специфичность
Ключ-замок
23
Ферменты: специфичность
Конформационная подвижность активного центра позволяет объяснить природу специфичности ферментов.
Д. Кошланд (1959)
Концепция индуцированного соответствия
При изучении карбоксипептидазы А было показано, что остатки двух аминокислот (тирозина и глутаминовой кислоты) при связывании субстрата перемещаются на 1.5 и 0.2 нм соответственно.
24
Ферменты: механизм катализа
H
O 
O H
R C 
N R'
H
O H
R
C
O
N
R'
H
O H
R
C
O
H
N
R'
H
Ацилирование
25
Ферменты: механизм катализа
H
O 
O H
R C 
O R'
O H
R
C
O
O
R' 
O H R
C
O
O
R'
H
Деацилирование
26
Ферменты: кинетика
Так выглядит обычная
(некатализируемая) реакция
27
Ферменты: кинетика
А вот так – реакция,
катализируемая
ферментом.
28
Ферменты: кинетика
29
Ферменты: кинетика
Модель МихаэлисаМентен
В процессе каталитического действия активный центр фермента Е и субстрат S образуют промежуточный фермент-субстратный комплекс ES, внутримолекулярное превращение которого приводит к образованию продуктов Р с регенерацией активного центра фермента.
30