Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

6 курс / Клинические и лабораторные анализы / Лабораторная_диагностика_туберкулеза_Ерохин_В_В_ред_

.pdf
Скачиваний:
20
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
6.25 Mб
Скачать

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Архитектурно – планировочные решения и размещение оборудования должны обеспечивать поточность движения исследуемого материала.

Зонирование рабочих помещений

Лаборатория в соответствии с этапами проведения анализа должна включать следующий минимальный набор последовательно расположенных самостоятельных рабочих зон (помещений) или отдельно выделенных рабочих зон в составе других функциональных помещений, количество которых определяется используемыми методами:

Рабочие зоны

Приема, регистрации, разбора материала (Рабочая зона 1): прием материала, маркировка, регистрация.

Первичной обработки материала, выделение ДНК\РНК (Рабочая зона 2): первичная подготовка (концентрирование материала), объединение или разделение проб на аликвоты, обеззараживание и хранение проб, обеззараживание остатков исследуемого материала, выделение и очистка нуклеиновых кислот микобактерий.

Приготовления реакционных смесей (Рабочая зона 3): приготовление реакционных смесей, для амплификации нуклеиновых кислот. Рекомендуется разделять Рабочую зону 3 на две подзоны (3а и 3б) и разместить их в отдельных помещениях.

o Приготовление реакционных смесей (Рабочая зона 3а): приготовление реакционных смесей, с нуклеиновыми кислотами из проб, подготовленных в Рабочей зоне 2.

o Проведение реакции амплификации и учет ее результатов (Рабочая зона 3б): при использовании гибридизационофлюоресцентного метода детекции

Учета результатов реакции амплификации нуклеиновых кислот методом электрофореза и (или) гибридизационно-ферментным методом детекции (Рабочая зона 4).

Учета результатов амплификации нуклеиновых кислот методом гибридизации на ДНК-стрипах или на ДНК-чипах (Рабочая

зона 4а).

Рабочие зоны 4 и 4а располагают изолировано от Рабочих зон 1–3 для предотвращения их контаминации продуктами амплификации через воздушный поток. Объединение Рабочих зон 4 и 4а за-

прещено.

418

Вспомогательные помещения

В состав лаборатории должны быть включены вспомогательные помещения (комнаты персонала, кабинет заведующего лабораторией, раздевалки для сотрудников, комната приема пищи, туалет, подсобные (складские) помещения), которые должны быть вынесены за пределы рабочей зоны.

Вспомогательные помещения должны располагаться отдельно от рабочих зон (помещений) в соответствии с действующими санитарными правилами, регламентирующими обеспечение безопасности работ с микроорганизмами III–IV группы патогенности.

Необходимо предусмотреть наличие автоклавной комнаты для обеззараживания исследуемого материала, которая может быть общей с другими подразделениями учреждения при условии соблюдения требований биологической безопасности.

Оснащение рабочих помещений

Вентиляция помещений

Помещения лаборатории оборудуют приточно-вытяжной вентиляцией в соответствии с СП 1.3.2322-08.

ВРабочей зоне 3 объем приточного воздуха должен соответствовать объему на вытяжке.

ВРабочих зонах 1 и 2 вытяжка должна преобладать над прито-

ком.

Рабочие зоны 4 и 4а рекомендуется оборудовать автономной системой приточно-вытяжной вентиляции. Вытяжка должна преобладать над притоком.

При разделении зоны 3 на подзоны 3а и 3б, приточно-вытяж- ная вентиляция в них должна быть выполнена раздельно для подзоны 3а и для подзоны 3б.

Вусловиях жаркого климата разрешается установка кондиционеров в помещениях рабочих зон лаборатории, при условии их выключения на время проведения работ, с последующей дезинфекционной обработкой рабочего места.

Лабораторное оборудование, мебель

Каждая самостоятельная рабочая зона должна быть оснащена минимальным набором соответствующего лабораторного оборудования в зависимости от их функционального назначения и риска контаминации, необходимым комплектом мебели, пластиковой и стеклянной посуды, расходных материалов, защитной одежды и

Раздел 2. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ

419

 

уборочного инвентаря, используемых только в данном помеще-

 

 

нии.

 

 

Необходимый комплект лабораторного оборудования опреде-

 

ляют с учетом используемых молекулярно-генетических методов.

