Добавил:
ivanov666
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз:
Предмет:
Файл:Компьютерная визуализация нанообъектов. Учебное пособие
.pdf
81
Рис. 32. Пример визуализации фуллерена C60 средствами
Octave/Matlab
Содержание отчета по работе:
- Код программы.
- Визуализация модели фуллерена C60.
- Изменить параметры визуализации: толщина линий связи, размер
сфер в вершине.
- Вывод.
82
Библиографический список
1. Заводинский, В.Г. Компьютерное моделирование наночастиц и
наносистем: учебное пособие для вузов / В.Г. Заводинский– М. :
ФИЗМАТЛИТ, 2013. – 174 с.
2. Аксенова, Е.В. Вычислительные методы исследования
молекулярной динамики: учебно-методическое пособие /
Е.В.Аксенова, М.С.Кшевецкий. – СПб.: СПбГУ, 2009. – 50 с.
3. Жмуров, А.А. Моделирование биологических систем на GPU:
учебное пособие / А.А.Жмуров, В.А.Барсегов. – М.: Изд-во МГУ, 2013.
– 150 с.
4. Аюпов, Р.Х. Основы работы в программе VMD / Р.Х. Аюпов. –
Казань: Казан. ун- т, 2014. – 19 с.
5. Назаренко, Н.В. Компьютерное моделирование атомного каркаса углеродных наноструктур / Н.В. Назаренко, И.Е. Еремин,
А.А. Остапенко // Ученые заметки Тихоокеанского государственного
университета. – 2012. – Т. 3, № 2. – С. 8–16.
6. Мироновский, Л.А. Введение в MATLAB: учебное пособие /
Л.А.Мироновский, К.Ю.Петрова. – СПб. : Изд-во СПбГУАП, 2002 –
122 с.
7. GNU Octave Manual Version 3 / J.W.Eaton, D.Bateman,
S.Hauberg. – Network Theory Limited, 2008. – 568 p.
8. Алексеев, Е. Р. Введение в Octave для инженеров и математи-
ков / Е.Р.Алексеев, О.В.Чеснокова. – М.: ALT Linux, 2012. – 368 с.
83
Содержание
Введение
3
1 Роль компьютерного моделирования в научном знании
4
2 Общие сведения о наночастицах и наносистемах
6
3 Компьютерное моделирование как новый инструмент вычислительной биологии
11
4 Биологические молекулы как объект моделирования
20
5 Программа VMD
45
6 Научная визуализация углеродных наноструктур
48
7 Программный пакет Matlab
51
8 Программный пакет Octave
56
Лабораторная работа № 1. Практика работы с архивом протеиновых структур WWPDB
57
Лабораторная работа № 2. Практика работы с .pdp-моделями
углеродных нанообъектов
60
Лабораторная работа № 3. Визуализация структуры фрагмента
графенового слоя средствами программной среды Matlab/Octave
61
Лабораторная работа № 4. Визуализация структуры фрагмента
углеродной нанопленки средствами программной среды
Matlab/Octave
65
Лабораторная работа № 5. Визуализация структуры фрагмента
углеродной нанотрубки типа «zigzag» средствами программной
среды Matlab/Octave
67
Лабораторная работа № 6. Визуализация структуры фрагмента
углеродной нанотрубки типа «armchair» средствами программной среды Matlab/Octave
70
Лабораторная работа № 7. Визуализация структуры фрагмента
спиральной углеродной нанотрубки типа «zigzag» средствами
программной среды Matlab/Octave
74
Лабораторная работа № 8. Визуализация атомного скелета
фрагмента фуллерена С60 средствами программной среды
Matlab/Octave
77
Библиографический список
82
84
УЧЕБНОЕ ИЗДАНИЕ
Подписано в печать 25.10.2016
Формат 6084 1/16
Бумага офсетная
Печать ризографическая
4,88 усл. печ. л.
5,25 уч.-изд. л.
Тираж 100 экз.
Заказ «С» 219
Издательство Казанского национального исследовательского
технологического университета
Отпечатано в офсетной лаборатории Казанского национального
исследовательского технологического университета
420015, Казань, К. Маркса, 68
Эмиль Фаатович Вознесенский,
Ирина Владимировна Красина
КОМПЬЮТЕРНАЯ ВИЗУАЛИЗАЦИЯ
НАНООБЪЕКТОВ
Ответственный за выпуск проф. Г. Н. Кулевцов
Соседние файлы в предмете [НЕСОРТИРОВАННОЕ]