- •3. Инициация транскрипции у прокариотов.
- •5. Организация промоторов у прокариотов и эукариотов.
- •7. Инициация транскрипции эукариотической РНК-полимеразы II (сборка базальной машины транскрипции).
- •8. Особенности транскрипции эукариотических РНК-полимераз I и III (организация промоторов и сборка базальной машины транскрипции).
- •9. Характеристика функциональных доменов белков, участвующих в регуляции транскрипции. Спираль-поворот-спираль, цинковые пальцы, лейциновая застежка, спираль-петля-спираль.
- •11. Двух- и трехгибридные дрожжевые системы.
- •12. Элонгация транскрипции.
- •13. Терминация транскрипции.
- •15. Кэпирование пре-мРНК.
- •16. Сплайсинг пре-тРНК: канонические и неканонические интроны.
- •1. Канонические интроны
- •2. Неканонические интроны
- •17. Сплайсинг интронов группы I, II, ядерных пре-мРНК. Альтернативный сплайсинг, транс-сплайсинг.
- •18. Полиаденилирование пре-мРНК: цис- и транс-факторы, этапы, функции. Особенности 3’процессинга гистоновых мРНК.
- •19. Примеры регуляции экспрессии генов на уровне транскрипции.
15. Кэпирование пре-мРНК.
Кэпирование пре-мРНК - это первая и обязательная модификация 5'-конца всех транскриптов РНК-полимеразы II, происходящая ко-транскрипционно, сразу после синтеза первых 20-30 нуклеотидов. Этот процесс заключается в добавлении к 5'-концу специальной структуры, называемой кэпом.
Кэп представляет собой обращенный 7-метилгуанозиновый нуклеотид, соединенный с первым нуклеотидом транскрипта через трифосфатный мостик 5'-5'.
Кэпирование происходит в 3 этапа:
1. РНК-трифосфатаза удаляет γ-фосфат с 5’-конца первой рибозы пре-мРНК, оставляя дифосфат p-p-Nuc
2. Гуанилилтрансфераза переносит GMP от GTP на 5'-дифосфатный конец РНК, формируя 5'-5'-трифосфатная связь G-p-p-p-Nuc
3. N -гуанин-метилтрансфераза метилирует азот в 7-м положении гуанина, используя S-аденозилметионин (SAM) в качестве донора метильной группы,
формируя m G-p-p-p-Nuc.
Существуют разные виды кэпа. Выше описан базовый Кэп0.
Кэп1: На первом нуклеотиде транскрипта (N) происходит 2'-O-метилирование рибозы m G-p-p-p-Nucᵐ.
Кэп2: Метилирование 2'-O-рибозы второго нуклеотида транскрипта m G-p-p-p-Nucᵐp-Nucᵐ.
Координация с транскрипцией: Комплекс кэпирующих ферментов связывается с CTD РНК-полимеразы II, фосфорилированным по 5-му серину (Ser5-P), что обеспечивает его доставку к только что синтезированному 5'-концу транскрипта.
Функции: Регуляция экспорта из ядра; Защита мРНК от экзонуклеазной деградации; Содействие трансляции; Способствование 5’-проксимальному вырезанию интрона.