 

 

Лабораторная мебель, оборудование и принадлежности каждой

 

рабочей зоны должны иметь маркировку указанной зоны (поме-

 

щения), их применение в других рабочих зонах (помещениях) или

 

для других видов исследований не допускается.

 

 

Лабораторная мебель, поверхность используемого оборудова-

 

ния должны быть устойчивы к действию моющих и дезинфици-

 

рующих средств, ультрафиолетового излучения, поверхность сто-

 

лов не должна иметь трещин и швов.

 

 

Оборудование и измерительные приборы, используемые в ра-

 

боте лаборатории, должны быть зарегистрированы в установлен-

 

ном порядке и исправны, иметь технический паспорт и рабочую

 

инструкцию по эксплуатации, соответствовать нормам безопасно-

 

сти и электромагнитной совместимости. Не реже 1 раза в год из-

 

мерительные приборы должны подвергаться метрологическому

 

контролю (поверке).

 

 

Лаборатория должна быть обеспечена аптечкой стандартной

 

комплектации для оказания первой медицинской помощи при

 

авариях в соответствии с действующими санитарными правилами,

 

регламентирующими безопасность работ с микроорганизмами I–

 

IV групп патогенности.

 

 

Базовое оборудование

 

 

Рабочая зона 2 – первичной обработки материала, выделения

 

ДНК\РНК

 

1.

Бокс II класса биологической безопасности.

 

2.

Центрифуга для пробирок объемом 50 мл (до 3 000 g).

 

3.

Микроцентрифуга/вортек с.

РЕКОМЕНДАЦИИ

4.

Настольная центрифуга для микропробирок типа «Эппендорф»

7.

Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема

 

 

объемом 1,5 мл (до 10 000 g).

 

5.

Твердотельный термостат для пробирок объемом 1,5–2 мл с

 

 

диапазоном рабочих температур 25–100°С.

МЕТОДИЧЕСКИЕ

6.

Вакуумный насос медицинский с колбой-ловушкой.

 

100–200 мкл, 200–1000 мкл.

 

 

 

8.

Штативы для пипеток, наконечников, микропробирок.

 

9.

Комбинированный холодильник с камерами, поддерживаю-

 

 

щими температуру от 2 до 8°С и не выше минус 16°С (для хра-

 

 

нения исследуемого материала).

 

 

 

 

420

10.Морозильная камера на минус 70°С (при необходимости, в случае длительного хранения диагностического материала).

11.Емкость для дезинфицирующего раствора.

12.При исследовании материала, подозрительного на зараженность возбудителями III–IV групп патогенности, допускается использование автоматизированного оборудования для выделения нуклеиновых кислот.

Рабочая зона 3 – приготовление реакционной смеси

1.Бокс биологической безопасности I класса.

2.Микроцентрифуга/вортек с.

3.Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема

– 10–100 мкл, 100–200 мкл, 200–1000 мкл.

4.Штативы для пипеток, наконечников, микропробирок.

5.Комбинированный холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°С и минус 20°С (для хранения реагентов).

Рабочая зона 3а – приготовление реакционной смеси

1. Бокс биологической безопасности I класса.

2. Микроцентрифуга/вортекс.3. Отдельный набор автоматических пипеток

переменного объема – 10–100 мкл, 100–200 мкл, 200–1000 мкл.

4.Штативы для пипеток, наконечников, микропробирок.

5.Комбинированный холодильник с камерами, поддерживающими температуру от 2 до 8°С и минус 20°С (для хранения реагентов).

Рабочая зона 3б – проведение реакции амплификации и учета

ее результатов при использовании гибридизационно – флюоресцентного метода детекции. В данной зоне возможна регистрация результатов, выписка ответов на бланке, ведение общелабораторной базы данных при условии сетевого подключения компьютера

1.Программируемые термоциклеры (персональные, многомодульные, с функцией амплификации в режиме «реального времени») и автоматизированные станции. Выбор термоциклера или автоматизированной станции определяется методами амплификации нуклеиновых кислот и коммерческими наборами реагентов, используемыми в лаборатории, характером выполняемых задач и финансовыми возможностями.

