34. Будова віруса кустистої карликовості томатів

ВККТ вирус содержит 180 субъединиц капсида (3×60), каждая субъединица состоит из 386 аминокислотных остатков. Диаметр вирусной частицы около 330 Å. Три идентичные субъединицы — А, В и С ВККТ, расположенные в асимметричной ячейке, имеют различные контакты. Субъединицы А взаимодействуют друг с другом вокруг осей симметрии 5-го порядка, а В и С сближены вокруг осей симметрии 3-го порядка. 6 субъединиц (3В и 3С) расположены псевдосимметрично вокруг осей симметрии 3-го порядка, которые, следовательно, являются также осями псевдосимметрии 6-го порядка.

Молекулярные переключатели это небольшой сегмент полипептидной цепи, который упорядочен на одних и разупорядочен на сходных поверхностях, что способствует образованию как гексамеров так и пентамеров. Конформация белка зависит от условий сборки капсида, и таких факторов,как ионы металлов, рН, и других, которые изменяют характер взаимодействий белка и, в результате, на основе квазиэквивалентных взаимодействий формируется капсид.

Белок ВККТ имеет сложную доменную структуру Домены Р и S, расположенные на поверхности капсида, соединены гибкой петлей, а внутренний домен R частично разупорядочен. В субъединице С, за счет изменения конформации петли, домены S и P имеют ориентацию, отличную от субъединиц А и В. Кроме того, петля упорядочена в субъединице С, но разупорядочена в А и В. Домены Р контактируют попарно по осям симметрии 2-го порядка и формируют выступы на поверхности капсида. Капсид содержит 30 осей симметрии 2-го порядка, образованных доменами Р субъединиц С и, кроме того, 60 осей симметрии псевдо- 2-го порядка, относящихся к субъединицам А и В. Поэтому 180 доменов субъединиц Р формируют 90 димерных выступов на поверхности капсида.

35. Будова аденовірусу

Аденовирусная частица имеет сложную структуру. Капсид обладает строгой икосаэдрической симметрией. На первый взгляд кажется, что он характеризуется триангуляционным числом Т=25. Однако структуры в «пятикратных» позициях («пентоны») отличаются от остальных («гексонов»), а сами гексоны представляют собой не гексамеры, а тримеры. Таким образом, реальная структура вовсе не соответствует простому икосаэдру, полученному с помощью триангуляций. Всего в аденовирусе 12 пентонов и 240 гексонов.

Очищенный белок гексона удалось получить в кристаллическом виде. По данным рентгеноструктурного анализа, кристаллы белка гексона аденовируса обладают симметрией кубического типа и каждый гексон состоит из трех кристаллографических субъединиц. В вирионе с каждым гексоном связан белок VI. Каждый из двенадцати капсомеров на вершинах икосаэдра с окружающими его пятью соседями называется пептоном. Пентоны состоят из двух полипептидов. Один из них образует основание, а другой— выступающий стержень видный на всех вершинах. На конце нитей имеется утолщение. Изолированные субъединицы основания пентона глобулярны и с торца имеют вид пятиугольников. Основание пентона является тримером.

Обработка пиридином или нагревание при 56 °С обычно приводят к высвобождению групп из девяти гексонов, окружающих единичный пентон на вершине частицы. Изучение электронных микрофотографий девятичленных групп показывает, что они, как и сами гексоны, обладают симметрией 3-го порядка. Группы из девяти гексонов могут образовывать замкнутые структуры, похожие на вирусные капсиды. При продолжительной обработке одним из этих агентов или при обработке 5 М мочевиной, ацетоном, а также при рН 10,5 удаляются все поверхностные капсомеры, оставляя нетронутой вирусную сердцевину, содержащую ДНК и два внутренних белка (V и VII).