2.Флюориметр (флюоресцентный детектор), только при учете продуктов амплификации гибридизационно – флюоресцентным методом детекции по конечной точке.

Раздел 2. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ

421

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

3.Компьютеры к соответствующим приборам программным обеспечением, антивирусной программой, принтер, источник бесперебойного питания.

Рабочие зоны 4 и 4а – анализ продуктов амплификации

1.Гибридизационная печь.

2.Прибор для гибридизации на стриповых мембранах.

3.Прибор для анализа ДНК-чипов.

4.Автоматические приборы для гибридизации

6.Компьютеры с соответствующим приборам программным обеспечением, антивирусной программой, принтером. Источник бесперебойного питания должен быть связан через компьютерную сеть с компьютером, располагающимся в чистой зоне и предназначенным для анализа результатов.

7.Камера для горизонтального электрофореза.

8.Источник постоянного тока с напряжением 150–460 В.

9.Ультрафиолетовый трансиллюминатор с кабинетом для просмотра гелей.

10.Видеосистема с цифровой видеокамерой для регистрации результатов.

11.Микроволновая печь или другой нагревательный прибор для плавления агарозы.

12.Отдельный набор автоматических пипеток переменного объема

– 10–100 мкл, 100–200 мкл, 200–1000 мкл. 13.Штативы для пипеток, наконечников, микропробирок.

14.Колба коническая из термостойкого стекла для плавления агарозы.

15.Мерные цилиндры объемом 100 мл и 1000 мл. 16.Столик и набор гребенок для приготовления геля. 17.Емкость для сбора отработанных расходных материалов.

18.Холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 до 8°С (для хранения наборов реагентов).

Расходные материалы

1.Наборы реагентов для выделения ДНК/РНК.

2.Наборы реагентов для амплификации ДНК/РНК.

3.Одноразовые наконечники для пипеток переменного объема с фильтром до 200 и до 1000 мкл.

4.Микропробирки – 0,2 мкл, 0,6 мкл, 1,5 мкл (в зависимости от формата используемого метода, пробирки могут быть тонкостенные, толстостенные, с плоскими или выпуклыми крышками, для ПЦР-РВ требуется оптически-прозрачные пробирки).

422

5.При использовании автоматизированного оборудования для выделения нуклеиновых кислот требуется адаптированный набор для выделения ДНК и набор одноразовых пробирок и наконечников, используемый автоматом для выделения.

6.Автоклавируемые пакеты для сбора инфицированного материала, одноразового пластика и проб ДНК/РНК.

7.Дезактивирующие растворы.

8.Дезинфицирующие растворы.

9.Респираторы 3М.

10.Неопудренные латексные перчатки. 11.Одноразовые халаты, шапочки, бахилы

Рекомендуемая литература

 

1.

Методические указания (МУ 1.3.1888-04) «Организация работы

 

 

при исследованиях методом ПЦР материала, инфицированного

 

 

патогенными биологическими агентами III–IV групп патоген-

 

 

ности».

 

2.

Методические указания (МУ 3.5.5.1034-01) «Обеззараживание

 

 

исследуемого материала, инфицированного бактериями I–IV

 

 

групп патогенности, при работе методом ПЦР» – М., 2001.

 

3.

Организация работы лабораторий, использующих методы ам-

 

 

плификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, со-

 

 

держащим микроорганизмы I–IV групп патогенности. МУ 1.3.

 

 

2569-09 Москва, 2009

 

4.

ПРИКАЗ МЗ РФ от 07.02.2000 №45 "О системе мер по повыше-

СЕМИНАРАМ

 

нию качества клинических лабораторных исследований в уч-

 

 

 

реждениях здравоохранения Российской Федерации".

 

5.

Приказ МЗ РФ от 21.03.03 № 109 «О совершенствовании про-

 

 

тивотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации»

К

6.

Руководство "Использование ультрафиолетового бактерицид-

МАТЕРИАЛЫ

 

ного излучения для обеззараживания воздуха в помещениях" Р

 

 

 

3.5.1904-04. – М.: 2005.

 

7.

Санитарно-эпидемиологические правила "Безопасность работы

 

 

с микроорганизмами III–IV групп патогенности (опасности) и

МЕТОДИЧЕСКИЕ

 

возбудителями паразитарных болезней" СП 1.3.2322-08, Феде-

 

 

 

ральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей

 

 

и благополучия человека, 2008.

 

8.

Санитарно-эпидемиологические правила "Порядок выдачи са-

 

 

нитарно-эпидемиологического заключения о возможности

2.

 

проведения работ с возбудителями инфекционных заболеваний

 

Раздел

 

человека I–IV групп патогенности (опасности), генно-инже-

 

 

423

нерно-модифицированными микроорганизмами, ядами биологического происхождения и гельминтами" СП 1.2.1318-03, Минздрав России, 2003.

9.Санитарно-эпидемиологические правила и нормативы СанПиН 2.1.7.2790-10 «Санитарно-эпидемиологические требования к обращению с медицинскими отходами». – М., 2010.

10.Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.1295-03 «Профилактика туберкулеза от 25.06.2003 г.

11.Санитарные правила и нормы "Правила сбора, хранения и удаления отходов лечебно-профилактических учреждений" СанПиН 2.1.7.728-99, Минздрав России, 1999.

12.Черноусова Л.Н. Алгоритм микробиологических исследований для диагностики туберкулезной инфекции. Методическое пособие для врачей (сокращенный вариант) // Туберкулез и болезни легких. Нью-терра. – 2011. – №11. – С. 58–67

13.Черноусова Л.Н., Севастьянова Э.В., Андреевская С.Н., Ларионова Е.Е., Смирнова Т.Г. Алгоритм микробиологических исследований для диагностики туберкулезной инфекции. Методическое пособие для врачей №УМО-17-28/248 от 12.07.2011 М. – 2011. – С. 52.

14.Шухов B.C., Рюмина И.И. Безопасность на рабочих местах в лечебно-профилактических учреждениях/Профилактика риска профессионального инфицирования вирусами гепатитов В, С, ВИЧ // Пособие для медицинских работников. – М., 2008. – 79 с.

Материально-техническое обеспечение

Флип-чарт, маркеры, фломастеры, лазерная указка, мультимедийное оборудование, экран.

МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

424

Тема 12.3. «Меры по предотвращению контаминации в лаборатории, использующей молекулярно-генетические методы»

Количество аудиторных часов – 1

Примерный план семинарского занятия

Вопросы, прорабатываемые на семинаре:

Соблюдения поточности движения биоматериала

Деконтаминационная обработка оборудования и помещений Цель семинара – ознакомление слушателей с мероприятиями

по предотвращению контаминации в лаборатории молекулярногенетических методов исследования.

Семинар проводится в интерактивной форме. При обсуждении темы семинара ведущий и слушатели используют материалы методических указаний и санитарно-эпидемических правил, регламентирующих молекулярно-генетические исследования и работу с патогенами III–IV группы.

Вводная часть (5–10 мин)

Ведущий семинара обсуждает со слушателями рабочий план и с учетом самоподготовки определяет тему дискуссии. Правила предотвращения контаминации, которые регламентируются санитарными правилами «Безопасность работы с микроорганизмами III–IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней» СП 1.3.2322-08, методическими указаниями «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I–IV групп патогенности» МУ 1.3. 2569-09.

исанитарно-эпидемиологическими правилами «Порядок учета, хранения, передачи и транспортирования микроорганизмов I–IV групп патогенности» СП 1.2.036-95, Госкомсанэпиднадзор России, 1995. Рекомендуется также углубить представление об "инфекционном контроле", "санитарно-противоэпидемическом режиме",

и"стандартных универсальных мерах предосторожности".

Основная часть (30 мин)

Работа начинается с выбора основной темы дискуссии. В ходе дискуссии на выбранную тему ведущий делает необходимые пояснения и добавления. Например, фиксирует внимание слушателей на такие понятия, как «аварийная ситуация» и «риск контаминации»; детально разбирает характеристику рисков профессионального заражения туберкулезом медицинских работ-

Раздел 2. МЕТОДИЧЕСКИЕ МАТЕРИАЛЫ К СЕМИНАРАМ

425

 

ников, факторы, повышающие риск контаминации при работе с

 

 

пробами.

 

Заключительная часть

 

В заключение семинара подчеркивается, что основным прин-

 

ципом при работе методами молекулярной диагностики, плано-

 

мерное соблюдение норм и правил безопасной работы с микобак-

 

териями.

 

Краткий информационный материал к семинару модуля 12.

 

«Организация лаборатории молекулярно-генетических методов

 

исследования» по теме 12.3. «Меры по предотвращению

 

контаминации в лаборатории, использующей молекулярно-

 

генетические методы».

 

Контаминация – (contaminatio; лат. смешение) попадание в

 

определенную среду какой-либо примеси (другого вида или штамма

 

микроорганизмов, ДНК и проч.), изменяющей изучаемые или исполь-

 

зуемые свойства этой среды.

 

Контаминация при проведении молекулярно-генетических ис-

 

следований является причиной ложно-положительных результа-

 

тов. Причины: перенос через предметы и реагенты как самой

 

ДНК-матрицы (реже), так и ампликонов (очень часто), получае-

 

мых в больших количествах во многих пробирках в течение еже-

 

дневной работы.

 

Требования к проведению работ

 

• Не допускается проведение работ, связанных с использованием

 

методов амплификации нуклеиновых кислот в помещениях, где

 

осуществляются культуральные работы по накоплению био-

 

массы биологических агентов III–IV групп патогенности и

 

генно-инженерные работы, в том числе, получение (клониро-

 

вание) и выделение рекомбинантных генетических конструк-

РЕКОМЕНДАЦИИ

ций.

подготовку на лицензированных курсах первичной специали-

 

• Исследование материала, содержащего (подозрительного на со-

 

держание) микроорганизмы III–IV групп патогенности, осу-

 

ществляют специалисты с высшим или средним медицинским

 

или биологическим (ветеринарным) образованием, прошедшие

МЕТОДИЧЕСКИЕ

зации по работе с микроорганизмами III–IV групп патогенно-

сти, получившие дополнительное специальное образование на

 

 

курсах повышения квалификации по молекулярно-биологиче-

 

ским методам диагностики.

 

 

 

426

Допуск персонала к работе в лаборатории осуществляется в порядке, регламентированном действующими санитарными правилами проведения работ с микроорганизмами III–IV групп патогенности.

Выполнение работ в Рабочих зонах 4 и 4а должно осуществляться отдельным персоналом, не задействованным на других этапах проведения анализа.

При проведении исследований с использованием методов амплификации нуклеиновых кислот неукоснительно соблюдают этапы проведения последовательной обработки материала и проб.

Дополнительные требования при проведении работ с

 

возбудителями туберкулеза

 

Работа с возбудителями туберкулеза и материалом, подозри-

 

тельным на инфицированность возбудителем туберкулеза, осуществ-

 

ляется в соответствии с Приложениями 1.9. – 1.11. к Приказу Минзд-

 

рава России от 21.03.2003 № 109 "О совершенствовании

 

противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации"

 

(не нуждается в госрегистрации Министерством юстиции Российской

 

Федерации. Письмо Минюста Российской Федерации от 06.05.2003

 

N 07/4535-Юд).

 

При проведении исследований с использованием методов

 

амплификации нуклеиновых кислот неукоснительно соблюдают

 

следующие правила работы:

СЕМИНАРАМ

в Рабочую зону 2 осуществляют согласно инструктивно-мето-

• Обеспечение поточности движения исследуемого материала,

 

проб нуклеиновых кислот, продуктов амплификации.

 

• Регистрацию материала, хранение, и передачу на исследование

 

дическим документам, регламентирующих выполнение иссле-

К

МАТЕРИАЛЫ

дований для каждого вида возбудителя инфекций, инструкциям

 

к наборам реагентов и в соответствии с СП 1.3.2322-08.

 

• Передачу материала в Рабочую зону 1 и проб при смежном рас-

 

положении помещений Рабочих зон 1, 2, 3 (3а и 3б) – жела-

МЕТОДИЧЕСКИЕ

тельно осуществлять через шлюзовые передаточные окна, а в

 

Рабочие зоны 4 и 4а – через передаточные окна.

 

• Перенос проб из одной рабочей зоны в другую, а также их хра-

 

нение в данных помещениях рекомендуется осуществлять в

 

плотно закрывающихся металлических (с возможностью

2.

опломбирования) или пластмассовых контейнерах (штативах),

Раздел

 

427